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parasite_dispersal_Based_鸽类宿主_寄生虫系统多进化尺度研究数据
数据集概述 本数据集围绕鸽类宿主与羽虱寄生虫系统展开,包含7个文件,涵盖基因组测序数据、系统发育分析文件及种群遗传分析数据。通过比较翅虱(高扩散能力)与体虱(低扩散能力)的系统发育和种群遗传模式,探究寄生虫扩散对宿主-寄生虫系统多进化尺度的影响,为进化生物学研究提供基础数据。 文件详解 归档文件(Archive files)...
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IAVs_HostAdaptation_Based_流感A病毒宿主适应性组合特征识别数据
数据集概述 本数据集围绕流感A病毒(IAVs)H1N1和H3N2亚型的宿主适应性展开,通过计算规则模型识别12种病毒蛋白中与宿主(禽或人)适应相关的组合氨基酸残基特征,包含68组H1N1亚型和24组H3N2亚型的宿主特异性组合特征,以及132个新型单一氨基酸特征,为理解病毒跨物种适应机制提供数据支持。 文件详解 亚型宿主分离比对文件:...
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Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据
数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据,包含两种鸟类(马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡)的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据,以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件,用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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ZooKeys_补充材料_2_Oreolalax物种COI基因未校正p距离数据_2024
数据集概述 本数据集为论文补充材料2,包含中国西南四川省Oreolalax属(无尾目,角蟾科)新种研究中,基于COI基因计算的Oreolalax物种间未校正p距离数据,用于支持物种分类学分析,共含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_1134585.xlsx 文件格式:XLSX...
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Faster_X_Effects_Based_果蝇X染色体与常染色体进化速率比较研究数据
数据集概述 本数据集为研究果蝇X染色体快速进化效应的相关数据,包含黑腹果蝇和拟暗果蝇两个类群的全基因组编码序列进化率分析结果,涉及X染色体与常染色体基因座的适应性替换差异,以及拟暗果蝇类群中祖先X染色体与常染色体融合事件对基因进化的影响,共含一个文件。 文件详解 文件名称:Alignments.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Trypanosoma_brucei_Based_布氏锥虫抗原变异与VSG多样性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦布氏锥虫抗原变异机制研究,包含锥虫变异表面糖蛋白(VSG)的表达数据,涉及感染过程中VSG变异模式、嵌合VSG的形成及基因转换现象。数据源于小鼠感染实验的纵向VSG cDNA测序,可用于分析抗原变异多样性及慢性感染中的变异特征,共包含4个相关文件。 文件详解 Hall2013_ReadMe.txt 文件格式:TXT...
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Sinorhizobium_meliloti_Based泛表观基因组DNA甲基化变异数据
数据集概述 本数据集为共生固氮菌苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)泛表观基因组研究的补充数据,包含3个文件,涉及基因组覆盖度、泛基因组统计及甲基化基序等信息,揭示近缘菌株DNA甲基化谱的变异特征,支持表观遗传学相关分析。 文件详解 Supplementary Dataset S1 文件名称:Supplementary...
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Supporting_Data_Polydectinae蟹类海葵携带行为进化起源研究数据
数据集概述 本数据集为Polydectinae蟹类海葵携带行为进化起源研究的支撑数据,包含线粒体基因组序列、基因注释及相关序列比对文件。通过分析19种蟹类的线粒体基因组,结合系统发育重建与化石校准,探究该行为的起源时间与进化历程,结果显示其起源于始新世晚期,存在三个深度进化支系。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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EGLN1_Hypoxia_低海拔男性汉族人群高原低氧适应与EGLN1单倍型关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕低海拔男性汉族人群在青藏高原的低氧适应展开,研究EGLN1单倍型与低氧适应能力的关联。包含原始数据与测序结果两类文件,为探索基因与高原低氧适应的关系提供数据支持。 文件详解 文件名称:原始数据.xlsx 文件格式:XLSX...
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PubMLST_Based_日本医院2019_2020年耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌基因数据
数据集概述 本数据集包含2019-2020年日本医院收集的382株耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的PubMLST等位基因谱、序列比对及Mash距离数据,用于日本全国耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌基因组监测研究,共19个文件。 文件详解 序列比对文件(.fas格式,12个)...
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Neodiprion_lecontei_Based松食叶蜂环境响应基因家族进化研究数据集
数据集概述 本数据集为松食叶蜂(Neodiprion lecontei)环境响应基因家族进化研究的配套数据,包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格,覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族,支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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Onychostoma_lepturum_淡水鱼类线粒体基因组特征与系统发育分析补充数据
数据集概述 本数据集为淡水鱼类细尾白甲鱼(Onychostoma lepturum)线粒体基因组研究的补充材料,来自论文“Complete mitochondrial genome of the freshwater fish Onychostoma lepturum (Teleostei, Cyprinidae): genome...
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Brachionus_calyciflorus_基于反向分类学的淡水轮虫隐种复合体研究数据
数据集概述 本数据集为萼花臂尾轮虫隐种复合体的反向分类学研究数据,结合系统发育、形态测量及形态分析,确认分子研究提示的4个隐种存在,提供物种命名、分类描述及诊断检索表,包含11个相关文件。 文件详解 图像文件 文件名称:Rotifer_microphotographs.zip 文件格式:ZIP...
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Bivalve_Growth_Rate_Based_海洋双壳类生长率环境与进化因素研究数据
数据集概述 本数据集整合卫星测量的海表温度、叶绿素a浓度数据,以及195种海洋双壳类692个种群的生长系数、体型、寿命数据库,并结合新的双壳类最大似然系统发育树,用于研究温度、初级生产力和进化史对双壳类生长率的影响,共包含9个文件。 文件详解 系统发育相关文件 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_alignment.nex...
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Bombus_terrestris_Based_熊蜂肠道菌群多样性与寄生虫感染抗性实验数据
数据集概述 本数据集围绕熊蜂(Bombus terrestris)肠道菌群多样性与肠道寄生虫(Crithidia bombi)感染抗性的关系展开,包含实验样本的元数据、OTU计数、OTU分类信息及参考序列,用于探究感染前肠道菌群结构对寄生虫感染结果的影响,共含4个文件。 文件详解 D1_Metadata_Samples.xlsx 文件格式:XLSX...
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Dryad_Based_鸟类MHC_IIB基因家族PCR分离方法与经验数据_Archive
数据集概述 本数据集来自关于鸟类主要组织相容性复合体(MHC)IIB类基因家族的PCR分离研究,包含研究中开发的新引物序列及跨鸟类系统发育的基因分离经验,旨在解决多基因家族PCR分离中成员覆盖不全的问题,为相关基因家族的分离提供方法参考。 文件详解 文件名称:dryad.zip 文件格式:ZIP...
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InR_Pyrrhocoris_apterus_昆虫胰岛素受体与诱饵受体进化及功能研究数据
数据集概述 本数据集支持昆虫胰岛素受体(InRs)及其同源诱饵受体的进化研究,包含118种昆虫的InR序列系统发育分析数据,以及菩提树蝽(Pyrrhocoris apterus)3种InRs在翅多态性调控中的功能验证结果。数据涵盖基因簇演化、酪氨酸激酶结构域缺失机制及诱饵受体分布特征,助力解析昆虫胰岛素信号通路的功能可塑性。 文件详解...
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OGRDB开放的全基因组受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGLV受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c/ByJ品系的IGLV免疫球蛋白轻链可变区受体种系参考数据,发布于开放种系受体数据库(OGRDB),包含4个相关文件,覆盖序列数据、元信息及许可说明,支持免疫受体相关研究与分析。 文件详解 数据文件 文件名称:ByJ IGLV_rev_2_ungapped.fasta、ByJ...
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Integrative_Based_Heuchera_longiflora物种分化研究数据
数据集概述 本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据,包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据,通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据,识别该物种的初始谱系,为种下分类单元界定提供证据支持。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,6个文件)...
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Antennaria_Gnaphalieae_Asteraceae系统基因组学与进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕Antennaria属(菊科鼠麴草族)的系统发育关系展开,包含基于核基因和叶绿体基因的系统发育树、生物地理分析数据、形态特征演化及分子钟年代估算等相关文件,为该属的进化研究、多倍体起源及无融合生殖机制提供基础框架,共含18个文件。 文件详解 表格文件(XLSX格式,7个)...



