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Lasallia_pustulata_Based_地衣真菌海拔梯度生物气候适应性分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕地衣真菌Lasallia pustulata沿地中海海拔梯度的适应性分化展开,包含6个种群的基因组重测序数据及分析结果。通过检测高度分化的基因组区域、基因-环境关联,并结合生理实验验证,揭示其适应不同生物气候条件的遗传基础,涉及应激响应、环境适应及有性生殖相关基因。 文件详解 基因组分化与群体遗传分析文件...
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Pavo_Polyplectron_Argusianus_孔雀及眼斑类群系统基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为孔雀及其他具眼斑类群进化研究的系统基因组学数据,包含1966个超保守元件(UCEs)和3个线粒体区域的序列分析结果,用于探究眼斑特征的同源性与进化路径,涉及孔雀属(Pavo)、孔雀雉属(Polyplectron)、大眼斑雉属(Argusianus)等类群的系统发育关系。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共7个)...
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Potamonautidae_Based_非洲热带淡水蟹多基因位点系统发育与历史扩散研究数据
数据集概述 本数据集包含非洲热带淡水蟹科(Potamonautidae)的多基因位点系统发育研究相关文件,基于12S rRNA、16S rRNA、COI和组蛋白3四个DNA位点,覆盖该区域约百分之六十六的淡水蟹类群,用于分析系统发育关系、分化时间及祖先分布区,探究古流域连通性对物种形成的影响。 文件详解 文档类文件(共5个) 文件名称:FIGURE...
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Adeno_associated_virus_2_Based美国儿童急性重症肝炎病毒研究数据
数据集概述 本数据集包含论文“Adeno-associated virus type 2 in children from the United States with acute severe...
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Nano_Strainer_Supplementary_植物单拷贝核基因座识别工作流补充材料
数据集概述 本数据集是论文“Nano-Strainer: a workflow for identification of single-copy nuclear loci for plant systematic...
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Papionini_Mitogenomics_Based_旧世界猴族线粒体基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集为旧世界猴Papionini族线粒体基因组研究相关数据,包含33个Papionini族样本的线粒体基因组序列及分析结果,涉及Macaca、Mandrillus等6个属,旨在解析该族的系统发育关系与分化时间,为灵长类进化研究提供线粒体基因层面的支撑。 文件详解...
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Evolution_of_conjugation_Based_接合与IV型分泌系统进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕原核生物接合作用及IV型分泌系统(T4SS)的进化展开,包含关键接合蛋白的系统发育分析结果,涉及单链DNA(ssDNA)与双链DNA(dsDNA)接合的进化分歧、T4SS的分类及功能适应性等核心内容,为理解遗传交换机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:trees_and_alignments.zip 文件格式:ZIP...
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尸体甲虫_Crematogaster_与切叶蚁_Atta_共生真菌的趋同进化及宏条形码数据分析
数据集概述 本数据集包含两篇论文补充表格和五个文件,记录了非洲切叶菌植蚁(Crematogaster属)巢内真菌的代谢组学分析结果,涉及ITS1序列、OTU分类、系统发育树及BLAST比对结果,用于研究真菌与蚂蚁共生关系的趋同演化机制,共包含六个文件。 文件详解 表格文件 文件名称:1- Tables SA & SB.docx...
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HSV_Ancient_recombination_events_HSV病毒进化与重组研究数据
数据集概述 本数据集包含人类单纯疱疹病毒1型(HSV-1)和2型(HSV-2)的基因组相关数据,用于研究两者间的古老重组事件及HSV-2的进化历史。数据支持分析HSV-2的两个主要谱系(撒哈拉以南非洲谱系和全球分布谱系)特征,以及全球谱系与HSV-1的重组机制,共包含2个压缩文件。 文件详解 文件名称:alignments.zip 文件格式:ZIP...
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Noccaea_Pseudomonas_Based金属超积累植物内生菌锌耐受性局部适应研究数据
数据集概述 本数据集围绕金属超积累植物Noccaea caerulescens的假单胞菌内生菌展开,研究其对富锌环境的局部适应机制。包含自然矿区与人工超积累种群植物内生菌的锌耐受性对比、实验锌浓度调控对内生菌耐受性的影响,以及实验室种群密度验证等相关实验数据,支持植物-微生物共进化及金属防御机制研究。 文件详解...
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Compositae_Target_Enrichment_菊科植物系统发育信息富集方法研究数据
数据集概述 本数据集来自菊科植物系统发育信息靶向富集方法的研究,包含763个基因位点的系统发育数据、序列长度与数量统计、序列比对文件及比对文件压缩包,可用于菊科植物的系统发育分析与亲缘关系重建。 文件详解 系统发育树文件 文件名称:763_loci_tree_newick 文件格式:无扩展名(Newick格式)...
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Burkholderia_Dictyostelium_社会变形虫农业共生系统细菌特异性研究数据
数据集概述 本数据集围绕社会变形虫(Dictyostelium discoideum)与伯克霍尔德菌(Burkholderia)的共生特异性展开,包含共生菌的流行率、物种分类、遗传多样性及表型特征相关数据,支持对该独特共生系统形成机制的研究。 文件详解...
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denv_genomes_severity_Based_登革热蛋白序列与感染严重程度关联数据集
数据集概述 本数据集包含登革热病毒蛋白序列与人类宿主感染严重程度关联的数据,以压缩文件形式存储。数据核心为带有感染严重程度标签的登革热蛋白序列样本,适用于生物医学领域中登革热病毒相关的研究分析。 文件详解 文件名称:denv_protein_sequences.zip 文件格式:ZIP...
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Snake_Phototransduction_Genes_选择压力变化与光感受器转导研究数据
数据集概述 本数据集聚焦蛇类视觉系统进化的分子机制,包含蛇类光转导基因的转录组、基因组及选择压力分析相关数据。通过测序7个蛇眼转录组,结合全基因组和靶向捕获测序数据,分析基因丢失及选择压力变化,为蛇类进化起源、光感受器转导的分子基础提供支撑。 文件详解 Transcriptome Assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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Cryptococcus_neoformans_博茨瓦纳新型隐球菌临床与环境种群比较分析数据集
数据集概述 本数据集包含博茨瓦纳新型隐球菌(Cryptococcus neoformans var. grubii)临床与环境分离株的比较分析数据,涵盖77份环境样本与64例患者分离株的遗传多样性、地理结构及交配型分布等信息,为研究该真菌致病性相关基因提供基础。 文件详解 原始数据与文档类 文件名称:README_for_RawReads.txt...
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Malagasy_Bats_Leptospira_Genetic_Diversity_Data
数据集概述 本数据集记录马达加斯加蝙蝠携带的致病性钩端螺旋体遗传多样性,通过对947只蝙蝠(31种、18属、7科)的感染筛查及阳性样本的3个细菌基因座分型,揭示宿主-病原体关联及进化历史,包含钩端螺旋体的多样谱系及宿主特异性模式相关数据。 文件详解 文件名称:Gomard_et_al_secY_adk_rrs2_alignments.zip...
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ZooKeys_Supplementary_material_2_蝙蝠线粒体基因组碱基组成数据
数据集概述 本数据集为论文《Barbastella caspica (Chiroptera, Vespertilionidae) in China: first record and complete mitochondrial genome》的补充材料2,核心内容是Barbastella...
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补充材料_基于天牛科Batocera_horsfieldi线粒体基因组的系统发育分析_2023年
数据集概述 本数据集为论文《Characterization of the complete mitochondrial genome of the longhorn beetle, Batocera horsfieldi (Coleoptera, Cerambycidae) and its phylogenetic analysis with...
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Brachionus_asplanchnoidis_Based_轮虫隐存种复合体形态分类界定数据
数据集概述 本数据集围绕褶皱臂尾轮虫隐存种复合体中Brachionus asplanchnoidis的形态与分类界定展开,包含全球种群的形态变异分析、遗传分化地理模式及COI基因片段序列分析结果,涉及Large-clade内物种的遗传距离计算,是轮虫分类学研究的关键支撑数据。 文件详解...
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Euglossini_Phylogenomics_兰花蜂物种多样化与颜色表型系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为兰花蜂(Eulaema meriana和Eulaema bombiformis物种复合体)的系统发育基因组学研究数据,包含基于超保守元件(UCEs)和线粒体DNA(mtDNA)的测序数据、系统发育分析配置文件及结果文件,用于验证颜色表型是否对应独立进化支系,共20个文件。 文件详解 系统发育分析配置文件 文件名称:eulaema-...



