找到59个数据集

标签: BEAST

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  • FMDV_SAT1_SAT2_Based东非口蹄疫病毒系统地理与跨物种传播动态研究数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集聚焦东非地区SAT1和SAT2型口蹄疫病毒(FMDV)的进化流行病学,分析1975-2016年病毒在牛与野生非洲水牛间的跨物种传播动态。通过贝叶斯系统动力学模型解析VP1基因片段,推断病毒祖先位置、传播路线及宿主来源,为非洲口蹄疫防控提供科学依据,包含9个相关分析文件。 文件详解 SAT1相关文件...
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  • Scleractinia_Integrating分子与形态证据_石珊瑚系统发育分析数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集包含石珊瑚(Scleractinia)系统发育研究的相关文件,整合分子与形态证据,涉及576个物种的12个DNA标记系统发育数据矩阵及时间校准树的BEAST输入文件,共6个文件,支持石珊瑚新系统学研究。 文件详解 系统发育数据矩阵文件 文件名称:Scleractinia.nex 文件格式:.nex...
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  • Euprepiophis_perlacea_Based珍稀蛇类物种界定与系统发育研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为珍稀物种四川鼠蛇(Euprepiophis perlacea)的物种界定与系统发育研究数据,包含基于多基因座数据和 coalescent 方法的分析文件,用于验证该物种的分类有效性及其在系统发育树中的位置,支持生物分类学研究。 文件详解 XML分析文件(共8个)...
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  • Madagascarophis_Based_马达加斯加猫眼蛇系统发育与新物种描述研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集包含马达加斯加猫眼蛇属(Madagascarophis)的系统发育研究数据,涉及该属已知物种的多基因位点分析及安卡拉纳石林新物种的描述。数据支持新物种的界定及其在属内的系统发育位置,为蛇类分类学和生物多样性研究提供分子与形态学相关信息。 文件详解 系统发育树文件 文件名称:Madagascarophis_trees.zip...
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  • Ancient_Mitochondrial_DNA_Based_巨型短面熊趋同演化研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集包含古代巨型短面熊(Tremarctinae亚科)的线粒体DNA研究数据,涉及南北美洲巨型短面熊(Arctodus simus与Arctotherium angustidens)及现生眼镜熊的演化关系分析,揭示其趋同演化特征。数据集含4个文件,支持分子系统发育分析。 文件详解 PartitionFinder_files.zip...
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  • Dryad_Source_Sarracenia_alata_系统发育地理一致性因子分析数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集包含用于量化Sarracenia alata猪笼草系统中协同分布物种系统发育地理一致性的相关文件,涉及共生节肢动物与宿主植物的协同分化分析,以及生态关联程度与系统发育地理模式相似性的相关性研究,支持生物地理学中一致性量化方法的应用验证。 文件详解 README_for_Satler&Carstens2016.txt...
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  • Fireflies_Opsin_Genes_北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学关联研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学的关联展开,包含基因组、转录组测序及目标基因测序结果,涉及10种萤火虫的视蛋白基因序列、系统发育树及转录组组装文件,用于分析视蛋白基因进化与信号模式、光环境的关系,共8个文件。 文件详解 转录组组装相关文件 文件名称:Transcriptome_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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  • Drepanotermes_Based_澳大利亚收获蚁气候变化适应性与分布预测研究数据2022

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕澳大利亚特有收获蚁属Drepanotermes展开,包含其系统发育、筑巢习性、气候变量及未来栖息地适宜性预测相关数据。通过物种界定、系统发育推断、祖先状态重建及生态位建模,探究该属对澳大利亚干旱化的进化适应及未来气候变化下的分布响应,为研究物种气候适应性提供支撑。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt...
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  • Heliconius_Multilocus_Species_Trees_蝴蝶适应性辐射研究数据

    2026年1月11日   

    数据集概述 本数据集为研究新热带区Heliconiini蝴蝶适应性辐射的多基因物种树数据,包含22个线粒体与核标记的测序数据,覆盖该族约百分之九十二的物种。数据用于分析系统发育信号冲突、比较不同物种树重建方法,并构建时间校准的系统发育树,以探究新热带区环境变化对蝴蝶多样化速率的影响,共包含五个关联文件。 文件详解 文档类文件...
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  • Gecko_Diurnality_Evolution_Based_壁虎昼夜活动模式进化研究数据

    2026年1月11日   

    数据集概述 本数据集为壁虎昼夜活动模式进化研究的相关数据,包含系统发育分析、特征进化模拟等所需的基因数据、系统发育树及分析输入文件,支持探究壁虎昼夜活动模式的进化历史,包括夜行性的古老起源及多次向昼行性的转变过程。 文件详解 BiSSE_unresolved_data.txt 文件格式:TXT...
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  • Brachionus_asplanchnoidis_Based_轮虫隐存种复合体形态分类界定数据

    2026年1月11日   

    数据集概述 本数据集围绕褶皱臂尾轮虫隐存种复合体中Brachionus asplanchnoidis的形态与分类界定展开,包含全球种群的形态变异分析、遗传分化地理模式及COI基因片段序列分析结果,涉及Large-clade内物种的遗传距离计算,是轮虫分类学研究的关键支撑数据。 文件详解...
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  • Euglossini_Phylogenomics_兰花蜂物种多样化与颜色表型系统发育基因组学研究数据

    2026年1月4日   

    数据集概述 本数据集为兰花蜂(Eulaema meriana和Eulaema bombiformis物种复合体)的系统发育基因组学研究数据,包含基于超保守元件(UCEs)和线粒体DNA(mtDNA)的测序数据、系统发育分析配置文件及结果文件,用于验证颜色表型是否对应独立进化支系,共20个文件。 文件详解 系统发育分析配置文件 文件名称:eulaema-...
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  • Cladistics_Submitted_Micrathena蜘蛛系统发育及生物地理学研究补充数据

    2026年1月6日   

    数据集概述 本数据集是论文《Micrathena蜘蛛完整系统发育揭示新热带区雨林、岛屿与陆块间的多次扩散事件及安第斯造山运动促进物种形成》的补充图表与数据,包含补充图S1-S15及补充数据S16-S44,涵盖标本信息、形态与分子序列数据、系统发育分析输入文件、生物地理学分析结果等,支撑蜘蛛系统发育与生物地理学研究。 文件详解 补充图表...
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  • Anchored_Phylogenomics_Source_马达加斯加伪蝰蛇系统发育比较研究数据集

    2026年1月6日   

    数据集概述 本数据集为马达加斯加伪蝰蛇(Pseudoxyrhophiinae)系统发育研究的原始数据,包含基于5个Sanger测序基因位点和377个锚定基因组位点的两种分子数据集,用于比较不同测序规模和分析方法对物种树构建的影响,为蛇类系统进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:AHE_Snake_ProbeDesign.zip 文件格式:ZIP...
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  • Scotobleps_gabonicus_Genomic_Data_热带森林蛙类多样化机制研究数据集

    2026年1月4日   

    数据集概述 本数据集为加蓬林蛙(Scotobleps gabonicus)多样化机制评估研究的基因组数据,包含种群结构分析、 demographic模型选择及空间显式分析相关文件,用于探究西非下几内亚森林中该蛙类的异域和邻域分化模式,验证森林避难所、河流屏障等假说对生物多样性积累的作用。 文件详解 压缩文件包(共8个,格式均为ZIP)...
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  • TransadriaticNiphargus_Based_亚得里亚海地下端足类系统发育与生物地理数据

    2026年1月3日   

    数据集概述 本数据集为亚得里亚海两侧地下端足类(Niphargus属)的生物地理研究数据,包含系统发育分析、物种界定、生物地理模型构建等相关文件,用于验证海退-海侵循环对端足类分布模式的影响,支持“扩散-隔离交互作用塑造分布”的结论,共9个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Acanthisittidae_Mitochondrial_Genomes_新西兰棘刺鹩进化史研究数据

    2026年1月2日   

    数据集概述 本数据集包含四个新西兰棘刺鹩物种(三种已灭绝、一种现存)的新型线粒体基因组序列,用于解析该科鸟类的系统发育关系并修订分类。数据支持形态学分析与遗传结果的结合,为雀形目早期进化及新西兰生物群研究提供关键遗传信息,助力分子定年及灭绝物种进化历史探究。 文件详解 测序数据文件...
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  • 基于Platygonus_compressus的已灭绝北美平头野猪古DNA及现存物种线粒体基因组研究数据

    2026年1月1日   

    数据集概述 本数据集包含已灭绝北美平头野猪(Platygonus compressus)的古DNA数据,以及现存野猪科物种的完整线粒体基因组序列。数据用于分子系统发育分析,以明确古生物与现存物种的亲缘关系、分化时间,并初步探究平头野猪的种群遗传多样性。数据集共9个文件,涵盖测序数据、分析脚本及结果文件。 文件详解 测序数据文件...
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  • BEAST_XML_Based_2009_H1N1流感大流行分子流行病学实时特征研究数据_archive

    2025年12月31日   

    数据集概述 本数据集围绕2009年H1N1甲型流感大流行展开,通过贝叶斯系统发育学方法,基于全基因组序列模拟实时估计大流行的进化速率、出现日期及内在增长率(r0),同时探究采样时间范围和数据集大小对参数估计精度与准确性的影响,为大流行期间干预策略提供数据支持。 文件详解 文件名称:BEAST_XML.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • Arundinoideae_Polyphyly_Based禾本科芦竹亚科系统发育与扭曲膝状稃芒演化研究数据

    2025年12月30日   

    数据集概述 本数据集为禾本科芦竹亚科(Arundinoideae)系统发育研究相关数据,包含12个文件,涉及全质体组序列比对、系统发育树构建结果、贝叶斯分析输入文件及相关日志等,用于解析芦竹亚科的多系性及扭曲膝状稃芒的演化规律。 文件详解 质体组序列比对文件...
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