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CHARMM_Drude_OpenMM_7_5_0_PURE_POPE膜分子动力学模拟数据
数据集概述 本数据集为采用CHARMM-Drude力场、通过OpenMM 7.5.0模拟引擎生成的纯POPE膜分子动力学模拟数据。包含300纳秒模拟数据（分3个子轨迹，每段100纳秒），共3000帧，采样频率100皮秒，前50纳秒为平衡期已剔除。数据涉及144个POPC脂质分子及5040个SWM4-NPD水分子，含修正时间戳的轨迹文件。 文件详解...
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Zenodo_Based_BNA与LNA_ASO对ASO_RNA双链结构稳定性影响研究数据集
数据集概述 本数据集为论文“Bridged Nucleic Acid ASOs over Locked Nucleic Acid ASOs and their impact on the structure and stability of ASO/RNA...
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Cavitation_Valve_Based_控制阀初生空化识别及水力特性分析数据_2024
数据集概述 本数据集为论文“Identification of Incipient Cavitation in Control Valve”配套数据，包含控制阀不同开度下的水力特性测量数据与计算结果，涉及流量、压力、空化数等参数，还涵盖振动、压力、噪声的频谱分析及气液体积分数模拟结果，共包含2个文件。 文件详解 ReadMe.txt 文件格式：TXT...
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Dataset_manuscript_based_细胞色素bc1_Qo位点质子转移路径模拟数据
数据集概述 本数据集为支持手稿研究而构建，包含细胞色素bc1中Qo位点质子转移路径相关的分子动力学模拟初始构型与拓扑文件，可用于复现该研究的核心模拟过程，探究Qo位点的柔性、水合作用对质子转移多路径的影响机制。 文件详解 文件名称：structure_and_topology.zip 文件格式：ZIP...
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Space_Radiation_Shielding_Efficacy_梯度复合结构屏蔽效能数据
数据集概述 本数据集围绕梯度复合结构的空间辐射屏蔽效能展开，包含模拟与测试相关的核心数据，为研究空间辐射防护材料性能提供支持，助力分析梯度复合结构在空间辐射环境中的屏蔽效果。 文件详解 文件名称：Space Radiation Shielding Efficacy data worksheet.xlsx 文件格式：.xlsx...
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MD_dynamics_data_Based_改进型光控致幻剂计算设计模拟数据_archive
数据集概述 本数据集为改进型光控致幻剂的计算设计模拟数据，包含LSD及化合物1、34的顺反异构体的动力学模拟输入文件、配体-蛋白结合自由能数据，以及伞形采样模拟窗口示例和平均力势谱，用于分析光吸收、膜渗透及蛋白结合特性。 文件详解 inputs文件夹...
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GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据
数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
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Virtual_screening_Based_牛奶蛋白甜肽虚拟筛选及分子动力学模拟机制分析数据
数据集概述 本数据集围绕牛奶蛋白甜肽的虚拟筛选及分子动力学模拟机制分析展开，包含5个Excel文件，涉及甜肽预测结果、牛奶蛋白虚拟水解序列、苦味预测结果及ADMET相关数据，为蛋白质组学中甜肽的筛选与机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：ADMET.xlsx 文件格式：XLSX...
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Auroral_Boundary_Geomag_Based极光赤道向边界地磁数据分析数据2020
数据集概述 本数据集为Blake等人2020年发表于《Journal of Geophysical Research, Space Physics》的论文配套数据，包含历史与模拟地表磁场数据，用于估计极光赤道向边界的最大范围，同时提供相关Python代码，支持数据计算与分析。 文件详解...
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卡罗利_德_让_Caroli_de_Gennes_关于杂质存在下马约拉纳费米子涡旋态区分的研究数据
数据集概述 本数据集为论文“Can Caroli-de Gennes-Matricon and Majorana vortex states be distinguished in the presence of impurities?”配套的代码与数据压缩包，包含1个文件，用于研究杂质存在时两种量子涡旋态的区分问题，支持相关量子物理分析。 文件详解...
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MD_dynamics_data_Based_Oxyluciferin发光物种结构分析数据_压缩包
数据集概述 本数据集聚焦于Oxyluciferin发光物种在水溶液和荧光素酶介质中的结构分析，包含1个压缩文件，未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理数据集，无自述文件或内容预览，可用于相关分子结构研究。 文件详解 压缩文件 文件名称：MD_dynamics_data.zip 文件格式：ZIP...
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Competitive_Propagation_多平面应变水力裂缝跨粘滞与韧性主导区竞争扩展模拟数据
数据集概述 本数据集为论文Figure 11对应的模拟数据，聚焦多平面应变水力裂缝在粘滞主导区与韧性主导区的竞争扩展过程。数据以单一文件形式呈现，用于支持相关模拟结果的验证与分析。 文件详解 文件名称：Data-Figure 11.xlsx 文件格式：XLSX...
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Enhancing_ReaxFF_DFT_Based_LiF力场重参数化数据库_V1_0_0_beta
数据集概述 本数据集为LiF无机化合物ReaxFF力场重参数化所用的DFT数据库，旨在提升LiF体系ReaxFF计算的准确性与可靠性。数据库包含LiF相关DFT模拟数据及元数据，支持通过ASE命令行、网页界面及Python接口进行交互，可用于锂离子电池分子动力学模拟的力场优化研究。 文件详解...
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EU_DEMO_Based_EU_DEMO_HCPB和WCLL_BB_FW破裂涉及通道数量及流动面积数据
数据集概述 本数据集记录了EU DEMO项目中HCPB和WCLL两种Breeding Blanket概念下，FW（First Wall）破裂后涉及的通道数量及对应的流动面积。包含0.01平方米、0.1平方米（小破裂）和1平方米、2平方米、5平方米（大破裂）五种破裂尺寸，以及两种破裂传播方向（先极向再环向、先环向再极向）的模拟结果。 文件详解...
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Ubiquitination_Pathway_Based_人类泛素化通路E3酶功能多样性与结构无序分析数据
数据集概述 本数据集围绕人类泛素化通路展开，整合KEGG BRITE数据库及文献中的E3酶序列，收录563个人类E3酶的物理特征数据，重点分析其结构无序性，还包含E3酶功能机制相关的分子动力学分析结果，为泛素化系统研究提供支撑。 文件详解 补充表格文件（Supplementary Table系列） 文件名称：Supplementary Table...
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MD_Snapshots_Based_ɑ_hairpinin支架工程构建钾离子通道阻滞剂分子动力学模拟数据
数据集概述 本数据集包含25组Kv1.3通道与Tk-hefu肽类似物复合物的分子动力学（MD）模拟快照，记录模拟初始（0ns）和结束（110ns）状态，同时附带2份通道与肽间分子间相互作用分析的Excel表格，为钾离子通道阻滞剂研究提供结构动态数据支持。 文件详解 压缩文件（Kv1.3_Tk-hefu-deriv_complexes.zip）...
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基于AlphaFold2的SARS_CoV_2奥密克戎刺突蛋白与ACE2受体构象及结合机制分析结果_压缩文件
数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2刺突蛋白Omicron变体与ACE2受体的复合物展开，通过AlphaFold2构建的结构集合及分子动力学模拟，探索其构象景观与结合机制，为病毒-受体相互作用的研究提供支撑。 文件详解 压缩文件 文件名称：SpikeProteinsResultsUpdated.zip 文件格式：ZIP...
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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据
数据集概述 本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。 文件详解 源数据文件 文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...
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ParabolicCrackPaths_Based_预测抛物线裂纹路径对功能梯度传动齿轮固有频率影响的研究数据
数据集概述 本数据集为研究预测抛物线裂纹路径对功能梯度传动齿轮固有频率影响的配套Excel数据，包含2个文件，分别记录材料特性和裂纹齿轮的分析结果，用于支持相关机械性能研究。 文件详解 文件名称：Material Properties.xlsx 文件格式：XLSX...
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脂质驱动的HCV_p7二聚体模拟_坐标与拓扑文件
数据集概述 本数据集包含脂质驱动的HCV p7二聚体模拟相关的坐标与拓扑文件，以压缩包形式存储，为研究HCV p7蛋白结构及脂质环境下的模拟过程提供数据支持。 文件详解 文件名称: p7_dimer_systems.zip 文件格式: ZIP压缩包 (.zip) 内容说明: 压缩包内包含脂质驱动的HCV...
