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Xenopus_Pipidae_非洲爪蟾多倍体新种综合研究数据
数据集概述 本数据集围绕非洲爪蟾属（Xenopus）展开，聚焦西非和中非地区6个多倍体新种的鉴定研究，涵盖遗传、形态、鸣声及历史记录等核心内容，支持物种分类与进化分析，包含14份相关文件。 文件详解 音频文件（.wav格式） 文件示例：Sil.sp.32.40-55.e.wav、kobeli_BJE3073.3.53.i.bpfil.wav等共8个文件...
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GBRAP_Based_古菌与细菌基因组特征机器学习分类数据集
数据集概述 本数据集用于古菌与细菌的机器学习分类分析，包含通过GBRAP工具计算的77个基因组特征。数据支持识别新型预测性基因组特征，为微生物分类研究提供结构化的基因组特征数据基础。 文件详解 文件名称：dataset_archaea_bacteria.xlsx 文件格式：XLSX...
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澳大利亚陆生脊椎动物数据的系统发生分析所需的_Dryad_资源
数据集概述 本数据集为澳大利亚陆生脊椎动物系统发育基因组分析提供转录组资源，包含鸟类、蛙类、蜥蜴和哺乳动物共二十二个物种的转录组序列，支持基于外显子的序列捕获研究，还提供选择系统发育信息外显子的方法示例，助力解决澳大利亚脊椎动物进化关系与隐存多样性问题。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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吉亚努卡_2024年欧洲蝴蝶气候风险_系统发育与性状分析数据集
数据集概述 本数据集为Gianuca等人2024年发表的研究“Disentangling the influence of phylogeny and traits on climatic risk of European...
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补充数据_Characidium物种B染色体起源研究_2017
数据集概述 本数据集是论文《Characidium alipioi的B染色体起源及其与其他Characidium物种超数染色体的关系》的补充材料1，包含1个文件，记录了Characidium物种CytB序列间的平均距离数据，用于支持B染色体起源的比较细胞遗传学研究。 文件详解 文件名称：oo_119004.xlsx 文件格式：XLSX...
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Genome_Based北太平洋虎鲸生态型基因组SNP分析数据
数据集概述 本数据集包含北太平洋三种部分同域分布虎鲸生态型的全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据，用于研究其复杂的祖先起源。数据通过多位点溯祖树、混合图重建及f4统计等方法分析，揭示生态型间的进化关系、祖先混合事件及不完全谱系分选现象，总计包含十四份文件。 文件详解 XML文件（5个）...
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ZooKeys_补充材料_2_南非杜布里亚蛇隐种的分子证据数据
数据集概述 本数据集为论文的补充材料2，内容围绕南非普通食蛞蝓蛇Duberria lutrix lutrix的隐存种分子证据展开，包含支持该研究结论的相关分子数据资料，是理解该蛇类物种分类与多样性的辅助材料。 文件详解 文件名称：oo_294254.docx 文件格式：DOCX...
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Russula_Based_外生菌根真菌全球多样化模式研究数据
数据集概述 本数据集为外生菌根真菌Russula属的全球多样化模式研究数据，包含系统发育树、基因序列比对文件、元数据等11个文件，涉及真菌进化关系、生物地理分布及宿主关联分析，用于验证温带与热带类群的分化差异及宿主切换对多样性的驱动作用。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共5个） 文件名称：Russula multigene ML...
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Avian_influenza_virus_生物学基因序列数据
数据集概述 本数据集包含禽流感病毒（AIV）相关的基因序列数据，以FASTA格式压缩存储，核心文件为aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip。数据聚焦生物学基因领域，未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理集，仅含一个压缩文件，无额外目录层级。 文件详解 文件名称：aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip...
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Saanich_Inlet_海洋ssDNA病毒群落多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含Saanich Inlet不同水层（10米有氧层和200米缺氧层）的gokushoviruses病毒群落多样性研究数据，涵盖原始测序数据、OTU分析结果及系统发育树等信息，用于揭示该病毒在不同环境梯度下的基因型差异、季节变化规律及宿主关联。 文件详解 alignments_and_trees.zip 文件格式：ZIP...
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Dryad_Based_人科动物进化基因组学研究数据集_2016
数据集概述 本数据集是基于人、黑猩猩、大猩猩和红毛猩猩的基因组，通过软件生成的同源序列数据集，包含匿名基因座（AL）、锚定基因座（AE）等多种类型的基因座数据，用于分析人科动物的进化关系、祖先有效种群大小和物种形成时间，为基因组系统发育研究提供标准化的分析数据。 文件详解 文档文件（.txt）...
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HiBC_Based人类肠道细菌基因组序列数据集20240717
数据集概述 本数据集为人类肠道细菌集合（HiBC）的基因组序列数据，包含从人类肠道分离的细菌菌株的16S rRNA基因序列、基因组序列及培养条件，涵盖已知细菌及新物种菌株，定期更新。本次提供的是FASTA核苷酸格式的基因组序列压缩包，质粒序列位于文件末尾，已修正前期错误及分类学拼写问题。 文件详解...
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Dryad_Archive_Vitis属系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集围绕葡萄属（Vitis）系统发育基因组学研究，提供基于Vitis9kSNP阵列的杂交强度与基因型数据。研究旨在解决SNP阵列分析中的 ascertainment bias 问题，通过对比杂交强度数据与传统基因型数据的系统发育重建效果，优化进化关系解析方法，支持葡萄属物种进化研究。 文件详解 文件名称：dryad.zip...
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Ophidiomyces_蛇类真菌病qPCR基因分型检测研究数据
数据集概述 本数据集围绕蛇类真菌病病原体Ophidiomyces ophidiicola的qPCR基因分型检测方法开发与应用展开，包含检测方法设计、验证数据及实际样本分型结果，用于研究该病原体的地理、分类学及时间分布偏好，助力蛇类真菌病流行病学分析。 文件详解 README_Haynes_2023.txt 文件格式：TXT...
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hym_v2_Bait_Set_蚂蚁膜翅目基因组系统发育研究数据
数据集概述 本数据集包含用于研究蚂蚁和膜翅目基因组系统发育的增强型UCE诱饵集及相关分析数据。通过优化UCE基因座识别和诱饵设计流程，新增2590个膜翅目UCE基因座，覆盖16/17蚂蚁亚科的84个分类群数据，验证了高捕获成功率，支持系统发育树构建，并整合传统标记生成综合蚂蚁系统发育数据。 文件详解 文件名称：appendix2-supporting-...
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Dryad_Based高等白蚁肠道细菌群落结构与饮食关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕高等白蚁肠道细菌群落结构展开，通过16S rRNA基因扩增子文库分析18种高等白蚁，探究饮食对其肠道细菌群落结构的影响。数据显示饮食是决定群落结构的主要因素，相同饮食组内同亚科白蚁肠道群落更相似，为微生物共生消化研究提供支撑。 文件详解 系统发育与分类数据文件...
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Dryad_Based_几维鸟杂交研究微卫星基因型数据_2021
数据集概述 本数据集包含几维鸟（Apteryx spp.）的微卫星基因型数据，支持对几维鸟杂交现象的研究，涉及行几维鸟（A. rowi）与小斑几维鸟（A. owenii）的杂交分析，以及对大斑几维鸟分类学修订的探讨。数据来源于Dryad平台，由Kristina M Ramstad收集整理。 文件详解 Readme文件...
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Grand_Based_系统发育推断离散特征处理方法比较研究数据
数据集概述 本数据集为系统发育推断中离散特征处理方法的比较研究相关数据，包含模拟与实证示例分析结果，涉及无序/有序简约法、三项陈述法等特征处理方式，通过ITRI指标评估解析力与伪解析度，对比不同方法的优劣，共含6个文件。 文件详解 文件名称：Grand et al. SOM 1.xlsx 文件格式：XLSX...
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Helianthus_Based_二倍体向日葵属系统发育研究数据
数据集概述 本数据集包含二倍体向日葵属（Helianthus）物种树估计的相关数据，基于37个物种/亚种的103个样本，通过目标富集技术获取170个基因进行系统发育分析。数据涵盖合并与联合分析结果，支持向日葵属三大分支（一年生分支、两个多年生分支）的划分，为研究该属进化、生态过程及形态特征演变提供基础。 文件详解...
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Domerguella_Based马达加斯加矮壁虎修订原始数据集
数据集概述 本数据集为马达加斯加矮壁虎Domerguella亚属修订研究的原始数据，包含基因序列数据库、系统发育分析文件、补充表格及形态测量数据等5份文件，覆盖基因、系统发育、引物及PCR方案、形态测量等研究维度，支持矮壁虎分类学及相关生物学分析。 文件详解 基因序列数据库文件...
