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OGRDB_Based_人类IGH_VDJ免疫受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的人类IGH_VDJ免疫受体种系参考集，包含7个文件，涵盖FASTA格式的序列文件、JSON格式的元数据文件及许可说明文件，为免疫受体相关研究提供标准化参考数据。 文件详解 许可文件 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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mtIdh_Pogonus_chalceus甲虫种群进化历史数据
数据集概述 本数据集围绕大西洋欧洲沿岸Pogonus chalceus甲虫的mtIdh基因进化历史展开，包含该基因座的序列变异、种群分布及相关分析脚本。通过比较短翅与长翅种群在异地和同域尺度下的mtIdh等位基因差异，揭示适应性进化机制，为研究扩散相关性状的局部适应和种群动态提供支持，共含4个文件。 文件详解 Tree_files.rar...
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OGRDB_Based_AKR_J小鼠IGLV受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于开放种系受体数据库（OGRDB）的小鼠AKR/J亚群IGLV受体种系参考集，包含4个相关文件，涵盖种系序列的带间隙、无间隙FASTA格式文件、JSON格式数据及许可文件，为免疫受体序列分析提供标准化参考数据。 文件详解 J IGLV_rev_1_gapped.fasta 文件格式：FASTA...
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Dryad_Based_东南亚兜兰属网状进化与海平面波动研究数据
数据集概述 本数据集为东南亚兜兰属（Paphiopedilum）物种多样化研究的支撑数据，包含基于8个叶绿体DNA区域和4个低拷贝核基因的序列比对、系统发育树文件、BEAST分析文件及SplitsTree网络分析文件，用于探究网状进化与海平面波动对该属物种分化的驱动作用，共4个压缩文件。 文件详解 文件名称：Alignment of the...
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Local_adaptation_Based_数据集脚本与序列数据
数据集概述 本数据集包含与本地适应性相关的数据集、脚本及序列文件，共九个文件。主要涵盖汉密尔顿氏菌（Hamiltonella）的多个基因序列、蚜虫（Aphid）及寄生蜂（Parasitoid）的COI序列，以及数据集和脚本文件，可用于生物信息学领域的本地适应性研究。 文件详解 序列文件（.fas/.fa/.fasta格式）...
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CmeA_Based周质适配蛋白预测结构及CmeABC组装模型数据
数据集概述 本数据集包含CmeA周质适配蛋白的预测结构、序列比对结果，以及CmeABC转运蛋白复合体的完整组装模型，内容源自Kahlan Newman博士论文的第六章。数据以单个压缩文件形式呈现，为研究CmeA蛋白结构与功能及CmeABC复合体组装机制提供支持。 文件详解 文件名称：Chapter_6.zip 文件格式：ZIP...
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数据16S_rDNA_Based_吸虱内共生菌谱系数量估算研究数据
数据集概述 本数据集围绕16S rDNA采样策略对吸虱内共生菌谱系数量估算的影响展开，包含用于系统发育分析的序列与树文件。通过对比不同γ变形菌序列采样方式，探究其对内共生菌多样性估算的作用，涉及新测与已有16S rDNA序列及超过42000条其他γ变形菌序列，还通过参数与非参数 bootstrap实验分析系统发育误差影响。 文件详解...
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Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据
数据集概述 本数据集为鞭蛛（Amblypygi）全球系统发育研究相关数据，包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档，支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究，共5个文件，覆盖3种文件格式。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...
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IJMS_Skorupski_J_欧洲水鼬线粒体基因组研究补充文件
数据集概述 本数据集是期刊文章《极度濒危物种欧洲水鼬（食肉目：鼬科）完整线粒体基因组特征及其对物种保护遗传学的意义》的补充文件，包含与欧洲水鼬线粒体基因组研究相关的补充信息，为该物种的保护遗传学研究提供支持。 文件详解 文件名称：Skorupski_J._Supplementary_File_IJMS.docx 文件格式：DOCX...
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BEAST_Based_印尼基孔肯雅病毒多站点流行病学研究支持数据
数据集概述 本数据集为印尼被忽视地区基孔肯雅病毒流行病学多站点研究的支持数据，用于基于BEAST v1.10.4的病毒序列系统发育分析。包含6个相关文件，涵盖序列比对、元数据、分析配置及结果文件，支持病毒进化研究。 文件详解 IDN_CHIK_metadata.txt 文件格式：TXT...
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Kamchatka_Based堪察加半岛同域红点鲑物种分化研究数据
数据集概述 本数据集记录堪察加半岛中流区域同域分布的部分溯河性多莉瓦登红点鲑与河栖石红点鲑的生物生态差异，包括形态特征、基因流动限制及环境分化证据，支持基于 trophic 的高纬度流域同域分化假说，含4个相关文件。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：可能包含数据集整体说明、研究背景、文件清单及使用指引等文档内容...
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Boechera_Data_from_生态基因组学模型系统研究数据
数据集概述 本数据集围绕Boechera属展开，该属是生态进化功能基因组学研究的典型模型系统，具备原生种群稳定、与拟南芥亲缘近、可培育近等基因系、支持种间杂交遗传分析、含可遗传无融合生殖及北美广泛分布等特征，含2个数据文件。 文件详解 Alignments.zip 文件格式：ZIP...
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Korábek_Based_欧洲陆生蜗牛冰期避难所南北扩张研究数据
数据集概述 本数据集为欧洲陆生蜗牛冰期避难所及冰期后扩张研究的关联数据，涉及4种肺螺类陆生蜗牛（Monachoides incarnatus、Helix pomatia、Helix thessalica、Caucasotachea...
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mtDNA_Based_roe_deer线粒体渐渗进化中性研究数据
数据集概述 本数据集围绕roe deer（狍属）线粒体DNA（mtDNA）渐渗的进化中性展开研究，包含16个欧洲狍（Capreolus capreolus）和西伯利亚狍（C....
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DRYAD_Source_蜂鸟甜味感知进化与鲜味受体转化研究数据集
数据集概述 本数据集围绕蜂鸟甜味感知进化机制展开，聚焦其祖先鲜味受体（T1R1-T1R3异二聚体）向碳水化合物受体的转化过程。数据包含受体基因序列比对文件与实验分析表格，支撑蜂鸟味觉受体功能改变促进物种辐射的研究结论，共8个文件。 文件详解 序列比对文件（.fasta格式，共4个）...
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WAP65_HPX_Based鱼类与哺乳动物基因适应性进化分析数据
数据集概述 本数据集围绕鱼类暖温适应相关蛋白（WAP65）及其哺乳动物同源物血红素结合蛋白（HPX）的适应性功能分化展开，包含系统发育树、序列比对、选择压力分析等5类压缩文件，支持基因进化动力学、蛋白质功能差异及三维结构的研究。 文件详解 系统发育树文件 文件名称：PhylogeneticTree.zip 文件格式：ZIP...
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wrynecks_Based糖感知选择性丧失研究数据_生物进化分析
数据集概述 本数据集围绕啄木鸟科鸟类味觉受体进化展开，聚焦 wrynecks 单氨基酸突变导致糖感知选择性丧失的分子机制，包含受体序列比对、祖先序列重建、实验结果表格及食性数据等，用于研究脊椎动物感官受体逆转的分子基础与结构功能关系。 文件详解 序列文件（.fasta格式）...
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Tigriopus_Based加州哲水蚤异域进化转录组分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕海洋桡足类加州哲水蚤（Tigriopus californicus）的异域进化展开，包含转录组全基因组分化与多态性的分析数据。通过对不同分化阶段的种群进行比较，探究非适应性过程（如遗传漂变）与适应性进化对基因组分化模式的影响，揭示进化在基因层面的可预测性。数据集含16个文件，涵盖说明文档与压缩包两类。 文件详解...
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MALDI_TOF_Based_考古与现代鱼类骨胶原质谱及序列数据
数据集概述 本数据集包含考古（Oncorhynchus属）与现代（Salmo salar）鱼类骨胶原的MALDI-TOF质谱数据及相关序列信息，含样本信息CSV、质谱文本文件压缩包、胶原序列比对FASTA及注释GFF文件，共6个文件，用于生物考古领域的物种鉴定与胶原特征分析。 文件详解 样本信息文件 文件名称：file-information.csv...
