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两种小鼠帕金森病模型纹状体单核RNA测序数据集
数据集概述 该数据集包含两种小鼠帕金森病(PD)模型纹状体组织的单核RNA测序(snRNA-seq)数据,覆盖轻度神经毒素模型(6-OHDA)和进行性遗传模型(MitoPark)的不同病理阶段,可用于分析不同病因和阶段的转录组变化。 文件详解 文件名称: cragg-mouse-sn-rnaseq-striatum_README.pdf 文件格式:...
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多发性硬化症捐赠者正常表现中枢神经系统白质转录组分析数据集
数据集概述 本数据集包含多发性硬化症(MS)捐赠者正常表现中枢神经系统白质(NAWM)的 bulk RNA 测序数据及细胞轨迹 RNA 解卷积补充图像,聚焦不同 MS 亚型与对照组的分子特征差异。 文件详解 CSV 数据文件(共3个): TABLE...
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MUUMI多组学数据整合R包案例研究输入输出文件数据集
数据集概述 本数据集包含论文《MUUMI: an R package for statistical and network-based meta-analysis for MUlti-omics data Integration》中两个案例研究的输入与输出文件,支持复现研究结果,涉及特发性肺纤维化转录组数据及THP-1巨噬细胞多组学数据的整合分析。...
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小鼠出生后肌肉成熟转录组特征数据集_肌病相关基因研究
数据集概述 该数据集为发表研究“Transcriptomic characterization of postnatal muscle maturation in mice, with a focus on myopathy-associated...
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短柄草多倍体同源亚基因组与幽灵亚基因组溯源数据集
数据集概述 本数据集围绕短柄草属多倍体植物的亚基因组溯源展开,包含通过转录组系统发育、亚基因组检测算法及染色体条形码分析得到的结果,涉及现存二倍体物种及未知幽灵祖先基因组的鉴定,为解析多倍体形成机制提供数据支持。 文件详解 文档类文件: README_DRYAD_files.pdf: PDF格式,可能包含数据集文件说明、使用方法等文档内容...
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拟南芥冷响应转录组的可变剪接动态数据集
数据集概述 本数据集通过RNA测序分析拟南芥在低温胁迫下的转录组变化,聚焦可变剪接(AS)的动态响应。核心内容包括早期冷响应AS基因、转录因子及剪接调控因子的鉴定,揭示AS在植物低温适应中的作用,为研究植物低温耐受性的分子机制提供数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件,具体说明如下: - 数据文件(共16个,.xlsx格式): -...
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白血病细胞系REH多组学表征数据集
数据集概述 本数据集是关于白血病细胞系REH的多组学表征研究成果,包含通过短读长和长读长测序技术获得的基因组、转录组等多组学数据及分析结果,为深入研究REH细胞系的分子特征提供支持。 文件详解 覆盖深度分析文件:...
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芫荽转录组分析与萜类合酶基因表达量数据表
数据集概述 本数据集为芫荽(Coriandrum sativum L.)转录组分析中关于萜类生物合成相关基因的表达量数据表格,记录了不同发育阶段(S1、S2、S3)下各类萜类合酶基因的RPKM标准化表达量及差异倍数。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML...
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细菌次级代谢物诱导硅藻Thalassiosira_rotula生理与转录组响应修订补充材料
数据集概述 本数据集为研究论文《细菌次级代谢物诱导硅藻Thalassiosira rotula产生独特生理与转录组响应》的修订补充材料,包含实验相关的补充文档与表格数据,支持对细菌代谢物影响硅藻生理及基因表达机制的研究。 文件详解 文档文件: Supplementary...
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甘薯转录组EST_SSR摘要表3
数据集概述 该数据集为研究论文中的表格数据,呈现甘薯转录组中表达序列标签-简单重复序列(EST-SSRs)的统计摘要,包括检测序列数量、SSR总数、不同核苷酸重复类型分布等核心指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: 包含甘薯转录组EST-...
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造礁八放珊瑚蓝珊瑚转录组分析数据集2018
数据集概述 本数据集为2018年发表的造礁八放珊瑚蓝珊瑚(Heliopora coerulea)转录组分析研究相关数据,包含该珊瑚物种的转录组测序及分析相关文件,以压缩包形式存储。 文件详解 文件名称:Guzman.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip) 内容说明:压缩包内包含蓝珊瑚转录组分析研究的相关数据文件,具体内容需解压后查看,未提供预览信息...
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免疫检查点阻断反应生物标志物荟萃分析数据集
数据集概述 该数据集围绕免疫检查点阻断(ICB)反应的基因组与转录组生物标志物展开,包含超3600例患者的多癌种分析数据,涵盖小鼠模型与临床队列的表达、突变数据,支持ICB疗效预测及新靶点研究。 文件详解 文件名称: PredictIO.data.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含子数据集: mouseModel:...
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潜水减压病对人外周血转录组的急性影响补充数据集
数据集概述 本数据集为潜水减压病(DCS)相关研究的补充数据,通过RNA测序分析DCS患者与健康潜水者的外周血转录组差异,探究DCS的炎症病理生理与免疫反应机制,包含基因表达、差异基因分析等多类型文件。 文件详解 说明文档: PACE_DATASET_Readme.txt: TXT格式,包含数据集标题、作者信息等基础说明。 基因表达数据文件:...
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蜘蛛丝神经再生应用比较分析数据集
数据集概述 本数据集围绕不同蜘蛛丝在神经再生领域的应用展开比较分析,涵盖材料特性检测与施旺细胞响应相关的多维度实验数据,为研究蜘蛛丝作为神经修复材料的潜力提供基础数据支持。 文件详解 压缩文件(共4个): Atomic Force Microscopy.zip:原子力显微镜检测相关数据压缩包 Bulk RNA...
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Sphaerospora_molnari增殖阶段转录组数据集
数据集概述 本数据集是针对粘孢子虫Sphaerospora molnari增殖阶段的首个转录组数据,通过从头组装方法构建,包含宿主过滤和非宿主过滤的转录本序列,以及补充的qPCR验证文档。核心内容聚焦于该寄生虫感染早期上调的蛋白酶,为研究其宿主利用、免疫逃避机制及潜在药物靶点提供基础数据。 文件详解 文件名称:...
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中国春小麦端粒到端粒全基因组数据集CS_IAAS_v1_1
数据集概述 本数据集提供了六倍体小麦品种中国春的端粒到端粒(T2T)无间隙参考基因组CS-IAAS_v1.1,包含145.1亿碱基对,覆盖21个着丝粒和42个端粒,为研究小麦基因组演化、转录组及蛋白质组提供基础数据。 文件详解 基因组序列文件: CS-IAAS_v1.1.zip:压缩格式,包含中国春小麦全基因组序列数据 基因注释文件: CS-...
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性拮抗与性限制选择下的性别偏向基因表达数据集
数据集概述 本数据集围绕种子甲虫(Callosobruchus maculatus)在性限制(SL)或性拮抗(SA)选择下的性别偏向基因表达展开,包含研究中使用的数据及R分析笔记本,为探索性别特异性选择对转录组的影响提供支持。 文件详解 文件名称: zenodo_cmac_selection_lines_expression.zip 文件格式:...
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肝脂肪变性与脂肪性肝炎性别差异转录组功能元分析数据集
数据集概述 本数据集为《肝脂肪变性与脂肪性肝炎:转录组研究中性别差异的功能元分析》论文的结果与补充材料,包含7项转录组研究的表达矩阵、差异基因/通路分析结果、功能富集分析及元分析显著结果等,支持性别差异相关机制研究。 文件详解 该数据集包含8个压缩文件,具体说明如下: - 01_MatExp.zip:压缩文件,包含7项选定研究的基因表达矩阵 -...
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苔藓植物多样性系统发育与适应性基因组转录组数据
数据集概述 本数据集围绕苔藓植物的多样性、系统发育及适应性展开,基于基因组与转录组数据,包含1份补充数据文档,为相关研究提供基础资料。 文件详解 文件名称: 20220218 Supplementary data.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 该文档为苔藓植物基因组与转录组研究的补充数据,对应标题中的Table...
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鞘毛藻转录组中苯丙烷生物合成关键酶同源蛋白编码转录本系统发育数据集
数据集概述 本数据集包含鞘毛藻转录组中苯丙烷生物合成关键酶同源蛋白编码转录本的系统发育分析结果。数据基于de Vries等(2021)的比对文件扩展,经MAFFT重新比对后,用IQ-TREE和ModelFinder构建系统发育树,涵盖CAD、CSE、CCR等多类酶的分析文件。 文件详解...



