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Lepilemur_mitogenomes_Based运动狐猴系统基因组重建及生物地理学分析数据
数据集概述 本数据集包含35个完整线粒体基因组的分析结果，覆盖运动狐猴属（Lepilemur）全部26个已识别类群，用于系统基因组重建及马达加斯加生物地理学推断。数据支持25个单系谱系的恢复，以及Lepilemur mittermeieri与Lepilemur...
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RADseq_Data_from_Hawaiian_Myrsine辐射进化系统发育与杂交分析数据集
数据集概述 本数据集包含夏威夷Myrsine属（报春花科）辐射进化的RADseq和Sanger测序系统发育分析结果，涉及近全部夏威夷Myrsine物种及全球Myrsine属和近缘属样本。数据支持夏威夷Myrsine单系性、三大分支结构的结论，并提供杂交事件的分子证据，共四十四份文件。 文件详解 系统发育树文件...
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Hidden_histories_of_gene_flow_Based墨西哥高地鸟类基因组标记数据
数据集概述 本数据集包含墨西哥高地鸟类（Aphelocoma jays）基因流研究的基因组标记数据，通过4303个超保守元件（UCEs）和2500个SNP位点，结合系统发育树、聚类算法及基因渐渗检测（如ABBA/BABA测试），揭示物种分化过程中的基因流历史。数据支持对物种形成模式的分析，共包含9个相关分析文件。 文件详解 文档文件（.txt）...
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PPF_Plant_Phyllosphere_Feedbacks_菊科植物种内凋落物负反馈实验数据
数据集概述 本数据集基于植物叶际反馈（PPF）框架，通过十菊科物种凋落物接种实验，探究种内/种间凋落物对幼苗生长的反馈效应。实验覆盖慢到快生活史策略物种，采用全因子设计，验证PPF的普遍性及驱动机制，结果显示多数物种存在负反馈，但功能性状和系统发育距离无预测性。 文件详解 数据文件...
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ZooKeys_补充材料_5_Monacha_cantiana_串联基因序列系统发育分析数据_2024
数据集概述 本数据集为论文的补充材料5，包含用于NJ、ML-MEGA7、IQ Tree、RAxML、BI等系统发育分析的Monacha cantiana（Montagu, 1803）COI+16SrDNA串联基因序列，对应论文中的图9分析，支持该物种的系统发育研究。 文件详解 文件名称：oo_1031130.docx 文件格式：DOCX...
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Acanthisittidae_Mitochondrial_Genomes_新西兰棘刺鹩进化史研究数据
数据集概述 本数据集包含四个新西兰棘刺鹩物种（三种已灭绝、一种现存）的新型线粒体基因组序列，用于解析该科鸟类的系统发育关系并修订分类。数据支持形态学分析与遗传结果的结合，为雀形目早期进化及新西兰生物群研究提供关键遗传信息，助力分子定年及灭绝物种进化历史探究。 文件详解 测序数据文件...
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基于Platygonus_compressus的已灭绝北美平头野猪古DNA及现存物种线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集包含已灭绝北美平头野猪（Platygonus compressus）的古DNA数据，以及现存野猪科物种的完整线粒体基因组序列。数据用于分子系统发育分析，以明确古生物与现存物种的亲缘关系、分化时间，并初步探究平头野猪的种群遗传多样性。数据集共9个文件，涵盖测序数据、分析脚本及结果文件。 文件详解 测序数据文件...
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Targeted_Sampling_Based_美国东南沿海平原两栖动物系统发育地理学研究数据_2018
数据集概述 本数据集包含美国东南沿海平原4种蛙类的系统发育地理学研究数据，通过目标捕获技术获取同源基因座和线粒体基因组，结合36个地点的地理采样，用于评估系统发育地理一致性。数据覆盖核基因树、线粒体基因组、多基因座分析等多维度结果，是区域或类群中较全面的比较系统发育地理数据集之一。 文件详解 支持信息文档...
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Arundinoideae_Polyphyly_Based禾本科芦竹亚科系统发育与扭曲膝状稃芒演化研究数据
数据集概述 本数据集为禾本科芦竹亚科（Arundinoideae）系统发育研究相关数据，包含12个文件，涉及全质体组序列比对、系统发育树构建结果、贝叶斯分析输入文件及相关日志等，用于解析芦竹亚科的多系性及扭曲膝状稃芒的演化规律。 文件详解 质体组序列比对文件...
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Grallaria_hypoleuca_Based_安第斯山脉蚁鸫物种形成历史研究数据_原始序列与系统发育文件
数据集概述 本数据集为安第斯山脉“湾背蚁鸫”复合体（Grallaria hypoleuca s. l.）物种形成历史研究的序列数据与系统发育分析结果，包含线粒体DNA与GBS技术生成的短读序列，以及系统发育树、基因分型等文件，共16个文件，用于解析该鸟类类群的地理分化历史与演化过程。 文件详解 系统发育树文件（.tree、.trees格式）...
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Elucidating_Steroid_Biosynthesis_加州藜芦甾体生物碱途径解析研究数据_2015
数据集概述 本数据集围绕加州藜芦甾体生物碱生物合成展开，聚焦环巴胺前体藜芦嗪的合成途径研究。通过在Sf9细胞中重构候选基因，发现催化胆固醇生成藜芦嗪的四种关键酶，包含研究相关的文档和序列文件，总计2个文件。 文件详解 README文档 文件名称：README_for_Augustin_etal_2015_p450.txt 文件格式：TXT...
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豆科植物基于分类学综合系统发育的新亚科分类数据集
数据集概述 该数据集基于质体matK基因序列的综合系统发育分析，提出豆科植物新亚科分类方案，解决传统云实亚科非单系性问题，识别六个单系亚科。包含近完整属级取样（698属）及约20%物种（3696种）的序列数据，提供系统发育树及相关文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共5个）：...
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北美泽菊属植物分类与系统发育研究数据集
数据集概述 本数据集为北美泽菊属（Euthamia）植物分类研究提供支持，包含形态学、分子系统发育及生物地理学分析数据，用于明确大西洋沿岸和墨西哥湾沿岸相关类群的分类地位，最终确定Euthamia hirtipes和Euthamia scabra为独立物种，并分析其分布驱动因素。 文件详解 文档类文件： ReadMe-...
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PickMe算法物种树重建样本选择数据集
数据集概述 本数据集围绕PickMe算法展开，该算法通过贝叶斯框架为基因树中的四分体拓扑分配后验概率，计算样本可靠性得分以辅助物种树重建的样本选择。数据集包含算法应用于乳草属目标捕获数据的相关文件，为系统发育基因组学研究提供样本筛选工具支持。 文件详解...
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RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415
数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料，包含经实验验证的植物NLR（核苷酸结合寡聚化结构域样受体）相关序列、注释及分析结果，涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据，为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件，具体说明如下： - 补充表格文件: -...
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树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019
数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料，包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等，为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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临床和环境来源的弯孢属三个新物种补充材料1
数据集概述 本数据集是关于弯孢属（Curvularia）新物种研究的补充材料，包含基于ITS、gapdh和tef1基因联合分析构建的系统发育树，用于展示三个新物种与已知物种的亲缘关系，为分类学研究提供可视化支持。 文件详解 文件名称: oo_422148.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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红衣主教唐纳雀属系统基因组学测序方法比较数据集
数据集概述 本数据集围绕红衣主教唐纳雀属（Piranga）的系统基因组学研究展开，对比了RAD-seq和UCEs两种测序方法在不同分类水平下的系统发育推断效果，包含两种方法的测序数据、物种树分析结果及补充信息，为鸟类系统发育研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件（.zip格式）： uce_raxml.zip：UCE数据的RAxML分析结果文件...
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霍布尔等人蜘蛛系统发育研究补充材料2_2018
数据集概述 该数据集为霍布尔等人2018年发表的幽灵蛛科（Pholcidae）系统发育研究的补充材料2，包含基于RAxML推断的全类群最大似然树（图S2）及支持值说明，用于支撑论文中分子数据的系统发育关系分析。 文件详解 文件名称: oo_234250.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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Ardissoneaceae修订研究补充材料5
数据集概述 本数据集为Ardissoneaceae修订研究的补充材料5，包含基于3基因数据集的RAxML最大似然分析分子系统发育树图（图S3），支持对该科分类修订及新属新种描述的研究。 文件详解 文件名称: oo_746754.pdf 文件格式: PDF 文件内容: 包含图S3，展示3基因数据集RAxML最大似然分析的分子系统发育树结果 数据来源...
