数据集 - 海数据

数据集概述本数据集为论文《从晶体学多构象模型集合绘制相关蛋白质结构中的变构重连》的补充材料，包含PTP酶qFit多构象模型的RINFAIRE网络分析相关文件，支持复现研究中的数据分析过程。文件详解 README.md：Markdown格式说明文档，介绍数据集背景、关联论文及使用指引...

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斑点鱥入侵种群遗传多样性与瓶颈效应研究数据集

数据集概述本数据集围绕斑点鱥入侵种群的遗传多样性与瓶颈效应展开，通过分析微卫星位点和线粒体DNA基因的变异，识别入侵种群的来源并评估瓶颈效应，为探究遗传多样性对入侵成功的限制作用提供数据支持。文件详解 README_for_mtDNA.pdf：PDF格式，线粒体DNA数据说明文档...

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NCLDV核心基因蛋白比对与系统发育树附加数据集

数据集概述本数据集包含NCLDV（核质大DNA病毒）家族核心基因的蛋白比对数据和系统发育树数据，以压缩包形式存储，为病毒基因进化与分类研究提供基础数据支持。文件详解文件名称: Additional data.zip 文件格式: ZIP压缩包内容说明: 压缩包内包含以下类型文件蛋白比对文件: 采用FASTA格式存储系统发育树文件:...

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弹_蚁双扩散阶段权衡与协同关系数据集

数据集概述该数据集聚焦植物弹-蚁双扩散（diplochory）的两个阶段（弹裂扩散与蚂蚁扩散），通过实测和文献整理的方式收集了91种大戟科植物的扩散投资数据，以及210条记录（148种植物）的扩散距离数据，用于检验两阶段间的权衡或协同关系假设。文件详解 Table S1-4.xlsx:...

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Maker_Based_Eukaryotic_Genome_注释完整数据

数据集概述本数据集包含使用Maker工具进行真核生物基因组注释的输入与输出数据，涵盖基因组序列、注释结果、统计报告及训练模型等23个文件，为基因组功能注释研究提供完整数据支持。文件详解该数据集由多种类型文件组成，具体说明如下： - 基因组序列与注释文件： - genome.fasta：FASTA格式，基因组原始序列文件 -...

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巴西大西洋森林特有蟾蜍多样性起源研究数据集

数据集概述本数据集围绕巴西大西洋森林特有蟾蜍（Rhinella crucifer物种复合体）的多样性起源展开，通过多基因座DNA序列数据与近似贝叶斯计算（ABC）方法，探究地理屏障与更新世避难所在物种分化中的作用，为理解该区域生物多样性形成机制提供数据支持。文件详解数据集包含6个文件，按类型分类说明如下： - 基因序列文件（FASTA格式）： -...

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语言模型中蛋白质家族与功能的高关注位点分析数据集

数据集概述本数据集围绕语言模型中蛋白质家族与功能的高关注位点展开，包含热图、PFAM序列、相似性分析及多序列比对等相关压缩文件，为研究蛋白质家族与功能的关联提供数据支持。文件详解压缩文件: heatmap.zip: ZIP格式，可能包含蛋白质关注位点的热图数据 pfam_fasta.zip:...

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真菌星球2023年6月_马氏座壳孢数据集

数据集概述该数据集围绕2023年6月真菌星球（Fungal Planet）发布的马氏座壳孢（Aschersonia mackerrasiae）展开，包含该真菌的系统发育分析相关数据，为研究其分类地位和演化关系提供支持。文件详解文件名称：Aschersonia mackerrasiae...

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曼氏血吸虫组装染色体与ZW性别决定系统进化数据集

数据集概述该数据集提供曼氏血吸虫组装染色体数据，其基因组约380MB，含7对常染色体和2条性染色体。数据基于Wellcome Sanger研究所等机构的测序项目，经多轮组装优化，助力研究其ZW性别决定系统的进化机制。文件详解该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 基因组序列与注释文件： -...

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东南亚鸣禽复合体颜色与生物声学特征分化数据集

数据集概述该数据集围绕东南亚鸣禽复合体（Limestone Wren-babbler）的颜色与生物声学特征分化展开，包含基因组数据、线粒体序列、系统发育树、生物声学测量及支持信息，为研究形态与行为特征的进化关联提供数据支持。文件详解基因组与序列文件： kk05draftgenome.fasta：FASTA格式，鸣禽Limestone Wren-...

七种深水无脊椎动物分类学验证分子标记数据集

数据集概述该数据集包含用于七种深水无脊椎动物分类学验证的分子标记序列，以及用于总RNA质量评估的TapeStation数据。分子标记提取自转录组组装结果，RNA质量数据与已发表表格中的样本标识符相关联，为深海无脊椎动物的分类学研究提供支持。文件详解分子标记序列文件:...

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五瓣菟丝子转录组组装与寄生相关基因数据集

数据集概述本数据集为五瓣菟丝子（寄生植物）不同发育阶段（种子、幼苗、茎、吸器前体、吸器、花）的转录组从头组装及注释结果，通过分析关键基因类别（转运、胁迫响应、细胞壁修饰、激素相关等）的表达动态，揭示植物寄生过程的转录变化机制。文件详解转录组序列文件： Dodder_all_transcriptome.fa：FASTA格式，五瓣菟丝子全转录组序列...

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人类跨膜蛋白预测与可视化数据集2022

数据集概述该数据集包含四百九十六个人类跨膜蛋白的三维结构及膜嵌入预测结果，基于AlphaFold结构与蛋白语言模型生成，按α螺旋和β桶结构分类存储，提供多方法膜嵌入预测及可视化工具。文件详解核心压缩包: TMvis496.tar.gz:...

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YassourM_2016婴儿肠道微生物组数据集

数据集概述本数据集是经Nephele处理的YassourM_2016研究数据，聚焦婴儿肠道微生物组的自然发展历史，以及抗生素治疗对细菌菌株多样性和稳定性的影响，为相关医学研究提供数据支持。文件详解元数据与映射文件：...

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蜥蜴属Liolaemus杂交现象研究数据集

数据集概述本数据集围绕南美蜥蜴属Liolaemus中杂交现象展开研究，包含127个个体的12个核基因与2个线粒体基因分子数据，通过基因树冲突分析及新提出的“额外谱系贡献”统计方法，验证L. boulengeri和L. rothi复合体间的杂交假设，为理解该属进化中杂交的作用提供数据支持。文件详解 README_for_fasta-...

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拟南芥属基因组加倍后极端选择下八个减数分裂基因的核苷酸比对数据集