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Hodgson_Based马达加斯加近期混合人群Duffy_null等位基因自然选择研究数据
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加近期混合人群中Duffy-null等位基因的自然选择展开研究，包含相关程序与数据文件。研究通过基因组数据和模拟分析，探究该等位基因高频出现的原因，支持疟疾抗性驱动其固定的假说，为人类适应性遗传变异研究提供数据支撑。 文件详解 README_for_Hodgson et al Duffy program and...
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Leptodactylus_Na_K_ATPase_蛙类基因进化与毒素抗性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦Leptodactylus属蛙类的Na+K+ ATP酶α1亚基（ATP1A1）基因进化研究，包含基因序列比对、酶活性实验原始数据及说明文档，用于分析食毒蟾蜍蛙类通过基因重复获得毒素抗性的分子机制，揭示12个氨基酸替换在抗毒素功能与酶活性平衡中的作用。 文件详解...
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Picea_abies_Transcriptome_Sequencing_Data
数据集概述 本数据集为挪威云杉（Picea abies）针叶转录组测序结果，包含约7000万条76bp片段的原始数据（5Gbp），通过从头组装及整合公共EST数据构建参考转录组，获得38419条长度超150bp的PUTs（推定唯一转录本），并分析了基因表达差异、SNPs及同义/非同义替换率，为裸子植物与被子植物的基因进化研究提供数据支持。 文件详解...
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OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区（IGKV）基因胚系参考集，包含基因序列及相关元数据，为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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Jauhal_et_al_Mol_Ecol_基于须鲸与外类群的嗅觉受体基因进化评估数据
数据集概述 本数据集围绕须鲸嗅觉受体基因进化评估展开，包含从须鲸及陆生外类群物种中挖掘的嗅觉受体基因序列、系统发育树文件、分析代码及结果可视化文件，共8个文件，支持基因进化相关研究的复现与分析。 文件详解 压缩包文件...
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Oxyura_jamaicensis_Based_安第斯棕硬尾鸭定殖与β珠蛋白进化数据
数据集概述 本数据集记录棕硬尾鸭（Oxyura jamaicensis）逐步定殖安第斯山脉的过程及β珠蛋白变异进化情况，包含线粒体DNA、常染色体内含子及血红蛋白基因测序数据，揭示其从北美到热带安第斯再到南美南部的定殖路径与基因适应机制，共含2个文件。 文件详解 文件名称：oxyura_jamaicensis_files.zip 文件格式：ZIP...
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Clock1a_PolyQ_Microsatellite_银汉鱼科鱼类Clock基因进化研究数据
数据集概述 本数据集为Clock基因进化研究的基因型数据，通过比较方法分析美国新墨西哥州里奥格兰德河流域6种银汉鱼科鱼类（含1种引入种）的Clock1a基因PolyQ结构域等位基因长度变异，探究其与季节繁殖时间的关系，以及基因进化的系统发育信号和功能约束。数据集包含425个个体的基因型信息，共1个文件。 文件详解...
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UCP1_EvolutionaryLoss_Based_羊膜动物UCP1基因重复丢失研究补充数据
数据集概述 本数据集是关于羊膜动物UCP1基因进化丢失研究的补充数据，包含方法结果文档、表格数据及BLAST查询文件等。研究通过相似性搜索和共线性分析，揭示UCP1在爬行动物谱系基部丢失，以及猪、海豚科等真兽类哺乳动物的UCP1丢失/假基因化现象，为非功能性UCP1下的体温调节和能量代谢替代机制研究提供支持。 文件详解 文档类文件...
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echinoderms_Mitogenomes_替代起始密码子和谱系特异性基因顺序保守性研究数据
数据集概述 本数据集包含echinoderms（棘皮动物）有丝分裂基因组研究相关的数据，涵盖样本信息、基因比对结果及串联矩阵，共17个文件。主要用于揭示棘皮动物有丝分裂基因组中的替代起始密码子特征及谱系特异性基因顺序的保守性，为生物基因研究提供支持。 文件详解 基因比对文件（.fasta格式，共16个）...
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EVOB_D_16_00044R3_Based_附肢骨骼模式形成_半乳糖凝集素系统发育组学研究数据
数据集概述 本数据集围绕调控脊椎动物附肢骨骼模式形成的串联重复半乳糖凝集素（Gal-1和Gal-8）展开系统发育组学研究，对比软骨鱼、辐鳍鱼、肉鳍鱼及四足动物的Gal-8基因进化差异，分析其在附肢骨骼模式分化中的作用，包含1份研究文档。 文件详解 文件名称：BMC Evolutionary Biology EVOB-D-16-00044R3.docx...
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Pseudo_nitzschia_multistriata_Based_海洋硅藻系统基因组学资源数据
数据集概述 本数据集是海洋硅藻Pseudo-nitzschia multistriata的系统基因组学资源，包含基于约9000个该硅藻基因构建的系统发育树，以及与古菌、细菌和真核生物主要类群的同源序列（超200万条）的比较数据。每个同源组通过两种不同替代模型构建树，序列ID含分类信息，支持基因进化关系分析。 文件详解 文件名称：treeData.zip...
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Positive_selection_Plasmodium_falciparum宿主特异性结合进化分析数据
数据集概述 本数据集围绕恶性疟原虫（P. falciparum）RH5蛋白与人类Basigin受体的物种特异性结合机制展开，分析相关基因的阳性选择进化。涵盖疟原虫配体及宿主受体的进化选择分析，解释宿主转移及恶性疟原虫成为人类病原体的分子机制，包含3个相关文件。 文件详解 文件名称：trees 文件格式：无扩展名...
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Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据
数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件（TE）注释及质量控制数据，用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件，共27个文件，是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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拟南芥TIR型NLR免疫互作研究补充数据集
数据集概述 本数据集为拟南芥TIR型NLR免疫互作研究的补充数据集，包含5个压缩文件，用于支持相关研究中关于遗传连锁NLRs在免疫反应及与片段重复区域编码NLRs互作的分析。 文件详解 文件名称：Dataset S1.zip、Dataset S2.zip、Dataset S3.zip、Dataset S4.zip、Dataset S5.zip...
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系统发育树文件_Newick格式
数据集概述 本数据集包含以Newick格式存储的系统发育树文件，核心围绕生物学基因相关的进化关系分析，通过压缩包形式提供，便于获取和使用。 文件详解 文件名称: phylogenetic_tree_files.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
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极端嗜热真核生物Galdieria_sulphuraria基因转移进化数据集
数据集概述 本数据集围绕极端嗜热红藻Galdieria sulphuraria的环境适应机制展开，通过基因组测序揭示其通过细菌与古菌水平基因转移实现代谢灵活性的进化路径，为研究真核生物极端环境适应的分子机制提供数据支持。 文件详解 文档文件（.rtf格式）：...
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真兽类配子识别基因快速分化促进宏观进化数据集
数据集概述 本数据集围绕真兽类配子识别基因（Zan）的快速分化展开，包含17个真兽目112个物种的基因序列及系统发育树文件，用于探究Zan基因在物种分化和真兽类适应性辐射中的作用。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共40个）： 示例文件：Zan.con.tre、izumo1.nex.con.tre、adam2.nex.con.tre等...
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中国南方新发现物种Lulesia_umbrinomarginata五基因座系统发育分析序列及登录号表
数据集概述 本数据集为支持中国南方新发现物种Lulesia umbrinomarginata鉴定的五基因座系统发育分析序列表，包含多个Lulesia属物种的ITS、LSU、RPB2、TEF1、ATP6基因序列登录号及样本信息，为物种分类与系统发育研究提供分子数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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多基因座多物种溯祖模型与基因家族进化数据集
数据集概述 该数据集围绕“多基因座多物种溯祖”（MLMSC）模型展开，该模型是一种用于分析基因家族进化的新模型，整合了不完全谱系分选（ILS）与基因复制、转移、丢失（DTL）的相互作用，为基因树与物种树的模拟和推断提供框架。 文件详解 数据文件： 文件名称：hemiplasy_data.xlsx 文件格式：Excel（.xlsx）...
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沃尔特宁氏蛇属基因片段突变数量对比表
数据集概述 本数据集为《揭示黑沙漠眼镜蛇》研究中的表格数据，记录了沃尔特宁氏蛇属（Walterinnesia）样本在12S、16S、COI、Cytb、MC1R五个基因片段间的突变数量，用于物种分类修订研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明:...
