数据集概述
该数据集为期刊文章配套的分子动力学模拟数据，围绕SARS-CoV-2 Mpro下一代抑制剂研究，包含初始坐标与最终输出的PDB文件及模拟输入压缩包，支持相关药物机制分析。
文件详解
- PDB格式文件（共48个）：
- 初始坐标文件：如mpro-FD3-32_initial_coordinate.pdb、mpro-Apo_initial_coordinate.pdb等，存储模拟初始阶段的分子坐标信息
- 最终输出文件：如mpro-FD6-69_finaloutput_replicate3.pdb、mpro-substrate_finaloutput_replicate3.pdb等，记录模拟结束后的分子结构数据
- ZIP格式压缩包（共3个）：
- MD-input-files_for_FD6-simulation.zip、MD-input-files_for_FD3-simulation.zip、MD-input-files_for_substrate-simulation.zip，为不同模拟场景的输入文件归档
适用场景
- 药物化学研究：分析SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的分子动力学行为
- 抗病毒药物开发：探究下一代抑制剂克服Paxlovid缺陷的结构机制
- 分子模拟方法验证：作为基准数据测试相关计算模型的可靠性
- 生物信息学分析：结合结构数据挖掘抑制剂与靶点的相互作用规律
