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GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据
2026年1月9日 30 19 5
数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
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Integrative_Structure_PTBP1_EMCV_IRES复合物溶液结构测定数据
2026年1月8日 30 62 9
数据集概述 本数据集包含RNA结合蛋白PTBP1与脑心肌炎病毒（EMCV）RNA内部核糖体进入位点（IRES）复合物的溶液整合结构模型及支撑数据，涵盖多组约束条件下的集合结构、DEER-EPR原始数据、SANS/SAXS曲线、约束文件及图表源数据，共27个文件，用于生物分子复合物结构研究。 文件详解 集合结构文件...
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ESRF_4XYD_Roseobacter_denitrificans硝酸还原酶晶体衍射图像数据
2026年1月8日 30 69 17
数据集概述 本数据集包含玫瑰杆菌（Roseobacter denitrificans）硝酸还原酶（NOR）晶体的X射线衍射图像，是PDB条目4XYD结构解析的原始数据来源。数据由ESRF收集，支持蛋白质三维结构研究，仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称：RdNOR_diffraction_images_4xyd.zip 文件格式：ZIP...
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Melittin_Recombinant_Based同位素标记蜂毒肽重组表达与化学酰胺化研究数据_SI
2026年1月2日 30 160 45
数据集概述 本数据集为蜂毒肽（Melittin）相关研究的补充数据，包含7个补充表格和25个PDB结构文件，记录了阳离子膜裂解肽列表、蜂毒肽骨架化学位移、15N-1H耦合参数、AlphaFold模型与RDC数据的拟合分析结果，以及实验涉及的蛋白质原子坐标，支撑同位素标记蜂毒肽的重组表达与化学酰胺化研究。 文件详解 表格文件（Excel格式）...
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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据
2025年12月29日 30 117 101
数据集概述 本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。 文件详解 源数据文件 文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...
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Pseudomonas_syringae_Supplementary_Data_PSSC基因组与毒力研究数据
2025年12月29日 30 122 38
数据集概述 本数据集为Pseudomonas syringae竞争与毒力研究的补充数据，包含2161个PSSC基因组的元数据、PCR引物评估结果、系统发育树、毒力因子HMM模型、基因检测结果、分类器及尾纤维结构预测等35个文件，支持相关章节的基因组分析、引物验证及毒力机制研究。 文件详解 基因组与元数据文件 文件名称：supplementary...
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Density_based_Many_body_Expansion_多肽与蛋白质密度基多体展开数据集_配套研究
2025年12月27日 30 151 138
数据集概述 本数据集为论文《The density-based many-body expansion for polypeptides and proteins》的配套数据，包含用于测试计算的结构文件、绘图脚本及输入脚本，支持复现论文中的计算与图表生成。 文件详解 压缩包文件 文件名称：dataset-zenodo-v2.zip 文件格式：ZIP...
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nmpro_x1311_PDB_5RFG_SARS_CoV_2_主蛋白酶与_PCM_0102372_复合物的原始衍射数据
2025年12月27日 30 97 78
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与小分子PCM-0102372复合物的原始衍射数据，对应ID为mpro-x1311及PDB编号5RFG。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线在XChem晶体学片段筛选实验中采集，原始数据可供重新分析使用。 文件详解 文件名称：mpro-x1311.zip 文件格式：ZIP...
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大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣功能研究数据集
2025年12月13日 30 123 1
数据集概述 本数据集包含支持大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣（NAC）活性研究的原始和处理数据，通过微量热泳动（MST）、NAC活性测定、RNA三维结构建模及蛋白-RNA复合物对接等方法获取，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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O_Buß与S_Jager补充数据集_β_酮酯酶水解HTS测定的统计评估
2025年12月25日 30 34 12
数据集概述 本数据集是O.Buß与S.Jager关于β-酮酯酶水解高通量筛选（HTS）测定统计评估研究的补充数据，包含计算用PDB结构文件、统计分析R脚本、活性测定校准数据及实验用酶的SDS-PAGE凝胶图片，为相关研究提供原始数据支持。 文件详解 该数据集包含5个文件，具体说明如下： - 统计分析R脚本压缩包: - 文件名称:...
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约束测试文件数据集
2025年12月9日 30 84 75
数据集概述 本数据集包含约束回归测试相关的文件，主要由行业基准系统和T4溶菌酶轨迹两部分组成，为约束测试的验证与分析提供数据支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - industry_benchmark_systems.zip:...
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Nudix超家族功能进化数据集
2025年12月23日 30 45 5
数据集概述 该数据集围绕Nudix超家族蛋白功能进化展开，整合了205个Nudix蛋白的实验与结构数据，修正并补充了基因本体注释，构建了序列比对与系统发育树，分析了水解酶基序下游环区的结构功能关系，揭示功能辐射的结构基础及系统发育规律。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 代码文件: - 3DCOMB_alignment.py:...
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Dan_Richmond_PhDThesis_Based_分子结构研究论文数据完整集合
2025年12月23日 30 198 157
数据集概述 该数据集为Dan Richmond博士论文的数据存储库，包含5,6-Tryp的PDB文件及分类图的HTML文件，共四个文件，支持论文相关研究分析。 文件详解 56Tryp.pdb：PDB格式文件，可能为5,6-Tryp相关的分子结构数据文件 FullClusterKrona.html：HTML格式文件，可能为全聚类分类图的可视化文件...
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C21ORF2与NEK1疾病突变域相互作用ColabFold建模原始输出数据集
2025年12月23日 30 201 165
数据集概述 本数据集为论文配套的ColabFold建模原始输出，核心内容是C21ORF2蛋白与NEK1疾病突变域相互作用的结构预测结果，包含蛋白质结构模型文件、评估图表及相互作用残基列表，为研究两者功能关联提供结构数据支持。 文件详解 蛋白质结构模型文件（共5个，PDB格式）：...
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CaVβ与肌动蛋白相互作用表面映射及钙通道清除作用HADDOCK对接数据集
2025年12月23日 30 41 6
数据集概述 本数据集包含HADDOCK蛋白质-蛋白质对接数据，用于构建CaVβ与F-肌动蛋白复合物模型，核心围绕两者相互作用表面映射及钙通道清除作用展开，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 该数据集为压缩文件，内部包含四个子文件夹，具体说明如下： - 压缩文件: Cavbeta-...
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RNA_Benchmark_Based_RNA基准数据集完整数据
2025年12月23日 30 63 55
数据集概述 本数据集为RNA相关基准数据，包含预测、CT等关键词相关内容，由六个压缩文件组成，覆盖序列、结构、多序列比对及预测结果等数据类型，为RNA研究提供基础数据支持。 文件详解 压缩文件集（共6个，均为.zip格式）： fasta.zip：可能包含RNA序列相关的FASTA格式文件...
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UBTR012574化学系列扩展数据集II
2025年12月22日 30 32 1
数据集概述 该数据集围绕UBTR012574化学系列的扩展展开，包含针对USP5锌指泛素结合域（ZnF-UBD）的分子对接模拟数据，用于优先化合物合成的研究。 文件详解 UBTR012574.pdb：PDB格式文件，可能为UBTR012574的分子结构数据...
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组蛋白变体H2A_Z转录调控的结构机制支持性数据集
2025年12月22日 30 70 43
数据集概述 本数据集是关于组蛋白变体H2A.Z转录调控结构机制研究的支持性数据，包含分子坐标、冷冻电镜图谱及验证报告等文件，为相关研究论文评审提供数据支撑。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： - 分子坐标文件: - 7M1X.pdb: PDB格式文件，存储H2A.Z核小体的分子坐标数据。 - 冷冻电镜图谱文件（.mrc格式）: -...
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嵌段比例优化阳离子聚丙烯酰胺电场下硝酸盐截留增强分子动力学模拟数据集
2025年12月21日 30 55 37
数据集概述 本数据集包含用于研究嵌段比例优化阳离子聚丙烯酰胺在电场下增强硝酸盐截留性能的分子动力学模拟数据及输入文件，涵盖平衡分子动力学（EMD）和非平衡分子动力学（NEMD）模拟的配置、力场和参数文件，支持复现相关研究结果。 文件详解 该数据集为压缩包格式，内部包含两个核心目录： - EMD/ 目录（平衡MD模拟，GROMACS软件）： -...
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大肠杆菌中关键GTP酶ObgE调控脂多糖合成研究数据集
2025年12月21日 30 147 122
数据集概述 本数据集是关于大肠杆菌中关键GTP酶ObgE调控脂多糖（LPS）合成的科学研究伴随数据，包含蛋白质相互作用、结构预测、质谱分析等实验结果，支持解析ObgE与LpxA相互作用对LPS合成及细胞生长的调控机制。 文件详解 该数据集包含94个文件，覆盖多种实验数据类型，具体如下： - 结构数据文件： -...
