数据集概述
本数据集为苦苣苔科（Gesneriaceae）核基因靶向捕获的系统基因组学研究数据，包含针对该科设计的830个单拷贝基因捕获探针、参考序列、系统发育树及补充表格等7个文件，用于解析苦苣苔科的系统发育关系，支持不同分类水平的进化研究。
文件详解
- 描述文件
- 文件名称：DESCRIPTION.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含的核心文件内容，如基因树、参考序列、捕获探针等
- 补充表格
- 文件名称：Supplementary_Table_S1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：系统基因组学研究相关的补充数据表格
- 捕获探针序列
- 文件名称：Gesneriaceae_830_baits.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：针对苦苣苔科设计的830个单拷贝基因靶向捕获探针序列
- 参考序列
- 文件名称：Gesneriaceae_830_reference_sequences.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：苦苣苔科830个目标基因的参考序列
- 系统发育树（合并方法）
- 文件名称：Tree_coalescent_ASTRAL.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于合并方法（ASTRAL）构建的苦苣苔科系统发育树
- 系统发育树（超级矩阵方法）
- 文件名称：Tree_supermatrix_RAxML.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于超级矩阵方法（RAxML）构建的苦苣苔科系统发育树
- 基因树压缩包
- 文件名称：gene_trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含每个基因用于系统发育分析的最大似然（ML）树的压缩文件
适用场景
- 植物系统发育研究：解析苦苣苔科及唇形目其他科的系统发育关系，支持主要支系及近期辐射类群的高分辨率分析
- 植物进化生物学研究：探究苦苣苔科适应不同环境和传粉者的进化历史及多样化驱动因素
- 植物分子资源开发：基于830个单拷贝基因捕获探针，开展苦苣苔科不同分类水平的靶向测序研究
- 植物分类学研究：为苦苣苔科的分类修订提供基因组水平的系统发育证据
