数据集 - 海数据

Syngnatharia_Based鱼类系统基因组学与历史生物地理学研究补充材料

2026年1月15日

数据集概述本数据集是Syngnatharia鱼类（含海马、海龙、鲂鱼等）系统基因组学与历史生物地理学研究的补充材料，包含169种鱼类的基因组数据、时间校准树、祖先分布区估计及敏感性分析结果，覆盖该类群全部10科约25%的物种多样性，用于探究生物地理推断不确定性的驱动因素。文件详解 README.txt 文件格式：TXT...

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phylogenetic_Based_形态学大数据系统发育分析算法性能评估数据集

2026年1月15日

数据集概述本数据集是关于大形态学数据集系统发育分析的概率算法性能评估模拟研究数据。研究测试了MrBayes、RevBayes、IQ-TREE和RAxML四种主流概率软件在不同分类抽样和缺失数据条件下的性能，通过Robinson-Foulds等指标计算推断树与真实树的距离，分析算法准确性、精确性及稳定性。文件详解 R_scripts.zip...

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Cand_Thiosymbion_Based_海洋动物宿主共生菌协同进化研究数据

2026年1月15日

数据集概述本数据集围绕Candidatus Thiosymbion共生菌展开，包含其与线虫（Stilbonematinae）外共生、环节动物（Phallodrilinae）内共生的序列比对、系统发育树等数据，用于研究两类宿主与共生菌的协同进化关系，分析共生生活方式转换及宿主跨界转移的进化事件。文件详解说明文档（.txt）...

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Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据

2026年1月15日

数据集概述本数据集包含叶蜂与树蜂（膜翅目）系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件，用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史，共包含40个文件。文件详解输入文件文件名称：BEAST_input_phylo-...

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Certhioidea_Based_美洲鹪鹩及其近缘类群系统发育与生物地理历史数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集包含雀形目Certhioidea超科（鹪鹩及其近缘类群）的系统发育与生物地理分析数据，覆盖物种及种系水平采样，涉及分子超级矩阵构建、系统发育树推断、生物地理历史重建及多样化速率分析等内容，为研究该类群在美洲的分化与扩散历史提供基础框架。文件详解系统发育树文件（.tre）...

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Ischyropsalidoidea_Based_节肢动物超科系统发育基因组学分析数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集是针对盲蛛超科Ischyropsalidoidea系统发育关系的基因组学分析成果，包含10个相关文件。通过整合转录组与桑格测序数据，采用多种系统发育分析方法（如串联法、溯祖法等），解决了该类群早期分化的系统发育问题，为节肢动物分类与演化研究提供了数据支持。文件详解基因树文件...

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Squamate_Phylogenomic_Based爬行动物系统发育基因组学分析数据

2026年1月14日

数据集概述本数据集基于4178个核基因座的靶向序列捕获数据，对32种有鳞目爬行动物（蜥蜴和蛇）及5个外类群进行系统发育基因组学分析。通过串联法和物种树方法，明确蛇类在蜥蜴科中的起源位置，解决了鬣蜥类蜥蜴的争议性分类地位。数据集包含6个文件，为研究有鳞目高级分类关系提供强支持的假设。文件详解 RAxML输入文件（TXT格式）...

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snakes_phylogenomics_Based_蛇类科间系统发育基因组关系研究数据

2026年1月13日

数据集概述本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据，包含3776个核基因座的超保守元件序列，涉及29种蛇类（覆盖几乎所有科），是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系，揭示了3个新分支，为脊椎动物系统发育研究提供支撑。文件详解序列文件（.phy格式）...

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Plethodontid_Salamander_Based_替代繁殖策略形态多态性研究数据

2026年1月13日

数据集概述本数据集围绕有尾目蝾螈的替代繁殖策略（ARTs）形态多态性展开，包含基因组、行为学、核型及野外观测相关数据，涉及“搜寻型”和“守卫型”雄性蝾螈的繁殖生态位差异，为研究进化与生态学中多态性的起源与维持提供支撑。文件详解基因组分析输入输出压缩包文件名称：Pierson_et_al_ipyrad_input_output.zip...

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Ancient_Mitochondrial_DNA_Based_巨型短面熊趋同演化研究数据

2026年1月13日

数据集概述本数据集包含古代巨型短面熊（Tremarctinae亚科）的线粒体DNA研究数据，涉及南北美洲巨型短面熊（Arctodus simus与Arctotherium angustidens）及现生眼镜熊的演化关系分析，揭示其趋同演化特征。数据集含4个文件，支持分子系统发育分析。文件详解 PartitionFinder_files.zip...

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ZooKeys_补充材料_6_Monacha_cantiana种群系统发育分析基因序列数据

2026年1月12日

数据集概述本数据集为论文补充材料6，包含Monacha cantiana（Montagu, 1803）的串联基因序列，具体为H3基因与[(5.8SrDNA)+ITS2+(28SrDNA)]的组合序列，用于NJ/ML-MEGA7/IQ Tree/RAxML/BI等系统发育分析，对应论文图10的研究内容。文件详解...

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ZooKeys_补充材料_7_Monacha_cantiana种群遗传串联序列数据2024

2026年1月12日

数据集概述本数据集为ZooKeys论文的补充材料7，包含用于Monacha cantiana（Montagu, 1803）系统发育分析的串联基因序列，涉及COI、16SrDNA长片段、H3、5.8SrDNA+ITS2+28SrDNA等基因片段，支持NJ、ML-MEGA7、ML-IQ Tree、RAxML、BI等分析方法，对应论文图11的研究内容。...

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Integrative_Based_Heuchera_longiflora物种分化研究数据

2026年1月12日

数据集概述本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据，包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据，通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据，识别该物种的初始谱系，为种下分类单元界定提供证据支持。文件详解系统发育树文件（.tre格式，6个文件）...

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Antennaria_Gnaphalieae_Asteraceae系统基因组学与进化研究数据

2026年1月12日

数据集概述本数据集围绕Antennaria属（菊科鼠麴草族）的系统发育关系展开，包含基于核基因和叶绿体基因的系统发育树、生物地理分析数据、形态特征演化及分子钟年代估算等相关文件，为该属的进化研究、多倍体起源及无融合生殖机制提供基础框架，共含18个文件。文件详解表格文件（XLSX格式，7个）...

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Fungal_Denitrifiers_Global_Soils_分布与环境驱动因素研究数据

2026年1月12日

数据集概述本数据集包含与论文“Distribution and Environmental Drivers of Fungal Denitrifiers in Global...

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Pavo_Polyplectron_Argusianus_孔雀及眼斑类群系统基因组学研究数据

2026年1月12日

数据集概述本数据集为孔雀及其他具眼斑类群进化研究的系统基因组学数据，包含1966个超保守元件（UCEs）和3个线粒体区域的序列分析结果，用于探究眼斑特征的同源性与进化路径，涉及孔雀属（Pavo）、孔雀雉属（Polyplectron）、大眼斑雉属（Argusianus）等类群的系统发育关系。文件详解系统发育树文件（.tre格式，共7个）...

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Squamate_Integrated_Analyses_有鳞目爬行动物系统发育冲突解决数据集

2026年1月12日

数据集概述本数据集为解决有鳞目爬行动物（蜥蜴和蛇）系统发育争议而构建，整合了形态学与分子数据（691个形态特征、46个基因，覆盖161种现生类群与49种化石类群）。通过综合分析明确了高级阶元关系，揭示了化石类群（如沧龙类、多齿龙类）的意外系统位置，强调了分子与化石数据结合的重要性。文件详解文档文件（TXT格式）...

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Heliconius_Multilocus_Species_Trees_蝴蝶适应性辐射研究数据

2026年1月11日

数据集概述本数据集为研究新热带区Heliconiini蝴蝶适应性辐射的多基因物种树数据，包含22个线粒体与核标记的测序数据，覆盖该族约百分之九十二的物种。数据用于分析系统发育信号冲突、比较不同物种树重建方法，并构建时间校准的系统发育树，以探究新热带区环境变化对蝴蝶多样化速率的影响，共包含五个关联文件。文件详解文档类文件...