UCE_Based_新热带界雨林鸟类超保守元件基因测序研究数据

数据集概述

本数据集为浅进化时间尺度比较研究的超保守元件(UCEs)目标捕获与大规模平行测序数据,包含5种新热带界雨林鸟类的776-1516个UCE位点,53-77%位点具多态性,平均每个多态位点含2.0-3.2个可变位点,可用于物种树构建、溯祖建模及物种界定等分析。

文件详解

  • 主数据压缩包
  • 文件名称:full.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含研究核心数据的压缩文件,具体内容未提供预览
  • 补充方法文档
  • 文件名称:Supp Methods.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:记录研究方法细节的文档
  • 补充表格文档
  • 文件名称:Supplementary Tables.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:包含研究相关补充表格的文档
  • 补充图表压缩包
  • 文件名称:Supplemental Figures.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含补充图表的压缩文件
  • GPhoCS输出补充数据
  • 文件名称:Supplemental-data- GPhoCS-output.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:GPhoCS分析输出的补充数据表格
  • 直系同源基因压缩包
  • 文件名称:orthologs.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含直系同源基因数据的压缩文件
  • 种间简化数据压缩包
  • 文件名称:interspecies_reduced.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:种间分析用简化数据的压缩文件
  • 种间完整数据压缩包
  • 文件名称:interspecies_full.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:种间分析用完整数据的压缩文件
  • 线粒体DNA与UCE分类单元序列文件
  • 文件名称:mtDNA_UCE_taxa.fas
  • 文件格式:FAS
  • 字段映射介绍:包含线粒体DNA与UCE分类单元序列的FASTA文件

适用场景

  • 生物进化研究: 用于浅进化时间尺度下物种系统发育关系构建与物种界定分析
  • 遗传多样性分析: 研究非模式生物的基因多态性及遗传变异特征
  • 分子生态学研究: 分析不同生境(如雨林冠层与林下)鸟类的种群遗传结构与分化历史
  • 比较基因组学研究: 评估超保守元件作为遗传标记在跨物种比较研究中的有效性
  • 种群动态建模: 利用溯祖模型分析物种的分化时间与有效种群大小等参数
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 16.25 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。