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Limonium_Based_海薰衣草质体基因组正选择基因列表数据2021
数据集概述 本数据集为论文的补充材料3，包含海薰衣草（Limonium属）质体基因组中被鉴定出的正选择基因列表，是研究该属植物质体基因组倒位重复区扩展及适应性进化的关键数据支撑。 文件详解 文件名称：oo_527177.xlsx 文件格式：XLSX...
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Supramap_Geogenes_H7流感病毒基因组进化地理信息分析数据
数据集概述 本数据集是针对H7流感病毒的基因组、进化及地理信息分析结果，支持Supramap模块化网络服务的研究。数据包含流感病毒的表型地理信息与DNA状态可视化内容，可用于研究H7流感病毒的致病性转变、时空传播规律及生物标志物识别，为流感监测与防控提供数据支撑。 文件详解 文件名称：ALLphenogeographicDec6accsort.xlsx...
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Verminephrobacter_Based_蚯蚓共生菌基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕蚯蚓可遗传胞外共生菌Verminephrobacter的基因组进化展开，包含其与非共生近缘种Acidovorax的基因组比较分析数据，涉及纯化选择强度、密码子使用偏好及分子适应特征，重点研究共生菌基因组在演化中的选择压力变化与功能基因适应机制。 文件详解 文件名称：orthologs_nuc_ali_JAN12.zip...
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Lindera_obtusiloba_东亚残遗树种核与叶绿体基因组分化研究数据
数据集概述 本数据集为东亚残遗树种钝叶木姜子（Lindera obtusiloba）核基因组（nSSR）和叶绿体基因组（cpDNA）分化模式研究的支撑数据，包含两类遗传标记的原始或处理后数据，用于分析空间距离隔离（IBD）、环境隔离（IBE）及历史气候稳定性隔离（IBI）对种群遗传分化的相对贡献，揭示不同基因组遗传分化的驱动机制差异。 文件详解...
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Ctenizidae_Phylogeny_Based_活板门蜘蛛科系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为活板门蜘蛛科（Ctenizidae）系统发育研究的原始数据，包含通过锚定杂交富集（AHE）技术获取的基因组位点数据及系统发育分析文件。数据用于重建9个属的系统发育关系、验证科的单系性，并支持Halonoproctidae科的分类修订。数据集共包含2个文件，涉及基因组位点和系统发育分析相关内容。 文件详解...
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cichlid_adaptive_radiations_基因组分化平行性评估数据
数据集概述 本数据集基于三种同域慈鲷物种对的全基因组重测序数据，这些物种对具有相似功能和生态分化但演化年龄不同。数据记录了线粒体与核基因组分化随时间增加的特征，以及适应性辐射过程中基因组分化的平行性模式，支持对物种形成连续演化过程的研究。 文件详解 数据文件（.tsv格式）...
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TraitRateProp_Based_表型性状与序列进化关联分析数据_研究材料
数据集概述 本数据集是研究表型性状变化与位点特异性序列进化关联的配套数据，包含应用TraitRateProp方法分析的兰花质体基因及OM基因结果、补充表格和修订补充材料。其中TraitRateProp是用于检测二元表型性状与序列进化速率关联的概率方法，数据集支持验证该方法及研究异养生活方式对植物质体基因组进化的影响，共含5个文件。 文件详解...
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Astyanax_Probes_Based_FISH实验组蛋白PCR产物序列数据
数据集概述 本数据集为论文补充材料2，包含三个Astyanax aff. scabripinnis种群（LFS、LP、RP）的组蛋白PCR产物DNA序列，这些序列被用作FISH实验的探针，用于研究该鱼类基因组中重复DNA的动态变化及进化意义。 文件详解 文件名称：oo_125354.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：包含三个种群（LFS:...
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Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据
数据集概述 本数据集包含喜树（Camptotheca acuminata）的高质量从头基因组组装及相关注释数据，喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等，共15个文件，为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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Botrychium_lunaria_转录组数据_早期分支蕨类植物群体结构分析数据
数据集概述 本数据集包含早期分支蕨类植物Botrychium lunaria的转录组相关文件，用于精细解析其群体结构。涵盖CRY2cA序列比对、肽序列、直系同源群序列比对、模型测试及系统发育树构建等7个压缩文件，支持属级系统发育和群体结构研究。 文件详解 File_S1_CRY2_alignment.zip 文件格式：ZIP...
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Johnson_et_al_2022_Based_芸苔属植物干旱实验基因组进化数据
数据集概述 本数据集记录了芸苔属植物Brassica rapa在实验干旱条件下的基因组进化研究数据，包含祖先与后代种群的基因组测序结果、表型数据及分析文件，用于探究干旱选择下的遗传平行性与适应性进化机制，共8个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：README_Johnson_et_al_2022_JEB.txt 文件格式：TXT...
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Supplemental_dryad_无性蜗牛种群DNA含量与SNP多样性研究补充数据
数据集概述 本数据集为无性蜗牛种群遗传多样性研究的补充资料，记录新西兰淡水蜗牛（Potamopyrgus antipodarum）单一种群（亚历山大湖）的SNP多样性、DNA含量及病原体易感性数据，包含野外样本与实验室克隆系的基因型、DNA含量等信息，支持无性种群基因组进化研究。 文件详解 数据文件（CSV格式）...
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BMC_Genomics_Source_虎纹钝口螈SNP频率估算与转录本多态性研究数据
数据集概述 本数据集支持BMC Genomics发表的虎纹钝口螈SNP频率研究论文，包含454焦磷酸测序原始数据及组装contig序列，用于分析contig长度和测序深度对SNP频率估算的影响，以及编码与非编码转录本的SNP丰度差异，验证长非编码转录本保守性较低的假设。 文件详解 README文件...
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Cnidaria_Microsatellite_刺胞动物门微卫星丰度与系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕刺胞动物门（包括珊瑚虫纲和水螅纲）的微卫星丰度展开研究，分析11个物种的微卫星基序分布、系统发育关系及共生/非共生状态对基因组的影响。包含微卫星搜索结果、系统发育树、蛋白质序列及分析说明，共4个文件，支持基因组进化与共生关系研究。 文件详解 README_for_ScirokoResultsAll.rtf 文件格式：RTF...
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Corydoradinae_Based_全基因组复制与转座子增殖驱动基因组扩张研究数据
数据集概述 本数据集围绕新热带区鲶鱼亚科（Corydoradinae）的基因组大小变异展开研究，涉及65个物种的基因组大小量化、系统发育树构建、全基因组复制（WGD）事件鉴定及转座子（TE）丰度分析，揭示基因组扩张的进化机制。 文件详解 文件名称：cory_final_bmodel.xml 文件格式：XML...
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铃木ού_巴拉甘和拉托雷等人_2024_年关于稻瘟病菌基因组进化研究的数据_v1_0_0
数据集概述 本数据集为论文“Multiple horizontal mini-chromosome transfers drive genome evolution of clonal blast fungus...
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Eckert_et_al_Based_软松亚属多基因座适应性进化研究数据_archive
数据集概述 本数据集包含11种软松（松属软松亚属）的167个直系同源核基因片段的DNA序列比对数据，用于研究其适应性进化。研究通过分析非同义突变的适应性比例（α）和有害 fitness 效应分布（DFE），发现多数新非同义突变具有强有害性，长期适应性进化证据不足，符合近中性理论预期。数据以压缩包形式提供，含1个文件。 文件详解...
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Acinetobacter_baumannii_AMA205_阿根廷临床分离株耐药基因组数据
数据集概述 本数据集为2021年阿根廷COVID-19患者分离的鲍曼不动杆菌AMA205（ST79型）的耐药相关基因组数据。该菌株携带blaCMY-6、blaNDM-1等新型耐药基因，对多数抗生素耐药，且含111种潜在毒力因子。数据包含菌株染色体及质粒的基因组文件，用于研究其耐药机制与毒力特征。 文件详解 文件名称：pAMA205_2.zip...
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Epigenetic_modifications_Based_病原真菌自发突变率影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕病原真菌表观遗传修饰对自发突变率的影响展开，包含实验数据、统计结果、基因组注释等11个文件。数据支撑研究中关于组蛋白修饰（H3K27me3、H3K9me3）、转座子胞嘧啶甲基化及温度胁迫对突变率作用的结论，为解析真菌基因组变异机制提供结构化数据。 文件详解 实验与统计数据文件（.xlsx格式，共6个）...
