找到28个数据集

分类: 公开数据 标签: fasta格式

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  • 布氏阿里阿克菌基因注释及转录组数据

    2026年2月15日 30 99 24

    数据集概述 本数据集包含从人类分离的3株Aliarcobacter butzleri菌株(LMG 10828T、LMG 11119、31)的基因组组装序列、Prokka功能注释文件及logFC表,共计25个文件,覆盖基因组序列、功能注释、差异表达分析等多类数据。 文件详解 基因组序列文件...
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  • Local_adaptation_Based_数据集脚本与序列数据

    2026年2月6日 0 148 144

    数据集概述 本数据集包含与本地适应性相关的数据集、脚本及序列文件,共九个文件。主要涵盖汉密尔顿氏菌(Hamiltonella)的多个基因序列、蚜虫(Aphid)及寄生蜂(Parasitoid)的COI序列,以及数据集和脚本文件,可用于生物信息学领域的本地适应性研究。 文件详解 序列文件(.fas/.fa/.fasta格式)...
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  • 真菌基因转移数据的基因组规模系统发育分析

    2026年2月2日 30 40 8

    数据集概述 本数据集为真菌基因组规模系统发育分析相关数据,包含基因家族选择、序列比对结果、基因树与物种树整合计算输出等内容,用于探究基因转移在真菌进化中的作用,支持比较基因组进化动力学研究,共含六个文件。 文件详解 README_for_TreeAConcatenate.txt 文件格式:TXT...
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  • 比利牛斯山脉灌木侵占_亚高山草原土壤真菌特性数据

    2026年2月1日 30 109 72

    数据集概述 本数据集围绕比利牛斯山脉灌木入侵亚高山草原的生态影响展开,包含土壤真菌群落结构及土壤性质相关数据。研究通过DNA宏条形码技术分析灌木入侵对真菌群落组成的改变,以及与土壤碳氮比、氮磷钾含量等理化性质的关联,为亚高山草原生态系统演替研究提供支撑。 文件详解 README_for_Oriol fasta files for...
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  • MinION_Based_动物源药材产地鉴定测序研究数据

    2026年1月30日 30 77 41

    数据集概述 本数据集为基于MinION便携测序仪的动物源药材产地鉴定研究数据,包含标准、非标及混合样品的细胞色素c氧化酶I基因测序结果,涉及不同测序模式(Fast/High-accuracy)及流细胞类型(R10.3/Flongle),可用于验证MinION在药材物种溯源中的应用效果。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • 基于地中海欧洲树木区系属级DNA序列数据的系统发育信号分析

    2026年1月30日 30 14 11

    数据集概述 本数据集包含地中海欧洲64个树木属的matK、rbcL、trnH-psbA三个基因的共识DNA序列,遵循Médail等人2019年的清单,用于构建属级时间校准系统发育树及评估脆弱性,支持相关植物学研究。 文件详解...
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  • hABC_Based_巴西东北部爬行动物群落同步种群变化估计数据

    2026年1月28日 30 128 44

    数据集概述 本数据集包含用于分析巴西东北部季节性干旱热带森林(Caatinga)爬行动物群落同步种群变化的遗传数据,涉及七种有鳞目动物和四种两栖动物。数据通过分层近似贝叶斯计算(hABC)模型,验证更新世干旱增加对相关物种多样化的影响,支持Caatinga在晚更新世扩张的结论。 文件详解 遗传序列文件(.fas格式,10个文件)...
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  • 布里利安蒂亚属科迪波拉藻科新属种_太平洋珊瑚礁绿藻新属种研究数据

    2026年1月27日 30 198 85

    数据集概述 本数据集为太平洋南莱恩群岛偏远珊瑚礁发现的绿藻门刚毛藻目新属种Brilliantia kiribatiensis的研究关联数据,包含系统发育分析用的核酸序列文件、序列来源表格、藻类覆盖度调查表格及形态测量数据,支撑该新属种的分类学与生态学研究。 文件详解 核酸序列文件(.fasta格式,共7个)...
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  • Local_adaptation_Based_数据集脚本与序列数据

    2026年1月27日 0 197 37

    数据集概述 本数据集包含与本地适应性相关的数据集、脚本及序列文件,共九个文件。主要涵盖汉密尔顿氏菌(Hamiltonella)的多个基因序列、蚜虫(Aphid)及寄生蜂(Parasitoid)的COI序列,以及数据集和脚本文件,可用于生物信息学领域的本地适应性研究。 文件详解 序列文件(.fas/.fa/.fasta格式)...
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  • wrynecks_Based糖感知选择性丧失研究数据_生物进化分析

    2026年1月27日 30 118 34

    数据集概述 本数据集围绕啄木鸟科鸟类味觉受体进化展开,聚焦 wrynecks 单氨基酸突变导致糖感知选择性丧失的分子机制,包含受体序列比对、祖先序列重建、实验结果表格及食性数据等,用于研究脊椎动物感官受体逆转的分子基础与结构功能关系。 文件详解 序列文件(.fasta格式)...
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  • Pronophila_Based蝴蝶分支系统发育与分类学研究完整数据

    2026年1月26日 30 93 34

    数据集概述 本数据集为Pronophila分支系统发育与分类学研究的配套数据,包含用于分析的分子序列比对、系统发育树、模型参数及时间校准分析文件等,支持解析原多系属Pseudomaniola的分类问题,共包含七个文件。 文件详解 concatenated.phy 文件格式:PHY...
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  • BioRxiv_Preprint_真菌模拟群落基因组与分类数据_v2

    2026年1月26日 30 70 18

    数据集概述 本数据集为BioRxiv预印本相关研究数据,包含5种真菌的全基因组组装序列(.fasta格式),以及模拟群落和共生体样本的物种分类结果(.xlsx格式)。分类基于自定义数据库、NCBI RefSeq和SILVA数据库,覆盖5种引物对的扩增子测序数据,支持真菌物种分类与基因组研究。 文件详解 真菌基因组组装文件(.fasta格式,共5个)...
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  • PDE6_Genes_Based_脊椎动物磷酸二酯酶6基因进化与表达研究数据

    2026年1月20日 30 196 140

    数据集概述 本数据集围绕磷酸二酯酶6(PDE6)基因展开,包含其在脊椎动物中的进化分析、比较同线性分析及斑马鱼中的基因表达数据,涉及催化亚基与抑制亚基基因家族的扩张、新成员鉴定及昼夜表达振荡特征等内容,共21个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件(.phb格式) 示例文件:PDE6_catalytic-...
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  • BeONE_Project_Escherichia_coli基因组组装数据集

    2026年1月20日 30 193 179

    数据集概述 本数据集包含BeONE Consortium收集的308株大肠杆菌样本的基因组组装数据,以及来自ENA或NCBI SRA的1999株大肠杆菌公开基因组组装补充数据。数据经标准化处理,包含组装统计信息、基因分型及样本元数据,支持大肠杆菌的基因组学研究与分析。 文件详解 BeONE_Ec_metadata.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Patiria_miniata_Based_海星卵精子结合素受体结构进化研究数据

    2026年1月19日 30 209 188

    数据集概述 本数据集为海星Patiria miniata卵表面精子结合素受体(EBR1)的结构与进化研究相关数据,包含6个雌性个体卵巢转录组的组装结果及说明文档,用于分析该受体的编码序列、蛋白结构域及种群间选择模式,揭示精卵识别分子的共进化机制。 文件详解...
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  • Hemideina_crassidens_Based树沙螽种群线粒体序列差异研究数据

    2026年1月18日 30 112 30

    数据集概述 本数据集围绕树沙螽(Hemideina crassidens)种群内线粒体DNA序列差异展开,包含蛋白编码区(cytb/ND1)单倍型、全线粒体基因组及核基因座数据,用于分析种群内高线粒体序列差异的成因,验证遗传多样性保留机制。 文件详解 文件名称:Cytb-ND_rangi_29.phy 文件格式:.phy...
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  • Eriophyoidea_Based_植食性瘿螨类高级系统发育与线粒体基因组研究数据

    2026年1月14日 30 33 11

    数据集概述 本数据集围绕植食性瘿螨类(Eriophyoidea)的高级系统发育研究展开,包含153种瘿螨的完整线粒体基因组测序结果,涉及54种线粒体基因重排模式。数据支持瘿螨类整体及内部6个分支的单系性,结合分子定年揭示其起源于三叠纪、白垩纪多样化的特征,与被子植物演化相关。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据

    2026年1月14日 30 63 59

    数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射(CPR)基因组子集,内容为CPR微生物的基因组序列数据,以压缩包形式存储,可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称:jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含与Jaffe et al....
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  • RNA_2D_Structure_Prediction_Benchmark_Datasets

    2026年1月12日 30 51 39

    数据集概述 本数据集专为RNA二级结构预测算法的基准测试设计,包含6个压缩文件,提供用于测试机器学习方法在RNA二级结构预测任务中性能的相关数据,无训练集/测试集、数据/标签或原始/处理数据的划分。 文件详解 压缩文件集合 文件名称:test-set-1-fasta.zip、test-set-1-bpseq.zip、test-...
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  • Colletotrichum_Comparative_Genomic_半活体营养阶段转变研究数据

    2026年1月8日 30 2 0

    数据集概述 本数据集围绕Colletotrichum属真菌的半活体营养阶段转变展开,包含C. orbiculare和C. gloeosporioides两种病原菌的基因组测序与分析结果。通过比较基因组学和转录组学方法,识别与病原菌侵染阶段相关的基因扩张类群,揭示其致病机制。数据集含4个文件,涵盖基因组组装说明文档与压缩包。 文件详解...
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