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NTM_Persistence_Based肺泡巨噬细胞模型非结核分枝杆菌基因组数据集
数据集概述 本数据集包含5株非结核分枝杆菌(NTM)菌株的基因组组装与注释数据,涉及参考菌株及临床菌株,覆盖基因组拼接序列、转录本核苷酸序列、CDS氨基酸序列等多类文件,总计25个文件,用于研究NTM在肺泡巨噬细胞模拟细胞模型中的持留机制。 文件详解 基因组组装与注释文件(.gbk、.fasta)...
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Latent_infection_Based_单细胞绿藻巨型内源性病毒潜伏感染研究补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Latent infection of an active giant endogenous virus in a unicellular green alga》的补充数据,包含7个文件,涉及单细胞绿藻中巨型内源性病毒潜伏感染相关的基因组序列、蛋白质序列、模型文件及重复序列信息,支持病毒基因结构、蛋白质模型及序列特征的研究。...
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Arcadia_Science_人类疾病相关重复序列扩增跨物种分布研究数据_Version3
数据集概述 本数据集为Arcadia Science相关研究的配套数据,聚焦人类疾病相关重复序列扩增在不同生物中的分布情况,包含考拉种群测序的重复序列计数结果、与人类重复扩增蛋白同源的序列/结构相似性比对结果、相关氨基酸序列文件及分类学分析表格等,共15个文件,支持跨物种重复序列扩增的生物信息学研究。 文件详解 考拉重复序列分析文件...
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Ara_chloropterus_Red_and_Green_Macaw_Diet_Data
数据集概述 本数据集记录阿根廷伊贝拉国家公园重引入红绿金刚鹦鹉的食性组成,通过行为观察与DNA宏条形码技术结合分析其对野生食物资源的利用情况,包含49种植物物种的食性数据,反映鹦鹉对野外环境的适应程度,为种群重建提供支撑。 文件详解 Reference_library.fasta 文件格式:FASTA...
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Linepithema_humile_Based_阿根廷蚁气味受体比较转录组与系统发育地层学研究数据
数据集概述 本数据集聚焦阿根廷蚁(Linepithema humile)气味受体(ORs)的比较转录组与系统发育地层学研究,通过分析触角、头、胸、腿等组织的转录组数据,筛选出触角富集的21个九外显子OR候选基因,结合系统发育地层学方法探究其进化特征,为揭示蚂蚁巢友识别机制提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Picea_glauca_Based白云杉酚类化合物组成型生产相关基因研究数据集
数据集概述 本数据集围绕白云杉酚类化合物组成型生产的遗传基础展开,包含QTL定位、转录组分析相关数据,涉及9种酚类化合物的QTL检测及高/低含量个体的差异表达基因分析,共3个文件,用于解析针叶树酚类合成的基因组结构与调控网络。 文件详解 phenolics_white_spruce_readme.txt 文件格式:TXT...
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Chorthippus_biguttulus_Based_发育阶段转录组分析数据
数据集概述 本数据集为斑翅草蝗(Chorthippus biguttulus)全生命周期7个发育阶段的转录组数据,涵盖胚胎发育至成虫阶段。通过转录组测序揭示不同发育阶段的差异基因表达模式,涉及信号传导、细胞分化、器官发育等关键生物学过程,为直翅目昆虫发育研究提供基础数据。 文件详解 all6_larval.fasta 文件格式:FASTA...
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DNA_Barcoding_Supplemental_Files_生物学研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Towards a better future for DNA barcoding...”的补充文件,包含十四份文件,涉及DNA条形码相关的系统发育树、物种统计、单系性总结和单倍型计数等内容,支持对DNA条形码技术的研究与分析。 文件详解 文件类型及示例:...
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Leptodactylus_Na_K_ATPase_蛙类基因进化与毒素抗性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦Leptodactylus属蛙类的Na+K+ ATP酶α1亚基(ATP1A1)基因进化研究,包含基因序列比对、酶活性实验原始数据及说明文档,用于分析食毒蟾蜍蛙类通过基因重复获得毒素抗性的分子机制,揭示12个氨基酸替换在抗毒素功能与酶活性平衡中的作用。 文件详解...
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OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)基因胚系参考集,包含基因序列及相关元数据,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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Amplicon_sorter_Based_无参考扩增子排序与共识序列构建工具配套数据
数据集概述 本数据集为Amplicon_sorter工具的配套数据,该工具用于基于序列相似性和长度对Oxford Nanopore Technologies(ONT)测序的扩增子进行无参考排序,并构建高质量共识序列。数据集包含6个文件,支持工具的使用与验证,适用于生态学研究中扩增子测序数据的分析。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Island_Bat_Diets_Based_菲律宾岛屿蝙蝠物种饮食与栖息地关系研究数据
数据集概述 本数据集针对菲律宾宿务、保和、锡基霍尔岛的3种菊头蝠(Rhinolophus)和1种蹄蝠(Hipposideros)开展物种层面饮食分析,从77只蝙蝠粪便中识别出655个猎物分子操作分类单元(MOTUs),探究体型、回声定位频率及栖息地对蝙蝠食性分化的影响,包含16个相关文件。 文件详解 说明文档(README文件)...
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DRYAD_JHE_Based_马达加斯加灭绝巨型亚化石狐猴比较与种群线粒体基因组分析数据
数据集概述 本数据集包含马达加斯加灭绝巨型亚化石狐猴的比较与种群线粒体基因组分析数据,通过古DNA和基因组方法研究亚化石狐猴灭绝生物学及现存狐猴保护风险因素,涉及5个亚化石狐猴类群的线粒体基因组及2种灭绝、8种现存狐猴的种群序列数据,共包含43个文件。 文件详解 压缩包文件 文件名称:DRYAD JHE lemur aDNA.zip 文件格式:ZIP...
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Conoidean_Phylogenetic_Based芋螺总科毒液肽库系统发育整合分析数据
数据集概述 本数据集为芋螺总科毒液肽库与系统发育及生物学框架整合研究的相关数据,包含毒液肽库、基因序列、系统发育树及序列比对等材料,用于分析芋螺总科物种的系统发育关系,识别新属及毒液肽的生物多样性关联特征,为毒液肽的生物医学应用提供数据基础。 文件详解 README.docx:DOCX格式,数据集说明文档,介绍研究背景、数据内容及使用说明...
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Inbreeding_Effects_Based奇努克鲑鱼组织基因特异性DNA甲基化研究数据
数据集概述 本数据集围绕奇努克鲑鱼近交对基因特异性DNA甲基化的影响展开,涵盖22个生长、代谢、免疫及应激相关基因的甲基化分析结果,包含基因序列、原始测序数据及甲基化百分比数据三类文件,用于研究近交衰退的表观遗传调控机制。 文件详解 文件名称:Venney_et_al_geneseqs_bwameth.fasta 文件格式:FASTA...
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Fireflies_Opsin_Genes_北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学的关联展开,包含基因组、转录组测序及目标基因测序结果,涉及10种萤火虫的视蛋白基因序列、系统发育树及转录组组装文件,用于分析视蛋白基因进化与信号模式、光环境的关系,共8个文件。 文件详解 转录组组装相关文件 文件名称:Transcriptome_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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Nano_Strainer_Supplementary_植物单拷贝核基因座识别工作流补充材料
数据集概述 本数据集是论文“Nano-Strainer: a workflow for identification of single-copy nuclear loci for plant systematic...
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Genome_Transcriptome_Based_Calanus物种核插入缺失标记开发数据
数据集概述 本数据集为Calanus属桡足类物种鉴定的核插入缺失标记开发相关数据,基于C. finmarchichus和C. glacialis两个近缘物种的基因组与转录组测序分析,包含12个物种特异性扩增子长度标记的开发成果,可用于Calanus属多个物种及杂交种的分子鉴定,共含5个文件。 文件详解...
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Leafless_epiphytic_orchids_Based_无叶附生兰菌根真菌数据_2021
数据集概述 本数据集包含无叶附生兰的真菌系统发育与群落数据,来自2021年发表于Mycorrhiza期刊的论文。数据涵盖角担菌科真菌的序列矩阵、系统发育树,以及不同样本中菌根真菌OTU的序列丰度与采样信息,共包含4个文件,用于展示无叶附生兰共享的菌根真菌关系。 文件详解 readme.docx 文件格式:DOCX...
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Untangling_Based_真核生物早期分化与Centrohelida等类群进化起源研究数据
数据集概述 本数据集为真核生物早期分化研究的基因组数据,包含四类中心异养生物(Centrohelida)的高质量转录组序列及相关处理文件,旨在通过系统发育分析解决真核生物进化树中的争议节点,填补关键类群基因组数据空缺,支持对Centrohelida、Haptophyta和Cryptista进化起源的研究。 文件详解 转录组序列文件...



