数据集概述
本数据集为兰花蜂（Eulaema meriana和Eulaema bombiformis物种复合体）的系统发育基因组学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）和线粒体DNA（mtDNA）的测序数据、系统发育分析配置文件及结果文件，用于验证颜色表型是否对应独立进化支系，共20个文件。
文件详解
- 系统发育分析配置文件
- 文件名称：eulaema-starbeast-50L-config.xml、eulaema-beast-500L-config.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：包含StarBEAST和BEAST软件的分析参数配置，用于指导系统发育树构建的计算流程
- 序列比对与数据集文件
- 文件名称：eulaema-iqtree-100complete-charsets.nex、eulaema-beast-500L-dataset.nex、Eulaema_mtDNA_alignment.nex、eulaema-100complete-alignment.nexus等
- 文件格式：NEX、NEXUS、PHYLIP-relaxed、FASTA
- 字段映射介绍：包含UCEs和mtDNA的序列比对数据，按不同完整性（75%、90%、100%）划分的字符集及数据集，用于系统发育分析
- 系统发育树结果文件
- 文件名称：eulaema-iqtree-75-complete.treefile、Eulaema_mtDNA_treefile.tre、eulaema-beast-500L-starting-tree.tre等
- 文件格式：TRE、TREEFILE
- 字段映射介绍：包含IQ-TREE和BEAST分析生成的系统发育树，记录物种或种群的进化关系
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：数据集说明文档，概述研究背景、数据内容及文件用途
数据来源
论文“Phylogenomics reveals within species diversification but incongruence with color phenotypes in widespread orchid bees (Hymenoptera: Apidae: Euglossini)”
适用场景
- 昆虫分类学研究：用于验证兰花蜂颜色表型作为分类特征的有效性，修正传统分类单元划分
- 进化生物学分析：通过系统发育树探究兰花蜂物种内的遗传分化与地理分布的关联
- 生物多样性保护：识别兰花蜂的进化单元（如亚种），为针对性保护策略提供依据
- 基因组学方法应用：测试超保守元件（UCEs）在昆虫系统发育研究中的适用性
