找到75个数据集

标签: SNP数据

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  • 弗林索玛_Phrynosoma_物种的参考分类学_生物多样性及系统发育评估

    2026年1月21日   

    数据集概述 本数据集为角蜥属(Phrynosoma)物种的系统基因组生物多样性评估数据,包含ddRADseq和线粒体DNA等分子数据文件,用于构建参考分类框架,解决大短角蜥物种复合体的物种界定争议,支持物种树构建、分歧时间估算及种群遗传分析,共9个相关文件。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Daphnia_magna_Based_水蚤自然种群时间遗传稳定性研究数据

    2026年1月21日   

    数据集概述 本数据集围绕水蚤Daphnia magna自然种群在强选择压力下的时间遗传稳定性展开,通过分析休眠卵库中孵化与未孵化种群的遗传多样性数据,探究休眠卵库对种群进化潜力的代表性。包含3个数据文件,用于支持进化生态学领域对种群遗传动态的研究。 文件详解 孵化种群中性微卫星数据...
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  • Delayed_dispersal_甲虫家庭生活研究_延迟扩散与育幼行为数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕角蛀甲(horned passalus beetle)的家庭生活行为展开,聚焦延迟扩散与亲代育幼机制研究。包含种群遗传结构、体重变化、真菌生长、GPS坐标等多维度数据,用于分析甲虫延迟扩散的驱动因素,探索家庭社会系统演化的前提条件,共9个相关文件。 文件详解 代码文件(.R)...
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  • Roscoea_HIM_Source_喜马拉雅南坡物种海拔梯度分化研究数据集

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕喜马拉雅南坡Roscoea物种的海拔梯度分化展开,包含32375个非连锁SNP的系统发育分析、基因渐渗检测、物种分布模型(SDM)模拟等研究数据,用于探究喜马拉雅生物多样性起源及海拔梯度下的物种形成过程,共含4个文件。 文件详解 坐标数据文件 文件名称:coordinates_HIM.csv 文件格式:CSV...
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  • Dryad_Based_西大西洋珊瑚礁虾虎鱼基因流动障碍与连通性模式研究数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕西大西洋珊瑚礁虾虎鱼(Coryphopterus属)的基因流动展开研究,聚焦亚马逊河 outflow、洋流等海洋地理特征对物种基因流动的障碍作用,分析种群分化、演化历史及扩散路径,为海洋鱼类物种形成机制提供数据支持。 文件详解 Metadata.csv 文件格式:CSV...
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  • Viola_uliginosa_Based濒危多年生植物基因组管理规划研究数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕濒危多年生湿地植物Viola uliginosa的保护管理展开,通过ddRAD-seq技术获取基因组SNP数据,分析其基因组多样性、种群结构及历史动态,涉及芬兰、爱沙尼亚、斯洛文尼亚、白俄罗斯和波兰的11个采样点,为该物种的保护策略制定提供科学依据。 文件详解 文档文件 文件名称:Viola_Supplementary.docx...
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  • Leucorrhinia_dubia_Palearctic地区遗传分化研究数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集呈现了北极圈蜻蜓Leucorrhinia dubia在古北界地区的空间遗传结构,基于ddRAD测序技术分析,涵盖欧洲9个地点、亚洲(俄罗斯和日本)3个地点的样本,以及日本的L. intermedia样本。结果显示欧洲存在三个不同遗传集群,亚洲样本形成独立集群,反映末次冰期后的历史...
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  • NONINVASIVE_Based_遗传非侵入性采样有效性测试_无尾熊种群数据

    2026年1月20日   

    数据集概述 本数据集围绕遗传非侵入性采样在种群遗传监测中的有效性展开研究,以自由放养无尾熊种群(n=430)的高质量SNP数据为基础,分析了遗传非侵入性样本典型的SNP面板大小、检出率及采样强度对遗传多样性、近交系数、内部关联性等遗传指标准确性的影响,为保护决策提供数据支持。 文件详解 README文档 文件名称:README_Dec2021.docx...
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  • Atriophallophorus_Based_新西兰寄生虫分子数据与分析规范

    2026年1月19日   

    数据集概述 本数据集为新西兰Atriophallophorus属吸虫寄生虫研究的配套数据,包含SNP数据、样本信息、系统发育分析结果、序列比对文件及分析输入文件,支持研究该属寄生虫的系统发育地理格局与隐存种结构,共含17个文件。 文件详解 数据文件(.fasta格式,共8个)...
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  • Draco_lineatus_Source_西里伯斯飞蜥系统基因组学研究数据集

    2026年1月19日   

    数据集概述 本数据集为西里伯斯飞蜥(Draco lineatus Group)系统基因组学研究数据,包含线粒体序列、SNP、外显子捕获等多类型分子数据,用于探究该物种辐射演化历史、隐存种形成及古杂交事件,支撑15个物种的分类修订及与苏拉威西地质历史的关联分析。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.my.txt 文件格式:TXT...
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  • Anopheles_gambiae_X_冈比亚按蚊种对杂交区X染色体基因分型数据

    2026年1月19日   

    数据集概述 本数据集包含冈比亚按蚊种对(A. gambiae和A. coluzzii)杂交区雄性个体的X染色体基因分型数据,聚焦于物种形成相关的“基因组分化岛”区域。数据揭示了该区域复杂的重组模式,为研究基因流背景下的物种形成机制提供支持,共包含2个Excel文件。 文件详解 文件名称:Caputo et al 2016 Data S1.xlsx...
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  • Heterogeneity_St_Kilda_Soay绵羊体型性状遗传架构研究数据

    2026年1月18日   

    数据集概述 本数据集聚焦苏格兰圣基尔达岛野生Soay绵羊种群,通过37037个多态性SNP分析5项成年体型性状(下颌、体重、前腿、后腿、掌骨长度)的遗传架构异质性,包含捕获数据、体型数据、骨骼数据、SNP数据及年度适合度数据等核心内容,总计10个文件,用于揭示野生种群数量性状的遗传机制与进化过程。 文件详解 说明文档类(.txt格式,共9个)...
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  • Helicoverpa_armigera_Based全球种群结构与基因流动研究数据

    2026年1月18日   

    数据集概述 本数据集为全球农业害虫棉铃虫(Helicoverpa armigera)的种群结构与基因流动研究数据,涵盖六大洲种群的线粒体基因组、基因分型及全基因组序列等信息,用于分析其种群来源、基因交流及与近缘种的关系,助力生物安全风险评估。 文件详解 文件名称:b3_b1b2_snps.vcf.bz2 文件格式:VCF.BZ2...
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  • Brassica_napus_Based_甘蓝型油菜两个近缘品种基因组组装与比较数据

    2026年1月18日   

    数据集概述 本数据集包含甘蓝型油菜品种Tapidor的从头基因组组装,以及与改良组装的Darmor-bzh品种的比较数据。两者采用相同注释方法以实现基因内容对比,识别了各品种特有基因并区分组装注释差异导致的伪影,共含17个归档文件。 文件详解 基因组组装与注释文件...
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  • Dryad_Based_热带蜥蜴Carlia_amax谱系分化与种群历史研究数据_2016

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为热带蜥蜴Carlia amax的谱系与种群历史研究数据,包含基于外显子捕获技术生成的2000余个基因座的序列及SNP数据,用于识别该物种的分化谱系、重建谱系关系并推断种群动态历史,为理解热带低扩散类群的生物多样性形成机制提供支持。 文件详解 文件名称:README_for_Dryad Repository.txt 文件格式:TXT...
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  • Hypsiboas_lundii_Based新热带界塞拉多树蛙基因组分化研究数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集围绕新热带界塞拉多稀树草原特有树蛙Hypsiboas lundii展开,结合基因组SNP数据、线粒体DNA及第四纪古气候分布模型,分析古气候波动对其种群结构和遗传分化的影响,验证“不稳定性隔离”模型。数据集包含5个文件,覆盖气候稳定性阻力、遗传分化指数、地理坡度阻力等多维度数据。 文件详解...
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  • Rana_arvalis_Based_蛙类C_EBP_1基因纬度梯度适应性研究数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集围绕沼蛙(Rana arvalis)C/EBP-1基因展开,涵盖德国至瑞典北部5个纬度梯度区域的遗传与表型数据,用于研究该转录因子在幼虫发育适应气候梯度中的遗传基础、选择压力及与表型变异的关联,包含基因分型、SNP数据和共同花园实验表型数据三类文件。 文件详解 C_EBP_genotypes_364_individuals.xlsx...
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  • southern_brown_bandicoot_遗传多样性补充源种群优先研究数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集为澳大利亚濒危有袋类动物南部褐袋狸(东部亚种)重引入项目的遗传多样性补充研究数据。记录了通过分析亚种分布区遗传多样性,模拟不同候选种群补充场景,识别可最大化重引入种群遗传多样性的源种群(维多利亚州墨尔本地区种群),为保护管理决策提供依据。 文件详解 文件名称:raw_SNP_data_with_codes.xlsx...
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  • Alvarado_Serrano_Based_紫茉莉入侵杂草连通性影响因素研究数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集聚焦入侵杂草紫茉莉(Ipomoea purpurea)的种群遗传结构与连通性,包含其SNP、SSR分子标记数据及景观变量数据,用于分析自然景观与人为因素对该物种基因流的影响,助力理解入侵物种扩散机制与管理策略制定。 文件详解 文档类文件(.txt格式) README_for_Alvarado-Serrano et...
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  • Timema_cristinae_Based_表型性状选择强度全基因组关联定位数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集为Timema cristinae竹节虫的表型性状全基因组关联定位数据,包含10个表型性状的测量值与211,004个单核苷酸多态性(SNPs)数据,用于分析不同宿主植物间受选择强度差异的性状遗传结构,识别关联SNP位点,为该物种适应性进化的基因位点研究提供基础。 文件详解 文档类文件...
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