找到18个数据集

分类: 公开数据 标签: VCF_GZ

过滤结果
  • 混合区杂交图谱映射_奥杜邦协会与默特尔林莺羽毛色素沉着相关基因位点数据

    2026年1月23日 30 72 36

    数据集概述 本数据集通过Audubon林莺与myrtle林莺杂交区的自然混合群体,识别与黑色素和类胡萝卜素两种色素沉着相关的基因组区域。针对五种羽毛颜色性状,发现多个显著关联的SNP位点,集中在离散基因组区域,为羽毛色素沉着的遗传基础研究提供数据支持。 文件详解 基因位点数据文件...
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  • Npumilio_Based_巴塔哥尼亚树木局部适应性候选基因与变异数据

    2026年1月22日 30 48 34

    数据集概述 本数据集围绕巴塔哥尼亚建群树种Nothofagus pumilio的局部适应性研究,包含6个核心文件,涵盖特定候选基因列表、探针设计信息、SNP变异数据、样本元数据及直系同源群数据。数据支持该树种适应性相关基因的注释、变异分析及样本地理信息关联,为树木遗传学研究提供基础数据。 文件详解...
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  • OsCycB1_5_Based水稻种子愈伤组织诱导基因位点及功能分析数据

    2026年1月21日 30 16 7

    数据集概述 本数据集围绕水稻种子愈伤组织诱导相关的遗传位点及候选基因OsCycB1;5展开,包含GWAS结果、SNP位点、表型数据、基因分型数据等多类型文件,支持水稻愈伤组织诱导性状的遗传机制研究与功能分析,共8个文件。 文件详解 表型数据文件 文件名称:cir10d.csv 文件格式:CSV...
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  • plains_zebra_Based_种群结构遗传多样性条纹异常分析数据

    2026年1月21日 30 166 142

    数据集概述 本数据集围绕平原斑马的种群结构、近交情况及条纹异常展开研究,包含140个平原斑马样本(含7个条纹异常个体)的遗传数据,覆盖非洲9个采样点。通过RAD-seq和WGS技术分析,探究种群结构、遗传多样性与异常表型的关系,为斑马保护策略提供科学依据。 文件详解 README 文件格式:无扩展名...
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  • Arceuthobium_Based_矮槲寄生种群基因组与宿主动态研究数据

    2026年1月21日 30 115 105

    数据集概述 本数据集为矮槲寄生属(Arceuthobium)种群基因组研究数据,包含通过RAD-sequencing技术获取的SNP数据及相关分析文件,覆盖北美和墨西哥不同宿主上的矮槲寄生样本,用于研究其系统发育分类、宿主特异性及地理因素对遗传结构的影响。 文件详解 文件名称:1_Arceuthobium_sample_info.xlsx...
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  • Shearwaters_Based_古海洋变化驱动鹱科海鸟多样化研究补充数据

    2026年1月20日 0 103 81

    数据集概述 本数据集为“上新世晚期古海洋变化促进远洋海鸟快速多样化”研究的补充信息,聚焦鹱科海鸟(Ardenna、Calonectris、Puffinus属)。包含基因组数据、系统发育树、分析配置文件等16个文件,覆盖物种演化时间校准、生物地理重建、体型演化分析及分类有效性评估等核心研究内容,支撑古海洋变化对高移动性远洋海鸟分化驱动机制的探究。...
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  • Dryad_Based马铃薯靶向GBS基因分型与polyBreedR分析数据集

    2026年1月19日 30 44 16

    数据集概述 本数据集包含马铃薯靶向基因分型(GBS)的DArTag技术数据及R/polyBreedR分析结果,涵盖2.5K和4K靶向标记的VCF文件、系谱数据、性状数据、错误分析等14个文件,支持马铃薯育种中的基因组选择、连锁图谱构建及性状关联分析。 文件详解 基因分型数据文件...
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  • Eucalyptus_microcarpa_Based景观基因组学遗传多样性分析数据

    2026年1月18日 30 198 83

    数据集概述 本数据集通过DArTseq基因组方法,分析澳大利亚东南部Eucalyptus microcarpa(Grey Box)的基因组多样性模式,涵盖大型残遗林、小型隔离残遗林及植被恢复地的样本,对比不同林分类型的基因组多样性与分化特征,为植被恢复的遗传多样性评估提供依据。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Pinus_ponderosa_Based_黄松环境变异与耐旱表型遗传变异关联研究数据

    2026年1月18日 30 133 102

    数据集概述 本数据集聚焦黄松(Pinus ponderosa)的遗传变异与环境适应性研究,通过基因型-环境关联(GEA)和基因型-表型关联(GPA)分析,识别与干旱耐受相关的遗传变异。包含223个加利福尼亚内华达山脉个体的遗传数据,筛选后保留92万余SNPs进行关联分析,涉及气候变量、温室耐旱性状等关联结果及基因注释信息。 文件详解 数据文件...
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  • Prolactin_Signalling_Mutations_牛催乳素信号通路功能突变数据_原始数据

    2026年1月5日 30 82 72

    数据集概述 本数据集包含牛催乳素信号通路功能互作突变相关的基因型和表型数据,涉及毛发与皮肤表型(如hairy和slick性状)的遗传分析。数据涵盖基因型文件、生理表型数据、TaqMan验证结果等,共7个文件,支持牛催乳素信号通路突变与表型关联的研究。 文件详解 基因型与表型数据压缩包 文件名称:gen_phen_data_for_paper.zip...
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  • Canid_Domestication_Based_犬类驯化与有害遗传变异研究数据

    2026年1月15日 30 73 7

    数据集概述 本数据集包含犬类(品种犬、乡村犬)和灰狼的全基因组测序分析数据,聚焦驯化与育种过程中有害遗传变异的变化。通过90个样本的基因组数据,评估有害变异的基因组模式,量化驯化相关瓶颈对遗传负荷的影响,揭示选择清除区域与有害变异的关联。数据集共7个文件,支持对犬类遗传负荷、选择压力及育种代价的研究。 文件详解 说明文档(README文件)...
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  • Sierra_Nevada_Nebria_ingens种群结构与冰川避难所关联研究数据

    2026年1月14日 30 199 169

    数据集概述 本数据集为论文“Drainage basins serve as multiple glacial refugia for alpine habitats in the Sierra Nevada Mountains, California”的配套数据,包含研究内华达山脉高山物种(Nebria...
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  • Dryad_Eucalyptus_microcarpa_气候基因组适应研究数据2017

    2026年1月14日 30 179 109

    数据集概述 本数据集基于DArTseq基因组方法,对澳大利亚东南部26个细叶桉种群的4200余个全基因组单核苷酸多态性(SNPs)进行分析,识别出81个与温度、干旱或降水相关的适应性SNPs,涉及所有11条染色体,为研究气候变化下物种适应性潜力提供支撑。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Salix_Populus_Based_Salicaceae系统发育组学研究补充数据_2023

    2026年1月12日 30 21 4

    数据集概述 本数据集为Salicaceae科中Salix(柳属)和Populus(杨属)及其近缘类群的系统发育组学研究补充材料,包含基于787个基因区域构建的系统发育树、基因序列捕获数据、杂交事件分析结果及多样化速率变化证据,用于揭示导致系统发育冲突的古老杂交模式与差异化多样化机制,共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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  • Trachycarpus_fortunei_Based_瑞士南部及意大利北部入侵群体遗传标记分析数据

    2026年1月5日 30 74 27

    数据集概述 本数据集为论文配套数据,包含入侵棕榈Trachycarpus fortunei在瑞士南部及意大利北部群体的微卫星与SNP标记分析结果,记录了208个样本的基因型数据,用于揭示该物种的随机交配模式和主动殖民过程,是研究其入侵机制的核心遗传信息资源。 文件详解 GBS分析文件 文件名称:variants.vcf.gz 文件格式:VCF.GZ...
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  • MPB_Dendroctonus_ponderosae_山松大小蠹生殖隔离与环境适应系统地理学研究数据

    2026年1月1日 30 6 0

    数据集概述 本数据集基于北美西部山松大小蠹全分布区的RAD测序数据,分析Y染色体单倍型与常染色体、X连锁位点的系统地理差异,揭示生殖隔离、环境适应对种群分化的作用,以及更新世冰期避难所与冰后期扩张的历史。数据含4个文件,支持种群遗传结构与环境适应性研究。 文件详解 集合信息文件 文件名称:S2CollectionInformation.xlsx...
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  • 黑腹果蝇基因组结构变异检测与基因分型数据集

    2025年12月22日 30 101 73

    数据集概述 该数据集包含使用Genomestrip/2.0工具,对黑腹果蝇(D.melanogaster)Sussex LHM半克隆系及一个内部参考系个体的基因组结构变异进行检测与基因分型的代码、日志、数据及摘要。数据涵盖原始与过滤后的CNV结果、提交至NCBI dbVAR的变异文件等,为相关基因组研究提供支持。 文件详解 代码文件:...
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  • 历史转座子动员波与作物病原菌适应性变异关联研究补充文件集2025

    2025年12月11日 30 21 7

    数据集概述 本数据集为“历史转座子动员波在主要作物病原菌中创造独特适应性变异库”研究的补充文件集,包含转座子多态性检测基准测试、泛基因组组装注释、适应性变异定位等核心研究材料,支持解析病原菌适应性进化机制。 文件详解 README.txt:...
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