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pcadapt_Source_选择基因组扫描模拟数据
2026年1月31日 30 1 0
数据集概述 本数据集为R包pcadapt的模拟数据，用于支持选择基因组扫描分析。pcadapt通过主成分分析检测受选择基因，可处理缺失数据和混池测序数据，适用于混合个体且无需分组。数据集包含2个文件，涵盖不同进化模型的模拟场景，支持与其他基因组扫描工具对比分析。 文件详解 README_for_simulations.txt 文件格式：TXT...
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DTT_Based_蛙类多样性时间动态估计方法与应用数据
2026年1月30日 30 43 13
数据集概述 本数据集为蛙类多样性演化历史分析相关数据，包含补充材料文档与分析脚本压缩包。数据围绕“利用分子系统发育估算物种多样性随时间变化”的研究主题，支持理解蛙类（尤其是古老物种贫乏类群）过去的多样性动态及演化机制，助力进化生物学领域相关分析。 文件详解 文件名称：DTT_Supplementary_Material.docx 文件格式：DOCX...
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comspat_Based_群落内物种组合空间组织分析数据
2026年1月30日 30 113 72
数据集概述 本数据集为R包comspat的配套数据，用于分析群落内物种组合的空间组织模式。包含网格或样带格式的生态数据，支持计算实现物种组合数（NRC）和组合多样性（CD），并提供零模型用于解析空间格局的驱动机制。数据集含6个文件，以.rda格式为主。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX...
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raptr_Based_生物多样性保护优先级选择R工具包数据
2026年1月29日 30 67 55
数据集概述 本数据集为raptr R包工具包，用于生物多样性保护规划中的优先级选择。该工具通过设置“数量目标”和“空间目标”，在确保每个保护对象（如物种、生态系统）获得足够保护面积的同时，捕获其内在或外在物理属性的代表性样本，以维持支撑生物多样性的生态进化过程，提高长期保护成效。 文件详解 文件名称：raptr-manuscript.zip...
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PolyPatEx_Based_多倍体物种亲子鉴定排除分析数据
2026年1月28日 30 103 22
数据集概述 本数据集包含用于多倍体物种亲子鉴定排除分析的PolyPatEx R包相关数据，涵盖微卫星标记数据、示例脚本及模拟文件。支持4n、6n、8n等倍性的同源多倍体物种，可处理已知等位基因拷贝数（基因型）或未知（等位表型）的标记数据，通过等位基因匹配排除与母子对不兼容的候选父本，为群体遗传学家研究多倍体交配模式提供工具支持。 文件详解...
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PrimerMiner_Based_COI引物开发与验证参考数据
2026年1月28日 30 46 18
数据集概述 本数据集是R包PrimerMiner的配套数据，用于DNA宏条形码引物的开发与计算机模拟验证。包含COI基因的参考序列数据，通过批量下载BOLD和NCBI数据库的序列并聚类为操作分类单元（OTUs）生成，支持针对特定类群或生态系统的引物优化，解决现有工具缺乏批量处理参考序列的问题。 文件详解 COI Folmer region.zip...
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Multi_DICE_R_Package_群体基因组比较推断测试数据
2026年1月27日 30 75 16
数据集概述 本数据集包含R包Multi-DICE的测试数据，该包用于在分层共同人口模型下进行比较群体基因组推断。数据支持验证软件功能，如应用替代推断框架、设置事件脉冲时间阈值及指定灵活超先验分布，适用于群体基因组学和比较系统地理学研究。 文件详解 1 Testing Inferential Frameworks.zip 文件格式：ZIP...
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DanubeDelta_MODIS_Based保护区卫星物候指标数据集
2026年1月26日 30 151 14
数据集概述 本数据集为多瑙河三角洲保护区的MODIS卫星物候指标数据，通过R包“phenex”基于卫星数据计算得到。使用改良BISE算法过滤NDVI，采用DLogistic方法建模NDVI曲线，包含物候期开始、结束、长度等9类指标，以及局部和全局阈值法推导的结果，共60个文件。 文件详解 数据文件（.nc格式） 文件名称示例：2015-modis-...
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perspectev_DRYAD_种上水平性状自然选择检测框架数据2015
2026年1月21日 30 54 18
数据集概述 本数据集为检测种上水平性状自然选择的研究框架相关数据，包含R包perspectev的实现文件及说明文档。该框架采用置换法，用于检验种上水平性状值与存活率的相关性是否无法简化为较低水平的相关性，适用于多种嵌套分组、性状类型及古今数据，可支撑宏观进化现象的实证研究。 文件详解 README_for_perspectev_DRYAD.txt...
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RRphylo_Based_人类面部三维模型进化速率映射方法补充数据
2026年1月25日 30 202 1
数据集概述 本数据集是论文“Human face-off: a new method for mapping evolutionary rates on three-dimensional digital...
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GenomeAdmixR_Based_基因组进化与祖先个体模拟分析数据
2026年1月23日 30 187 35
数据集概述 本数据集为R包GenomeAdmixR相关的模拟与分析文件，包含基因组进化与祖先个体模拟的代码、文档及软件包。GenomeAdmixR通过个体模型模拟混合后的基因组模式，支持选择、连锁和迁移等进化场景的模拟与分析，可用于验证理论预期、设计进化重测序（E&R）模拟等研究。 文件详解 软件包文件...
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GAIAH_Based_迁徙鸟类遗传同位素栖息地适应性联合分析方法数据
2026年1月22日 30 116 43
数据集概述 本数据集是迁徙鸟类Wilson's warbler的遗传分配与同位素、栖息地适应性联合分析研究数据，包含研究方法代码、示例数据及相关文档。研究通过贝叶斯法则整合高分辨率遗传标记、稳定同位素和栖息地适宜性模型，提升迁徙鸟类繁殖地空间推断准确性，相关方法已封装为R包GAIAH，支持其他迁徙动物系统应用。 文件详解...
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TipDatingBeast_Based_系统发育末端定年测试辅助工具数据
2026年1月21日 30 197 45
数据集概述 本数据集为R包TipDatingBeast的辅助数据，支持使用BEAST进行系统发育末端定年测试。数据包含两种核心功能相关文件：用于日期随机化分析的XML配置文件，以及用于留一法分析的日志压缩文件，可辅助评估数据集时间信号、校准序列一致性及潜在偏差。 文件详解 XML配置文件（共2个）...
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QstFstComp_Based_不平衡半同胞设计QST与FST比较分析数据
2026年1月20日 30 149 140
数据集概述 本数据集为QST与FST比较分析的辅助数据，支持检验种群间数量遗传分化（QST）与中性遗传标记分化（FST）的差异。扩展了原有限于平衡父系半同胞数据的方法，新增母系半同胞模型及不平衡数据集适配能力，相关方法通过R包QstFstComp实现，含6个相关文件。 文件详解 代码文件（.R格式，共5个）...
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GENETEX_Agreement_Based_临床基因组数据抽象一致性率评估数据集
2026年1月18日 30 43 9
数据集概述 本数据集为GENETEX手稿配套的一致性率数据，包含GENETEX工具处理临床基因组数据（CGD）时与人工抽象结果的一致性率评估数据，以及工具使用说明文档。GENETEX是一款用于从电子健康记录（EHR）中挖掘基因组报告并导入REDCap®的R包与Shiny应用，数据集支持验证该工具的准确性与效率。 文件详解...
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track2KBA_Companion_Paper_生物多样性位点识别数据与分析脚本
2026年1月18日 30 145 120
数据集概述 本数据集包含R包track2KBA配套论文所用的数据衍生物和分析脚本，用于从追踪数据识别生物多样性重要位点。数据集仅含一个压缩文件，无目录层级，无训练测试、数据标签或原始处理数据拆分。 文件详解 文件名称：manuscript_analysis.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含track2KBA...
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MHCtools_Based野生鸣禽MHC_I等位基因非随机关联研究数据2020
2026年1月15日 30 138 74
数据集概述 本数据集是关于野生鸣禽MHC-I等位基因非随机关联的研究数据，通过R包MHCtools进行计算机辅助单倍型推断，揭示了野生鸣禽中MHC-I等位基因倾向于高多样性单倍型的非随机关联模式，包含一个补充数据表文件。 文件详解 文件名称：Suppl_data_tables_20200318.xlsx 文件格式：XLSX...
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phylocurve_Package_Based_高维系统发育比较模型参数估计数据
2026年1月15日 30 34 19
数据集概述 本数据集为高维系统发育比较模型参数估计相关数据，聚焦距离法在高维性状进化研究中的局限性，提出基于参数自举和最大伪似然估计的替代方法，支持复杂进化模型参数估计、多假设结合等功能，相关方法已实现于R包phylocurve，数据集包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：sim_scripts.zip 文件格式：ZIP...
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Repertory_Grid_Based_德国政党与政治家纵向评估数据集2011_2012
2026年1月13日 30 205 196
数据集概述 本数据集包含2011年5月至2012年2月期间从同一受访者收集的10份德国语言的 repertory grid 数据。每个网格结构固定为24个元素（德国政党和政治家）与10个构念，元素及用于激发构念的元素对在所有访谈中保持一致，文件名称编码了采集日期，可通过OpenRepGrid R包导入分析。 文件详解 数据集文件...
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Phylogenies_Speciation_Based_物种形成持续时间系统发育估计研究数据
2026年1月11日 30 167 143
数据集概述 本数据集为物种形成持续时间系统发育估计研究的支持数据，包含实现 protracted 物种形成模型参数估计的方法及模拟分析结果。通过模拟现存物种系统发育树，研究物种形成起始率、灭绝率、完成率及持续时间的估计效果，并应用于灵长类系统发育案例。数据集含2个文件，支持相关模型参数计算与模拟分析。 文件详解...
