-
山地苔草物种系统地理相似性协方差的物种分化轴测试数据集
数据集概述 该数据集围绕四种落基山脉苔草物种（Carex属）的系统地理模式展开，通过对比物种的分布范围大小与生态位宽度两个属性，探究其对遗传变异空间结构的影响，揭示了分布范围大小与物种间空间遗传协变的相关性。 文件详解 核心数据文件: chalciolepis_97_30maf2_unlinked.vcf:...
-
鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状全基因组关联研究数据集
数据集概述 本数据集基于全基因组关联研究（GWAS），探究鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状的遗传标记。包含185份鹰嘴豆材料在黎巴嫩两地两年间灌溉与雨养环境下的表型数据、SNP基因分型数据及关联分析结果，为鹰嘴豆抗旱育种提供遗传依据。 文件详解 表型数据文件：...
-
Viridian共识序列与元数据2024_10_14
数据集概述 该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包，包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列，并转换为VCF Zarr格式，以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。 文件详解 文件名称：viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip...
-
濒危德尔马熊果保护遗传学RAD测序数据集
数据集概述 本数据集围绕濒危物种德尔马熊果（Arctostaphylos glandulosa supsp. crassifolia）的保护遗传学研究，通过RAD测序技术获取SNP数据，分析其与近缘亚种的遗传关系，旨在验证形态学分类是否反映真实遗传模式，为保护规划提供依据。 文件详解 VCF格式数据文件（共3个）：...
-
果蝇对新型实验室环境适应性的选择等位基因轨迹数据集
数据集概述 该数据集记录了黑腹果蝇在新型实验室环境下的适应性进化过程，通过实验进化与Pool-Seq全基因组测序技术，识别了5000余个偏离中性预期的选择等位基因（SNP），并追踪其异质性进化轨迹（持续上升或先升后稳），为进化生物学中环境适应的基因组机制研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件： Description of Bioinformatic...
-
北极海鸟象牙鸥种群数量下降的遗传证据研究数据集
数据集概述 本数据集为探究北极海鸟象牙鸥种群数量下降遗传证据的研究数据，包含遗传分析相关的原始数据、处理文件及说明文档，覆盖全球部分分布区域的样本，为检验象牙鸥近期种群瓶颈遗传信号提供数据支持。 文件详解 README.pdf：PDF格式，研究说明文档，可能包含数据集背景、实验设计及使用说明等内容...
-
同源导入小鼠线粒体DNA谱分析处理数据文件
数据集概述 本数据集包含同源导入小鼠线粒体DNA谱分析项目中所有使用和生成的处理数据文件，涵盖变异数据、频率统计、深度数据等关键分析结果，通过配套PDF文档提供文件和字段说明，为线粒体DNA变异与功能研究提供结构化数据支持。 文件详解 核心分析文件（包含于压缩包中）： somatic_mutations.vcf：VCF格式，体细胞变异数据文件...
-
网纹怀俄明菊_菊科_保护基因组学数据集
数据集概述 该数据集为网纹怀俄明菊的保护基因组学研究数据，包含168个样本的高分辨率基因组信息，样本来自加州埃尔多拉多县派恩山地区的7个已知种群中心，用于分析无性繁殖频率、种群遗传变异及遗传模式的生态关联。 文件详解 文档文件（PDF格式）： Appendix_S7.pdf：可能包含研究附录或补充材料...
-
SARS_CoV_2再感染病例基因组证据数据集
数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2再感染病例的基因组证据展开，包含该病例相关的基因组测序数据、变异分析文件、实验方法脚本及附录文档，为研究新冠病毒再感染的基因组特征提供支持。 文件详解 该数据集包含14个文件，按类型分类说明如下： - 基因组变异文件（.vcf格式，共5个）： -...
-
北美奶蛇生态分化与基因流历史数据集
数据集概述 该数据集围绕北美奶蛇（Lampropeltis triangulum复合体）的生态分化与基因流历史展开，通过基因组数据和建模方法分析物种形成机制、杂交区位置及基因渐渗模式，验证基于小数据集界定的三个类群（L. elapsoides、L. triangulum、L....
-
漫茎矢车菊本地与入侵种群表型差异基因组分析数据集
数据集概述 本数据集围绕漫茎矢车菊（Centaurea diffusa）本地与入侵种群的表型差异展开基因组分析，包含该物种的基因组参考序列、表型数据、SNP标记及全基因组关联分析（GWAS）结果，为研究入侵植物适应性进化的遗传机制提供支持。 文件详解 基因组与序列文件：...
-
加州金杯栎基因组谱系分化与基因渐渗数据集
数据集概述 本数据集为加州金杯栎（Protobalanus组）基因组研究相关数据，包含样本信息、系统发育分析文件及基因变异数据，支撑对其隐存谱系分化与基因渐渗现象的研究。 文件详解 数据集包含一个目录下的八个文件，具体说明如下： - 样本信息文件： - Samples.xlsx：Excel格式文件，可能包含实验样本的基础信息 - 系统发育分析文件： -...
-
绵羊COL7A1基因变异信息数据集
数据集概述 该数据集包含绵羊COL7A1基因的变异信息，整合了公开数据集与自生成数据集的相关数据，为研究绵羊COL7A1基因的遗传变异特征提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: COL7A1 gene in sheep horn/public_COL7A1.vcf 文件格式: VCF (.vcf) 内容说明:...
-
复发性结直肠癌转移克隆性与时间分析的全基因组单细胞测序数据集
数据集概述 该数据集包含支持《Clonality and timing of relapsing colorectal cancer metastasis revealed through whole-genome single-cell...
-
两种隐存浮萍物种种群遗传结构数据集
数据集概述 本数据集为采用基因分型测序方法研究阿尔伯塔省两种隐存浮萍物种（少根紫萍与具冬芽紫萍）种群遗传结构的研究数据，包含四个基于不同参考基因组和物种组合的VCF格式文件，支持相关遗传分析。 文件详解 综合物种数据集: Lemna_minor_&_turionifera_lm550refgenom.vcf:...
-
基于体细胞突变的人类前列腺发育成熟与维持数据集
数据集概述 该数据集包含409份人类正常前列腺上皮显微切割样本的全基因组体细胞碱基替换数据，通过体细胞突变分析探究人类前列腺的发育、成熟与维持机制，相关研究成果已发表于学术期刊。 文件详解...
-
壶菌病导致极度濒危蛙类抗病遗传潜力数据集
数据集概述 本数据集包含受壶菌病影响的极度濒危蛙类的原始表型数据与SNP基因型数据，聚焦其抗病遗传潜力研究，为濒危物种保护遗传学分析提供基础数据支持。 文件详解...
-
SVCFit_结构变异拟合算法基准测试完整数据集
数据集概述 本数据集为SVCFit软件的性能基准测试数据，用于重现相关研究论文中的图表结果。数据包含单克隆和多克隆结构变异模拟的输入文件、VCF变异文件、SVclone软件输出结果以及运行时间记录。数据集通过VISOR工具生成模拟数据，支持结构变异细胞分数推断算法的验证和性能比较。 文件详解 输入文件（input） 文件格式：BED...
-
巴西北部及西北部Spondias_mombin自然种群SNP标记数据集
数据集概述 该数据集包含巴西北部及西北部地区Spondias mombin自然种群的原始单核苷酸多态性（SNPs）数据，为研究该物种的遗传多样性、种群结构等提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: spondias_mombin_snps.vcf 文件格式: VCF (.vcf) 内容说明: 存储Spondias...
-
肿瘤突变负荷分析的生物信息学方法挑战数据集2021
数据集概述 本数据集围绕肿瘤突变负荷（TMB）分析的生物信息学方法挑战展开，包含使用商业面板检测的培养及石蜡包埋细胞系的测序数据，涉及不同生物信息学流程分析结果的对比，为TMB检测标准化研究提供支持。 文件详解 目录：VCF Fenizia F. Oncol Lett 2021/ 文件格式：VCF（.vcf），共11个文件 具体文件示例：...
