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Saccharomyces_cerevisiae_Hsp90点突变适应性研究数据
数据集概述 本数据集记录了酿酒酵母Hsp90蛋白区域内所有可能点突变在四种环境条件下的系统性适应性测量结果,揭示环境变化下适应性景观的变化规律,为分子进化中适应性作用的研究提供数据支持。 文件详解 环境条件数据集(共4个) 文件名称:30C-S.xlsx、30C+S.xlsx、36C+S.xlsx、36C-S.xlsx 文件格式:XLSX...
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PRJNA397360_Based_海洋硅藻热耐受性分子进化环境波动影响实验数据
数据集概述 本数据集为海洋硅藻热耐受性分子进化研究的配套实验数据(分子数据存储于SRA数据库Bioproject PRJNA397360),包含生长速率、代谢、细胞生理指标等9个文件,覆盖祖先及进化100、300代样本的热耐受性、光合作用、呼吸、细胞体积、碳氮比、RNA/蛋白质含量等指标,用于分析环境波动对其热耐受性进化的影响。 文件详解...
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Limonium_Plastome_Based质体基因组重复分析补充数据2021
数据集概述 本数据集是论文《Plastome analysis unveils Inverted Repeat (IR) expansion and positive selection in Sea Lavenders》的补充材料1,包含四种Limonium植物质体基因组的重复分析结果,为研究该属植物质体基因组结构特征提供数据支持。 文件详解...
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Domestication_Based_家养与野生动物线粒体基因组分子进化比较数据
数据集概述 本数据集围绕家养与野生动物线粒体基因组分子进化模式展开研究,包含家养哺乳动物、鸟类及其野生近缘种的线粒体基因组序列对比分析数据。通过16组系统发育独立比较,探究驯化对线粒体进化的影响,涉及分支长度、dN/dS比值等关键指标,为分子进化研究提供结构化数据支持。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_Data and...
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Zygaenidae_Based_鳞翅目Zygaenidae科系统发育与化石综述数据
数据集概述 本数据集为鳞翅目Zygaenidae科系统发育研究的分析数据,包含用于构建系统发育树的基因序列比对文件、BEAST分析输入文件及化石综述相关内容,支持主要支系年龄估算与化石记录整理,共6个文件,服务于昆虫系统学研究。 文件详解 Zygaeninae.txt 文件格式:TXT...
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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据
数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件(UCE)诱饵集,包含36个半翅目样本(覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属)及1个缨翅目外群的UCE数据,同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果,可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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RNA_Editing_Based苔藓植物细胞器基因编辑位点与PPR蛋白关联研究数据
数据集概述 本数据集包含42种苔藓植物的细胞器基因RNA编辑位点及核编码PPR蛋白序列数据,涵盖31种非地钱类苔藓植物的128个细胞器基因中7428个RNA编辑位点,以及25059条PPR蛋白序列。数据可用于研究RNA编辑位点数量与GC含量、核PPR蛋白多样性的关联,是探索植物RNA编辑进化机制的基础数据。 文件详解 模型文件(org-nt-...
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Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据
数据集概述 本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果,包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本,可支持物种系统发育与种群遗传学研究,共6个文件。 文件详解 序列比对文件 文件名称:Alignment_for_RAxML.phy 文件格式:PHY...
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Schneider_2020_Ochnaceae科核基因靶向富集系统基因组学研究数据
数据集概述 本数据集包含Ochnaceae科植物的DNA序列比对文件,涵盖单个基因比对和所有基因串联比对结果,以及用于核基因靶向富集的探针序列诱饵集。数据支撑相关论文中的系统发育分析,涉及超过250个分类群,共6个文件。 文件详解 串联比对文件...
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JHR_补充材料1_2016美国东部Leptopilina物种COI基因序列差异数据
数据集概述 本数据集为《美国东部Leptopilina属(膜翅目、环腹瘿蜂总科、Figitidae科、Eucoilinae亚科)综述》的补充材料1,记录了Leptopilina属物种间细胞色素氧化酶亚基I基因条形码区域的序列差异百分比,含物种内差异(粗体值)、样本量及新描述物种标记,共1个文件。 文件详解 文件名称:oo_115531.docx...
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Dryad_Source_Euglenozoa特异性DNA聚合酶序列数据_20230912
数据集概述 本数据集聚焦眼虫门(Euglenozoa)特异性家族A DNA聚合酶(famA DNAPs)的研究,通过分析33个吞噬性眼虫和2个共生体的单细胞转录组数据,新增16条famA DNAP序列,用于探讨眼虫门famA DNAPs的多样性与进化历程,补充该类群基础分支物种序列数据的空缺。 文件详解 README.md 文件格式:Markdown...
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Synergus_nanlingensis_Based_新物种线粒体tRNA预测折叠模式数据
数据集概述 本数据集为新物种南岭协同瘿蜂(Synergus nanlingensis)线粒体基因组tRNA的预测折叠模式数据,是相关研究论文的补充材料6,用于展示该物种线粒体tRNA的二级结构预测结果,支持昆虫线粒体基因组的分子生物学研究。 文件详解 文件名称:oo_1000069.docx 文件格式:DOCX...
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Adiantum_Pteridaceae_based_铁线蕨属质体RNA编辑频率变异研究数据
数据集概述 本数据集记录了铁线蕨属(Adiantum)三种植物(A. aleuticum、A. shastense、A. capillus-veneris)的质体RNA编辑位点信息。通过比较三种植物的编辑位点数量、位置及类型差异,揭示铁线蕨属内RNA编辑频率的快速进化特征,为蕨类植物质体基因组研究提供基础数据。 文件详解...
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In_solution_Hybridization_Based_哺乳动物线粒体基因组富集探针测试数据
数据集概述 本数据集记录基于RNA探针的哺乳动物线粒体基因组溶液内富集实验结果,包含7个目哺乳动物探针集的设计与测试数据,涉及5个目22属共63个线粒体基因组的覆盖度、回收率等关键指标,以及探针捕获能力的聚类分析结果,为退化DNA的线粒体基因组富集研究提供支撑。 文件详解 序列文件...
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Saxicola_Based_比较线粒体基因组学系统发育与生物地理学研究补充材料
数据集概述 本数据集为论文《Saxicola属(鸟纲,雀形目)选定物种的比较线粒体基因组学、系统发育与生物地理学》的补充材料2,包含线粒体基因组系统发育分析及分化时间估算中使用的子集划分、最优模型和位点信息,为鸟类进化研究提供支持。 文件详解 文件名称:oo_1393921.docx 文件格式:DOCX...
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Fisher_Wright_Based_蛋白质编码基因非同义同义替换率比计算数据
数据集概述 本数据集基于群体遗传学基本原理,提供蛋白质编码基因非同义与同义替换率比的计算公式,涉及两种理论案例及叶绿体基因、病毒聚合酶的实际数据案例,可用于分析非同义替换动态,为自适应进化检测方法开发提供参考。 文件详解 文件名称:data.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含支持Fisher-...
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Patella_Based_Canary_Islands濒危帽贝遗传分化研究数据
数据集概述 本数据集为Canary Islands濒危帽贝Patella candei candei的遗传分化研究数据,包含SNP数据集及COX1序列分析输入文件,支持种群遗传结构、物种分类关系及保护单元划分的研究,共5份文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Le_Clercq_2022_Based_鸟类迁徙遗传学系统综述与比较分析数据集
数据集概述 本数据集包含用于综述与元分析"Time trees and Clock genes: a Systematic Review and Comparative Analysis of Contemporary Avian Migration...
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Mesodesma_donacium_SNP_Based_基因注释与多态性分析数据
数据集概述 本数据集围绕软蛤Mesodesma donacium的表达序列标签(EST)数据展开,通过454焦磷酸测序生成180159条EST,经从头组装得到10178个contigs和41765个singletons,最终发现2594个SNP位点,涉及613条共识序列,还包含基因本体(GO)分析及SNP验证相关信息,为该物种遗传研究提供基础数据。...
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ZooKeys_补充材料1_异叶金光菜与瘿蚊传粉共生系统系统发育分析数据_2025
数据集概述 本数据集为论文《Sympetalous Heterosmilax(菝葜科,百合目)与在脱落雄花中繁殖的瘿蚊(瘿蚊科,双翅目)之间的新型繁殖地传粉共生关系》的补充材料1,包含系统发育分析中使用的分类单元及对应的GenBank登录号,支持植物与昆虫共生系统的进化关系研究。 文件详解 文件名称:oo_1313263.docx 文件格式:DOCX...



