-
Gorilla_herpes_simplexvirus_大猩猩单纯疱疹病毒系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕大猩猩单纯疱疹病毒的系统发育分析展开,包含新型疱疹病毒的基因序列、系统发育树及相关元数据文件。数据源自野生大猩猩、倭黑猩猩和黑猩猩粪便样本的大规模筛查,旨在揭示人类单纯疱疹病毒的起源及跨物种传播机制,为理解人兽共患病起源提供支持。 文件详解 基因序列文件...
-
Mongolian_Plateau_Based干旱半干旱区灌木群落系统发育结构与形成机制研究数据
数据集概述 本数据集聚焦蒙古高原干旱半干旱区灌木群落的系统发育结构与形成机制,包含植物功能性状数据和系统发育树文件,用于分析物种共存机制、系统发育保守性及气候因子对群落结构的影响,为理解群落组成和生物多样性维持机制提供支撑。 文件详解 文件名称:Traits.xlsx 文件格式:XLSX...
-
Leafless_epiphytic_orchids_Based_无叶附生兰菌根真菌数据_2021
数据集概述 本数据集包含无叶附生兰的真菌系统发育与群落数据,来自2021年发表于Mycorrhiza期刊的论文。数据涵盖角担菌科真菌的序列矩阵、系统发育树,以及不同样本中菌根真菌OTU的序列丰度与采样信息,共包含4个文件,用于展示无叶附生兰共享的菌根真菌关系。 文件详解 readme.docx 文件格式:DOCX...
-
Rhithrogena_Heptageniidae_Based欧洲高山蜉蝣分子系统发育与分化时间研究数据
数据集概述 本数据集为欧洲高山Rhithrogena蜉蝣的分子系统发育与分化时间研究数据,包含线粒体和核基因序列、系统发育树文件、贝叶斯分析输入输出文件及R脚本等31个文件,覆盖物种分类、演化关系及分化时间等核心研究内容,支持物种群定义、分化速率及祖先状态重建等分析。 文件详解 基因序列文件 格式:FASTA...
-
Dryad_Hawaiian_silversword_alliance栖息地转移与细胞质核不一致性研究数据集
数据集概述 本数据集为夏威夷特有银剑植物群落(菊科)的系统发育与生物地理分析数据,包含核核糖体DNA(nrDNA)和叶绿体DNA(cpDNA)序列数据、系统发育树文件及说明文档,用于研究该类群的栖息地转移、岛间扩散、杂交事件及分支多样性,揭示其适应性辐射过程中的生态进化路径。 文件详解 说明文档 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
-
Tuber_melanosporum_Genome_Resequencing_SNP_Survey_Data
数据集概述 本数据集为佩里戈尔黑松露(Tuber melanosporum Vittad.)的全基因组单核苷酸多态性(SNP)调查数据,通过Illumina高通量重测序技术对6个地理来源的菌株基因组进行测序分析,识别出442326个核心基因组SNP,包含重复序列及编码区的SNP分布,为该真菌的群体遗传学和基因组学研究提供资源。 文件详解...
-
拟步甲科_Staphylinidae_中Creophilus属和Platydracus属线粒体基因组的系统发育分析数据
数据集概述 本数据集包含鞘翅目隐翅虫科Creophilus属和Platydracus属的首个线粒体基因组相关的系统发育分析数据,涵盖修剪后的矩阵、分区文件、扩展共识树及补充表格,用于支持该类群的系统发育关系研究。 文件详解 数据集压缩包(Datasets.zip)...
-
PickMe算法物种树重建样本选择数据集
数据集概述 本数据集围绕PickMe算法展开,该算法通过贝叶斯框架为基因树中的四分体拓扑分配后验概率,计算样本可靠性得分以辅助物种树重建的样本选择。数据集包含算法应用于乳草属目标捕获数据的相关文件,为系统发育基因组学研究提供样本筛选工具支持。 文件详解...
-
白垩纪大西洋海岸线鸟类组合与现代鸟类演化数据集
数据集概述 本数据集聚焦白垩纪大西洋海岸线的鸟类化石组合,通过系统发育分析等方法,揭示早期今鸟类(Neornithes)的多样性及演化特征,为理解现代鸟类的起源与适应性辐射提供关键实证数据。 文件详解 数据文件(.dat格式): Tibiotarsus_PCA_1.dat:胫骨跗骨主成分分析数据 Humerus_PCA_1.dat:肱骨主成分分析数据...
-
Mixtecan语系贝叶斯系统发育分析补充材料数据集
数据集概述 本数据集是关于Mixtecan语系方言连续体分组贝叶斯系统发育分析的补充材料,包含样本语言元数据、自定义词表、同源词编码说明、系统发育分析文件及可视化结果等18个文件,为该语系的语言演化研究提供支持。 文件详解 该数据集包含18个文件,具体说明如下: - 元数据文件: - sm0_metadata.tsv:...
-
欧洲及地中海流域淡水等足类物种群Proasellus_coxalis组成分布及历史研究补充信息
数据集概述 本数据集是关于欧洲及地中海流域淡水等足类物种群Proasellus coxalis组成、分布及历史研究的补充信息,包含多种格式的表格、进化树文件、序列文件及说明文档,为相关研究提供支持。 文件详解...
-
系统发育学中概率图形模型表示数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育学中的概率图形模型表示展开,通过引入树板等新组件,扩展标准图形模型框架以适配系统发育树结构,提供模型表示案例与配套数据,助力系统发育模型的教学、交流及通用软件开发。 文件详解 数据文件: baculumData01.nex: NEX格式文件,可能为系统发育分析的原始数据文件 mammalia_dosReis.tree:...
-
典型SNARE蛋白额外数据集
数据集概述 该数据集包含典型SNARE蛋白相关的额外研究数据,涵盖系统发育树、序列比对、生物化学实验结果(如圆二色谱、尺寸排阻色谱数据)及蛋白质电泳凝胶图像等,为相关研究提供补充数据支持。 文件详解 文档说明文件:...
-
哺乳动物Sry基因分子进化功能衰退模型支持数据集
数据集概述 本数据集为Okuyama等人关于“哺乳动物Sry基因分子进化功能衰退模型”研究的支持数据,包含进化分析、EMSA实验、Western blot实验的原始数据与分析文件,共21个文件,支持论文核心发现。 文件详解 进化分析文件:...
-
迪纳拉山脉地下水物种气候脆弱性补充数据与代码
数据集概述 本数据集是关于迪纳拉山脉地下端足类动物气候脆弱性研究的补充数据与代码,包含系统发育分析用的最大可信度系统发育树、52种尼法尔古斯属物种的栖息地分布数据、形态测量数据及可复现的R分析脚本,支持研究结果的验证与扩展。 文件详解 beast.tree:.tree格式文件,用于导入R的最大可信度系统发育树数据...
-
爬行动物胎生进化祖先状态重建与速率异质性数据集
数据集概述 本数据集围绕爬行动物胎生进化研究,分析祖先状态重建中忽略进化速率异质性导致的异常结果,对比三种速率可变方法(随机局部时钟法、拆分BiSSE、隐藏速率模型)的重建效果,结合蜥蜴类爬行动物胎生进化实证分析及模拟验证传统模型不足。 文件详解 图表文件: Fig1_Expanded.pdf:PDF格式,扩展版图1...
-
生物医学图表构建与统计分析原始数据集
数据集概述 本数据集为研究中共享的原始数据,包含构建图表的数据值、均值及标准差,涉及物种、分类单元等生物医学相关内容,共15个文件,覆盖多种格式,为生物医学数据分析提供基础数据支持。 文件详解 统计分析文件: table1-spss.sav、table2-spss.sav:SPSS格式文件,用于统计分析,包含原始数据及统计结果 图表数据文件:...



