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UCE_Based甲虫超保守元件探针集设计比较研究数据
2026年1月30日 30 13 6
数据集概述 本数据集为论文“To design, or not to design? Comparison of beetle ultraconserved element probe set utility based on phylogenetic distance, breadth, and method of probe...
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UCE_Based_超保守元件目标捕获与测序比较研究数据
2026年1月30日 30 37 19
数据集概述 本数据集为超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序研究相关数据，包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据，涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容，共8个文件，支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。 文件详解 压缩文件（archive_files）...
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UNJA_Based_中美洲云林单色蓝鸦物种分化研究数据
2026年1月30日 30 35 10
数据集概述 本数据集是论文“Cloudy with a chance of speciation: integrative taxonomy reveals extraordinary divergence within a Mesoamerican cloud forest bird”的配套数据，聚焦中美洲云林鸟类单色蓝鸦（Aphelocoma...
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SqCL_保守位点_鳞目爬行动物_系统发生学_群体遗传学
2026年1月30日 30 43 2
数据集概述 本数据集为爬行动物保守基因座（SqCL）相关数据，整合UCE、AHE及传统系统发育基因座生成统一探针集，包含44种爬行动物的测序数据，覆盖约33%陆生脊椎动物多样性，可用于系统发育组学和群体遗传学研究，验证基因座效用并比较不同基因座集的实用性。 文件详解 PRG.zip 文件格式：ZIP 内容说明：可能包含探针集相关的程序或参考基因组文件...
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UCE_Based_新热带界雨林鸟类超保守元件基因测序研究数据
2026年1月29日 30 79 61
数据集概述 本数据集为浅进化时间尺度比较研究的超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序数据，包含5种新热带界雨林鸟类的776-1516个UCE位点，53-77%位点具多态性，平均每个多态位点含2.0-3.2个可变位点，可用于物种树构建、溯祖建模及物种界定等分析。 文件详解 主数据压缩包 文件名称：full.zip 文件格式：ZIP...
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Ant_Agriculture_Based_蚂蚁农业进化与真菌驯化研究数据
2026年1月21日 30 66 24
数据集概述 本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开，包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史，探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程，共包含八个文件，以压缩包为主。 文件详解 生物地理与性状多样化文件（biogeo-trait-diversification-files.zip） 文件格式：ZIP...
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Kalotermitidae_Based_木白蚁跨洋分布分子系统发育研究数据
2026年1月20日 30 8 5
数据集概述 本数据集为木白蚁（Kalotermitidae科）分子系统发育研究的支撑数据，包含约120种木白蚁的线粒体基因组及28种白蚁（含18种木白蚁）的核超保守元件（UCE）序列。数据用于构建时间校准的系统发育树，探究木白蚁全球分布的形成机制（如跨洋扩散、人类介导扩散）及觅食能力的演化历史，为木白蚁分类修订和比较分析提供基础。 文件详解...
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Sulawesi_Based_苏拉威西特有松鼠进化史研究数据_博物馆标本测序
2026年1月20日 30 202 137
数据集概述 本数据集为基于博物馆标本测序的苏拉威西特有松鼠进化史研究数据，包含全线粒体基因组和核超保守元件（UCEs）数据，用于构建系统发育树，探究其适应辐射历史、类群分化时间及核质基因树冲突机制，共含9个文件。 文件详解 信息统计文件 文件名称：FcC_info.xls 文件格式：XLS 字段映射介绍：推测包含测序样本信息、基因位点统计等基础数据...
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Epinecrophylla_Based_新热带区枯叶觅食蚁鹩系统发育研究数据
2026年1月19日 30 27 15
数据集概述 本数据集为新热带区枯叶觅食蚁鹩（Epinecrophylla属）的系统发育研究数据，基于超保守元件（UCEs）大规模平行测序，包含该属8个物种的亚种级系统发育树、种群遗传分析及修订分类相关的原始与处理数据，共8个文件，支持鸟类分类学与生物地理学研究。 文件详解 核心分析文件 文件名称：UCE_gene_trees-RAxML.tre...
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Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据
2026年1月19日 30 36 34
数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据，包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件（UCE）基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件，支持趋同演化假说，共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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Accipiter_Hawks_Based加勒比岛屿特有鹰类进化与保护研究数据
2026年1月19日 30 191 58
数据集概述 本数据集聚焦加勒比岛屿特有Accipiter鹰类的系统进化与保护研究，包含38个样本的超保守元件（UCEs）、线粒体基因组序列及单核苷酸多态性（SNPs）相关分析文件，用于探究加勒比种群与大陆种群的亲缘关系、遗传分化及物种界定，支持该类群的保护评估。 文件详解 序列与比对文件 文件名称：Catanachetal2021_UCE.fasta...
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Arachnida_UCE_Based_蛛形纲超保守元件探针集系统发育分析数据
2026年1月19日 30 69 9
数据集概述 本数据集包含用于蛛形纲系统发育研究的超保守元件（UCEs）探针集相关数据，涵盖32种不同蛛形纲物种的目标测序结果，平均获取487个UCE位点，可支持系统发育分析、物种界定及多样性研究，共包含2个压缩文件。 文件详解 Trinity_assemblies.zip 文件格式：ZIP...
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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据
2026年1月18日 30 32 31
数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件（UCE）诱饵集，包含36个半翅目样本（覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属）及1个缨翅目外群的UCE数据，同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果，可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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Pseudomyrmex_Vachellia_Based金合欢蚁趋同进化与生物地理背景研究数据
2026年1月11日 30 177 91
数据集概述 本数据集围绕金合欢蚁（Pseudomyrmex ferrugineus群）与Vachellia宿主植物的共生关系展开，通过系统基因组学方法（超保守元件序列捕获）研究其进化历史，包括趋同进化、生物地理背景及相互作用起源，共包含8个文件。 文件详解 beast-xml-files.zip（ZIP格式）：包含BEAST分析相关的XML文件...
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Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据
2026年1月15日 30 65 4
数据集概述 本数据集包含叶蜂与树蜂（膜翅目）系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件，用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史，共包含40个文件。 文件详解 输入文件 文件名称：BEAST_input_phylo-...
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Pavo_Polyplectron_Argusianus_孔雀及眼斑类群系统基因组学研究数据
2026年1月12日 30 206 7
数据集概述 本数据集为孔雀及其他具眼斑类群进化研究的系统基因组学数据，包含1966个超保守元件（UCEs）和3个线粒体区域的序列分析结果，用于探究眼斑特征的同源性与进化路径，涉及孔雀属（Pavo）、孔雀雉属（Polyplectron）、大眼斑雉属（Argusianus）等类群的系统发育关系。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共7个）...
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基于Euphonia和Chlorophonia的雀科鸟类线粒体基因组及超保守元件分类学与生物地理学研究数据
2025年12月30日 30 104 70
数据集概述 本数据集包含Euphonia和Chlorophonia雀类（雀形目：燕雀科）的线粒体基因组序列、数千个超保守元件（UCE）序列及相关系统发育树文件，用于解析该类群的分类学关系与历史生物地理学。数据集涵盖样本元数据、序列矩阵、系统发育分析结果等12个文件，支持物种分类修订与生物地理历史重建研究。 文件详解 元数据与索引文件...
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快速演化辐射超保守元件分析数据集
2025年12月22日 30 1 0
数据集概述 本数据集围绕超保守元件（UCEs）在快速演化辐射类群（如雉科鸟类）系统发育研究中的应用展开，包含相关分析数据、补充文件及代码，用于评估多物种溯祖方法的性能，为解决复杂演化关系提供数据支持。 文件详解 补充文件（PDF格式，共10个）：如Supplementary File S1-S9、Figure...
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fairy_wrasses进化辐射的系统基因组学分析补充材料
2025年12月21日 30 171 41
数据集概述 该数据集为fairy wrasses（Teleostei: Labridae: Cirrhilabrus）进化辐射的系统基因组学分析补充材料，包含基因树、系统发育树、矩阵文件、电子补充材料文档等29个文件，用于支持相关研究的结果验证与深入分析。 文件详解 基因树与系统发育树文件：...
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地松鼠快速辐射类群系统发育分辨率研究数据集
2025年12月20日 30 64 12
数据集概述 本数据集围绕旱獭族地松鼠快速辐射类群的系统发育分辨率展开，通过3950余个超保守元件（UCE）位点，评估4种不同推断方法（RAxML、ASTRAL、NJst、SVDquartets）对系统发育估计的敏感性，以及不同过滤场景下的拓扑结构和支持度差异。 文件详解 文档与说明文件: README.txt:...
