数据集概述
本数据集包含恶性疟原虫氯喹耐药转运蛋白(PfCRT)的三种构象模型(开放至液泡、封闭、开放至胞质)、分子动力学模拟起始系统文件及模拟原始数据,支持疟原虫耐药机制相关的结构生物学研究。
文件详解
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据集的核心说明,包括PfCRT构象类型、模拟系统内容及相关论文引用信息
- 文件名称:system_open-vacuole.pdb
- 文件格式:PDB
- 字段映射介绍:开放至液泡构象的PfCRT分子动力学模拟起始系统文件,包含蛋白结构坐标信息
- 文件名称:system_occluded.pdb
- 文件格式:PDB
- 字段映射介绍:封闭构象的PfCRT分子动力学模拟起始系统文件,包含蛋白结构坐标信息
- 文件名称:system_open-cytosol.pdb
- 文件格式:PDB
- 字段映射介绍:开放至胞质构象的PfCRT分子动力学模拟起始系统文件,包含蛋白结构坐标信息
- 文件名称:PfCRT.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含分子动力学模拟的原始数据
数据来源
论文“pH-dependence of the Plasmodium falciparum chloroquine resistance transporter is linked to the transport cycle”
适用场景
- 疟原虫耐药机制研究:分析PfCRT不同构象与氯喹耐药性的结构关联
- 分子动力学模拟系统构建:基于三种构象模型开展疟原虫转运蛋白的动态模拟实验
- 蛋白结构功能分析:探究PfCRT构象变化对底物转运的影响机制
- 抗疟药物研发:为靶向PfCRT的新型抗疟药物设计提供结构生物学数据支持