数据集概述
本数据集为Bigey等2020年发表的酿酒酵母驯化轨迹与面包制作过程关联研究的支持数据,包含实验数据与分析代码共21个文件,涉及酿酒酵母菌株的表型、基因型、发酵实验等信息,用于验证酿酒酵母两种主要驯化轨迹的研究结论。
文件详解
- 数据文件
- 表格类文件(.xlsx/.xls/.csv/.tsv/.raw)
- 示例文件:2018-10-17 Levain 4n vs 2n Bloc1.csv、data_stephane_2N&4N_24aout.xlsx、liste_Bakery_Fred_10Octobre2017.csv、Bakery.SNP.BIALLELIC.mind-0.5.geno-0.1.maf-0.03.ld-0.5.raw
- 字段示例:发酵实验数据含code fermentation(发酵编号)、cumulCO2(CO2累积量)、debitCO2(CO2速率)等;菌株信息含Sample ID(样本ID)、Strain name(菌株名)、Geographical Origin(地理来源)等;基因型数据含微卫星、SNP等分子标记信息
- 代码文件(.R/.Rmd)
- 示例文件:script_phenotype_cerevisiae_convergence_v2.R、Bakery_2N+4N_Microsat_Data_Analysis-mai_2019.Rmd
- 功能:用于酿酒酵母表型收敛分析、微卫星数据处理、发酵实验结果统计等
数据来源
论文"Evidence for two main domestication trajectories in Saccharomyces cerevisiae linked to distinct bread-making processes"
适用场景
- 微生物驯化研究:分析酿酒酵母与面包制作过程关联的驯化轨迹差异
- 发酵工程应用:探究不同倍性酿酒酵母的发酵性能(如CO2产生速率)特征
- 微生物遗传学研究:利用基因型数据解析酿酒酵母种群结构与进化关系
- 食品微生物学应用:为面包酵母菌株的筛选与改良提供数据支持