快速演化辐射超保守元件分析数据集

数据集概述

本数据集围绕超保守元件(UCEs)在快速演化辐射类群(如雉科鸟类)系统发育研究中的应用展开,包含相关分析数据、补充文件及代码,用于评估多物种溯祖方法的性能,为解决复杂演化关系提供数据支持。

文件详解

  • 补充文件(PDF格式,共10个):如Supplementary File S1-S9、Figure S1/S4等,提供研究方法、结果图表及补充说明。
  • 数据文件(XLSX格式,共3个):如Supplementary File S1/S3/S2,包含实验数据或统计结果。
  • 代码文件(PL格式,共1个):SMRT-raxMRP.pl,用于SMRT-ML方法的分析脚本。
  • 压缩文件(GZ格式,共2个):Meiklejohn-et-al-UCE-data-unedited.tar.gz(UCE原始数据)、Meiklejohn-et-al-combined-evidence.nex.gz(联合证据数据集)。

适用场景

  • 系统发育学研究:评估UCE数据在解决快速演化辐射类群系统发育关系中的应用价值。
  • 演化生物学分析:比较不同多物种溯祖方法(如MP-EST、ASTRAL、Triplec)的性能差异。
  • 生物信息学方法开发:验证SMRT-ML等新型系统发育分析方法的有效性。
  • 鸟类演化研究:探究雉科鸟类等类群的快速辐射演化机制。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 7.81 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
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