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欧洲海带物种隐存种快速识别与遗传多样性特征分析工具开发数据集
数据集概述 本数据集围绕欧洲海带物种隐存种快速识别与遗传多样性特征分析工具开发展开,包含新开发的微卫星位点序列、基因型数据表及COI序列等,为海带物种遗传多样性研究及保护提供工具与数据支持。 文件详解 文档文件: README_for_DataS1.pdf:PDF格式,提供数据集的说明文档,包含数据背景、文件结构及使用方法等信息。...
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寄生虫Geomydoecus_aurei殖民过程中遗传多样性丧失_恢复与等位基因冲浪数据集
数据集概述 本数据集围绕寄生虫Geomydoecus aurei的殖民扩张展开,通过12个微卫星标记分析1935个样本的遗传数据,探究其25年间地理扩张的遗传后果,包括空间扩张模式、遗传恢复时间及等位基因冲浪现象,为物种分布变化的遗传研究提供支持。 文件详解 该数据集包含19个文件,覆盖遗传数据、分析报告及辅助文档,具体如下: - 微卫星标记数据文件:...
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巴西米纳斯吉拉斯州小麦瘟病菌基因分型多重扩增子测序数据集
数据集概述 本数据集包含巴西米纳斯吉拉斯州2019年小麦瘟疫情期间采集的81株小麦瘟病菌(MoT)分离株的基因分型数据,通过84个SNP标记区分2016年南亚出现的克隆谱系与其他基因型,为小麦瘟病菌研究提供开放科学资源。 文件详解 文件名称:02-SupplementalDataset_1_Information of 81 isolates.xlsx...
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蜥蜴属Liolaemus隐藏多样性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕蜥蜴属Liolaemus的隐藏多样性展开,结合分子与形态学数据研究L. rothi复合体的分化情况。包含97个个体的14个基因位点分子数据及形态测量、颜色模式变量,涉及6个已知物种和2个候选物种,为揭示该属真实多样性提供数据支持。 文件详解 压缩文件: fasta-...
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海洋海链藻CCMP1005基因组版本2_0数据集
数据集概述 该数据集包含海洋海链藻CCMP1005基因组版本2.0(Thaoce2)的相关数据,涵盖组装 scaffolds、基因模型、蛋白质及编码序列,同时包含版本1中移除的组装 scaffolds 和基因模型。 文件详解 Thaoce2.zip:压缩文件格式,可能包含基因组组装、基因模型等核心数据文件...
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假新芽孢杆菌JJ_79在芽孢杆菌科内的系统发育定位数据集
数据集概述 该数据集包含系统发育树及相关序列数据,用于评估假新芽孢杆菌JJ-79在芽孢杆菌科512个模式菌株中的系统发育定位。基于三个多基因数据集(BM1、BM2、BM3)构建系统发育树,提供序列比对、树结构及可视化文件。 文件详解 BM1相关文件: BM1.faa:FASTA格式,87个保守基因的过滤后多序列比对拼接文件...
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stenotopic石蛾Crunoecia_irrorata升温适应策略比较蛋白质组学数据集
数据集概述 本数据集围绕stenotopic石蛾Crunoecia irrorata在不同温度(10、15、20℃)下的蛋白质组变化展开,通过LC-MS/MS技术鉴定1358种蛋白质,分析其应对升温的补偿机制,为研究温泉特有物种的热适应能力提供分子层面的数据支持。 文件详解 文件名称:Commands.pdf 文件格式:PDF...
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北美奶蛇生态分化与基因流历史数据集
数据集概述 该数据集围绕北美奶蛇(Lampropeltis triangulum复合体)的生态分化与基因流历史展开,通过基因组数据和建模方法分析物种形成机制、杂交区位置及基因渐渗模式,验证基于小数据集界定的三个类群(L. elapsoides、L. triangulum、L....
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内蒙古草原中度放牧对微生物网络及功能影响数据集2021
数据集概述 本数据集聚焦内蒙古草甸草原与荒漠草原,通过16S rRNA测序分析中度放牧下微生物群落的多样性、功能及网络结构变化,包含测序原始数据、多样性计算、功能预测及网络分析等结果,为草原放牧管理策略提供数据支撑。 文件详解 该数据集包含多个目录及文件,具体说明如下: - 根目录文件: - 代码文件:Functional index...
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携带blaCTX_M_14质粒的多重耐药高毒力ST367_KL1类肺炎克雷伯菌相似肺炎亚种菌株特征数据集
数据集概述 本数据集为研究论文的配套数据,包含携带blaCTX-M-14质粒的多重耐药高毒力ST367-KL1类肺炎克雷伯菌相似肺炎亚种菌株的相关信息,涉及质粒同源性比较、表型数据及用于构建系统发育树的基因组序列,支持菌株特征分析。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 1.Analysis of Plasmid...
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加拿大新种克洛西亚寄生虫描述数据集2025
数据集概述 本数据集为描述加拿大新种克洛西亚寄生虫(Klossia vaderbriani)的研究数据,包含该寄生虫的分子序列(nu18S rDNA、mtCOI)比对与系统发育分析文件,以及模式标本照片,为该新物种分类及阿德勒科分类学研究提供支持。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 模式标本文件(Phototype for...
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大夜蝠飞行捕食雀形目鸟类研究数据集
数据集概述 本数据集为验证大夜蝠(Nyctalus lasiopterus)在飞行中捕食迁徙雀形目鸟类的假设提供支持,包含蝙蝠狩猎行为的生物声纳数据、运动传感器数据、鸟类鸣声库及蝙蝠粪便DNA元条形码数据,可复现相关研究的核心发现。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 标签数据与分析代码(位于TagData/目录下): -...
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原索动物模型系统玻璃海鞘肠道病毒组数据集
数据集概述 该数据集包含从原索动物模型系统玻璃海鞘(Ciona intestinalis)肠道病毒宏基因组中测序得到的环状基因组序列,为研究玻璃海鞘肠道病毒组结构提供基础数据。 文件详解 文件名称: Ciona_Circular_Viral_Genomes.fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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中国云南真菌群落与元群落模式形成机制识别数据集
数据集概述 本数据集围绕中国云南地区真菌群落与元群落模式形成机制展开,包含用于识别其形成机制的相关数据与补充结果,涵盖文档、序列数据及文本文件等多种类型,为研究该区域真菌群落结构及其驱动机制提供数据支持。 文件详解 该数据集包含3个文件,具体说明如下: - 文件名称: Additional file 1.docx - 文件格式: DOCX -...
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昆虫Dome受体识别病毒包膜激活JAK_STAT信号通路诱导抗病毒viperin表达序列数据集
数据集概述 该数据集为发表于《CELL REPORTS》的研究论文配套序列数据,核心内容是昆虫Dome受体识别病毒包膜、激活JAK/STAT信号通路及诱导抗病毒viperin表达相关的序列信息,为昆虫抗病毒免疫机制研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:JAK-seq.fasta 文件格式:FASTA(.fasta)...
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霍氏肠杆菌L710hy单菌落传代纳米孔测序数据集
数据集概述 该数据集包含霍氏肠杆菌L710hy菌株传代后获得的单菌落纳米孔测序数据,以FASTA格式存储,共五个文件,为研究该菌株的基因组特征或传代稳定性提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含一个目录下的五个FASTA格式文件,具体说明如下: - 目录: Enterobacter hormaechei L710hy/ - 文件列表: -...
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鸡形目分歧时间估算数据集_基于超保守元件最佳基因筛选方案
数据集概述 本数据集围绕鸡形目(Galliformes)的分歧时间估算展开,基于超保守元件(UCEs)的最佳基因筛选方案,包含130个现存鸡形目类群的序列比对文件和系统发育树文件,为研究鸡形目演化历史、物种分化时间提供数据支持。 文件详解 该数据集包含序列比对文件、系统发育树文件及辅助文本文件,具体说明如下: - 序列比对文件(位于不同分类目录下):...
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南非孕妇分娩时碳青霉烯耐药肠杆菌科定植的基因组流行病学与耐药组分析数据集2020_2021
数据集概述 本数据集包含2020年11月至2021年9月南非比勒陀利亚某三级医院孕妇分娩时碳青霉烯耐药肠杆菌科(CRE)定植的基因组流行病学与耐药组分析数据,涵盖临床表型、基因组、系统发育及比较分析等内容,无患者识别信息,为抗菌药物耐药研究、流行病学监测等提供支持。 文件详解 临床与表型数据文件: Dataset...
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Gouldian雀的时空遗传多样性数据集
数据集概述 本数据集聚焦Gouldian雀的遗传多样性,涵盖历史与当代样本的微卫星、线粒体DNA(MtDNA)等遗传标记数据,包含样本基本信息、遗传分析结果及相关代码,为研究该物种遗传多样性的时空变化提供支持。 文件详解 该数据集包含11个文件,具体说明如下: - 说明文档(.txt格式,共4个): -...
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西瓜尾孢菌基因组序列数据集
数据集概述 本数据集包含西瓜尾孢菌(Cercospora citrullina)的基因组序列及相关分析文件。该真菌是导致葫芦科植物叶斑病的重要病原菌,数据集通过Illumina HiSeq 2500平台测序构建了其基因组草图,包含一百八十九个contigs,N50值为三万八千五百九十二bp,预测了八千八百五十六个基因,为后续群体基因组学研究提供资源。...



