-
西部_Plethodon_蝾螈历史物种分布模型与物种界限数据集
数据集概述 本数据集围绕西部Plethodon属蝾螈的物种界限研究，整合了历史物种分布模型（SDM）与分子分析数据。通过构建当前分布模型并回推至末次盛冰期（21 Ka）气候条件，结合分子方法探讨物种界限，为理解历史分布对物种划分的影响提供数据支持。 文件详解 该数据集包含26个文件，主要分为两类： - 分子数据文件（.nex格式，共21个）： -...
-
现代人类生殖基因中的古老适应性基因渗入数据集
数据集概述 本数据集聚焦现代人类生殖基因中来自尼安德特人或丹尼索瓦人的古老适应性基因渗入现象，包含基因渗入检测、正选择分析结果，以及高分辨率图片和补充表格，为研究古老基因渗入对现代人类生殖基因的影响提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型文件，具体说明如下： - 核心分析文件: -...
-
寒武纪早中期环境变化下娜罗虫类节肢动物系统发育响应数据集
数据集概述 本数据集围绕寒武纪早中期环境变化对娜罗虫类节肢动物的系统发育响应展开，通过重建灭绝事件前后的系统发育关系，探究深水陆架生物对环境扰动的耐受性，为布尔吉斯页岩型生物群避难所假说提供实证支持。 文件详解 附录文档（.docx格式）：...
-
狐猴系统发育与分化时间数据集
数据集概述 本数据集整合形态学与DNA序列数据，通过尖端定年（TD）和化石化生死过程（FBD）模型，推断现生及灭绝狐猴的系统发育关系与分化时间，涉及马达加斯加特有狐猴88%的类群，为灵长类演化历史研究提供支持。 文件详解...
-
有颌脊椎动物系统发育与早期演化分析数据集
数据集概述 本数据集围绕有颌脊椎动物的系统发育展开，通过修正形态学数据集并采用贝叶斯尖端定年形态钟方法，探究盾皮鱼类的单系性及有颌脊椎动物的早期演化速率，为理解颌起源这一关键进化事件提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_information.pdf 文件格式: PDF 内容: 补充说明文档，包含研究方法、结果细节等辅助信息...
-
木槿族_锦葵科_系统发育关系研究比对与树文件数据集
数据集概述 本数据集包含木槿族（锦葵科）系统发育关系研究的基因比对文件与系统发育树文件，基于迄今最全面的分类群采样构建，涉及传统定义的木槿属和孔雀葵属的多系性分析，以及新属的分类修订，为该族植物分类提供关键数据支持。 文件详解 数据集包含5个文件，具体说明如下： - 文件名称：README.md - 文件格式：Markdown（.md） -...
-
系统发育分析中分层特征整合数据集
数据集概述 该数据集围绕系统发育分析中分层特征整合展开，包含用于评估新优化标准的合成与实证数据，涉及字符矩阵、字符类型文件及系统发育树文件，支持对比不同处理不适用字符方法的效果。 文件详解 核心数据文件：...
-
异源多倍体同源基因亲本基因组分配与物种树推断数据集_烟堇属案例
数据集概述 本数据集围绕异源多倍体物种中同源基因向亲本基因组的分配方法展开，旨在解决复杂进化历史下的物种树推断问题。以植物烟堇属（罂粟科）为研究案例，包含用于基因组系统发育分析的序列比对文件及补充说明文档，为多倍体物种的网状进化关系研究提供数据支持。 文件详解 核心序列文件（.nex格式）：...
-
蝴蝶分化时间贝叶斯分析的先验与后验数据集
数据集概述 本数据集包含蝴蝶（凤蝶总科）属级系统发育时间校准分析的相关结果与数据文件。核心内容为通过贝叶斯方法分析蝴蝶分化时间的先验与后验分布，涉及994个类群、多基因片段及化石与宿主植物校准点，为蝴蝶起源时间及系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 系统发育树文件（.tre格式，共10个）： -...
-
安乐蜥适应性辐射中肢体异速生长与进化意义数据集
数据集概述 本数据集围绕安乐蜥（Anolis）适应性辐射过程中肢体异速生长的发育模式与进化意义展开，包含15种安乐蜥胚胎期13个前后肢骨骼的生长协变数据，以及267种安乐蜥肢体骨骼的进化协变数据，用于验证适应性形态是否受生长轨迹的偏向影响。 文件详解 代码文件:...
-
咖啡科_茜草科_基因组数据的系统发育信号冲突数据集
数据集概述 本数据集包含咖啡科（茜草科）植物的基因组系统发育分析数据，涵盖58个质体基因组序列及对应类群的核rDNA顺反子数据。数据用于两种质体数据集（仅蛋白编码基因、蛋白编码+非编码区）和核rDNA数据集的系统发育分析，揭示数据中存在的系统发育信号冲突，为解析茜草科系统发育关系提供基础数据。 文件详解 系统发育数据文件（.nex格式）：...
-
Megasternini陆生水_scavenger_beetles分子系统发育数据集
数据集概述 该数据集包含用于Megasternini陆生水 scavenger beetles（Hydrophilidae科）分子系统发育分析的完整比对文件，以及Hydrophilidae科最终定年树的补充文档，支持古新世-始新世极热事件期间大陆交换研究。 文件详解 分子比对文件（.nex格式）：...
-
真兽类白垩纪末大灭绝形态差异数据集
数据集概述 本数据集聚焦白垩纪末大灭绝事件前后真兽类（胎盘哺乳动物及其干群）的形态差异变化。通过重建177个类群的祖先形态，结合幽灵谱系形态数据，评估了白垩纪至古近纪不同时间区间的三种形态差异指标，揭示了真兽类对灭绝事件的形态响应模式。 文件详解 系统发育数据文件（.nex格式）： Supplementary File 1 DF cal3...
-
亚洲狼蛇属多基因位点系统发育数据集
数据集概述 本数据集聚焦亚洲狼蛇属（Lycodon）的系统发育研究，通过多基因位点分析揭示其物种分化模式。包含系统发育树文件、野外采集编号关键文件及全数据文件，为研究该属物种关系、分类修订及形态特征演化提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式）： ML_Bootstrap.tre：最大似然法分析的带 bootstrap 支持的系统发育树...
-
Euphorbia_polycarpa复合体的进化历史与分类学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕Euphorbia polycarpa复合体（大戟科地锦亚属异叶组）的进化历史与分类学研究展开，包含分子系统发育分析文件及配套图表，为厘清该类群的分类争议、揭示其演化关系提供数据支持。 文件详解 文件名称：POLY_ITS_gN_FINAL.nex、POLY_PSB_gN_iC_FINAL.nex 文件格式：.nex...
-
中国吻虾虎鱼系统基因组学系统发育重建序列比对矩阵数据集
数据集概述 本数据集为论文《中国吻虾虎鱼系统基因组学揭示南北分化与性状演化》配套的系统发育重建序列比对矩阵，包含用于该研究的核心序列比对数据。 文件详解 文件名称: Phylogenomics of Rhinogobius gobies reveal norther/input_aligned.nex 文件格式: NEXUS格式（.nex） 内容说明:...
-
蒙尼茨绦虫nad1_cox1序列比对数据集
数据集概述 该数据集包含用于北方鹿科动物（驼鹿和驯鹿）体内蒙尼茨绦虫属（Moniezia spp.）系统发育与分子系统学分析的线粒体cox1、nad1基因及串联核苷酸序列比对数据，为蒙尼茨绦虫的分子分类与亚属分类研究提供基础数据支持。 文件详解 目录: Moniezia nad1_cox1 data/ 文件列表:...
-
须腹菌属_黄杉属外生菌根共生基因组规模序列分型数据集
数据集概述 本数据集为研究须腹菌属（Rhizopogon）与黄杉属（Pseudotsuga）外生菌根共生关系的基因组规模序列分型（GSST）数据，包含核苷酸序列比对、系统发育树文件、基因座坐标文件及相关分析脚本，支持共生演化与共迁移研究。 文件详解 系统发育树文件: RAxML_bipartitions_ITS_alignment.tre:...
-
西方蜜蜂线粒体基因组进化历史分析数据集
数据集概述 本数据集围绕西方蜜蜂（Apis mellifera）线粒体基因组展开，通过分析十八个亚种的完整线粒体基因组，探究其进化与生物地理历史，支持其起源于北非或中东的结论，为蜜蜂系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按不同分析路径分类存储，包含序列数据、系统发育分析输入文件及结果文件，具体如下： - 序列数据文件（.phy格式）: -...
-
最大羽螨属Proctophyllodes极长阳茎趋同与单向演化数据集
数据集概述 该数据集聚焦羽螨科最大属Proctophyllodes，包含其极长阳茎趋同与单向演化的比较分子及形态系统发育学证据，由形态学与分子数据集构成，为研究该属形态特征演化及系统发育关系提供数据支持。 文件详解...
