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Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据
数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化,包含约9000个SNP位点的分析数据,结合原住民知识,揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化,为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件(2个) 文件名称:Bowles_et_al-...
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Oregon_junco_Based_歌雀谱系分化基因组漂移与局部适应性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美西部俄勒冈歌雀的快速谱系分化过程,包含基因组水平的SNP位点数据及环境变量数据,用于研究中性漂移与局部适应性在种群分化中的相对作用,涉及孤立干旱山区种群与湿润北部种群的遗传结构差异,支持遗传-环境关联分析。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式,共4个)...
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East_Adriatic_Sheep_X染色体_选择信号识别_畜牧基因组研究数据
数据集概述 本数据集记录东亚得里亚海绵羊X染色体的选择信号识别结果,包含8个克罗地亚本地绵羊品种(101只雌性、100只雄性)及10只摩弗伦羊的基因组数据,通过经典方法与新方法HRiD识别出14个选择信号及34个注释基因,为研究绵羊X染色体适应性基因提供支持。 文件详解 README_Overall.txt 文件格式:TXT...
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Mesodesma_donacium_SNP_Based_基因注释与多态性分析数据
数据集概述 本数据集围绕软蛤Mesodesma donacium的表达序列标签(EST)数据展开,通过454焦磷酸测序生成180159条EST,经从头组装得到10178个contigs和41765个singletons,最终发现2594个SNP位点,涉及613条共识序列,还包含基因本体(GO)分析及SNP验证相关信息,为该物种遗传研究提供基础数据。...
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Dryad_Data_BMCEvolBiol_北大西洋鳗鱼空间选择平行模式研究数据
数据集概述 本数据集围绕北大西洋两种鳗鱼(欧洲鳗和美洲鳗)的空间选择平行模式展开研究,通过80个编码基因SNP位点对欧洲鳗8个采样点个体进行基因分型,分析单代空间选择特征及等位基因频率与环境变量的关联,识别出11个可能受选择的编码基因位点,探讨物种间选择模式差异的原因。 文件详解 文件名称:Data_Dryad_BMCEvolBiol.xlsx...
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恩蒂亚特奇努克鲑鱼基于哥伦比亚河上游产卵分布重叠与杂交研究数据_2003_2017
数据集概述 本数据集记录华盛顿州哥伦比亚河上游濒危春季奇努克鲑鱼与非濒危夏季奇努克鲑鱼的产卵时空分布重叠及杂交情况。包含2003-2017年红鱼巢调查数据,以及2009-2014年亚成体幼鱼的90个SNP位点基因分型数据,用于分析产卵分布重叠程度与杂交率,为鲑鱼保护提供依据。 文件详解 文件名称:EntiatChinookFinal.xlsx...
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Northern_pike_Genomic_Based_新疆白斑狗鱼种群基因组分析数据
数据集概述 本数据集包含中国新疆白斑狗鱼(Esox lucius)的种群基因组研究数据,涉及额尔齐斯河、乌伦古湖、乌伦古河附近小湖及博斯腾湖4个种群。数据涵盖种群基因组参数估算、基因流分析及有效种群大小评估结果,共17个文件,支持鱼类种群遗传学研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
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Helianthus_argophyllus_Based银叶向日葵生活史多态性研究数据
数据集概述 本数据集记录银叶向日葵(Helianthus argophyllus)的生活史多态性研究数据,包含18个种群在公共花园实验中的表型变异及遗传分析结果,验证地理异质自然选择驱动其生态物种形成的早期信号,涉及表型综合征分类、遗传结构与表型分化的关联分析。 文件详解 文件名称:all_sequenom_data_forDryad.xlsx...
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Almawi_PLoS_One_VEGFA基因变异与VEGF水平对PCOS贡献研究数据
数据集概述 本数据集是关于VEGFA基因变异与VEGF水平变化对多囊卵巢综合征(PCOS)发病机制贡献的研究数据,来自Almawi发表于PLoS One的相关研究。包含PCOS患者与对照人群的VEGFA基因多态性检测、VEGF水平测定及临床指标关联分析的结构化数据,支持验证VEGF在PCOS发病中的作用。 文件详解 文件名称:Almawi PLoS...
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Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据
数据集概述 本数据集围绕彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)的基因组多样性与栖息地适应性展开,包含8个采样点(含独特湖泊栖息地)的形态特征、热耐受性及基因组数据,用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系,共9个文件。 文件详解 基因组与种群结构相关文件 文件名称:VCF_RDarters.vcf 文件格式:VCF...
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Felis_silvestris_Source_欧洲野猫与家猫杂交检测SNP数据_公开版
数据集概述 本数据集包含用于检测欧洲野猫与家猫基因渐渗的158个单核苷酸多态性(SNP)位点数据,样本涵盖139只家猫、130只疑似欧洲野猫及5只圈养杂交猫,共274个个体。数据可用于评估SNP位点区分杂交个体的效能,为欧洲野猫的遗传保护提供分子检测工具支持。 文件详解 文件名称:SNPs_publication_ATCG.xlsx 文件格式:XLSX...
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Buckingham_2022_Plethodon_cinereus种群基因组分析数据集
数据集概述 本数据集包含北美蝾螈(Plethodon cinereus)两种形态种群的基因组分析数据,支持长岛地区纯色种群从原同域分布形态分化为邻域分布的研究结论。数据基于双酶切RAD测序技术,涵盖SNP比对信息及分析脚本,用于验证种群单系性及分化模式,共包含4个文件。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Mendelian_Randomization_血清TSH与肥胖双向因果关联研究补充数据
数据集概述 本数据集是论文“Causal association between serum thyroid-stimulating hormone and obesity: A bidirectional Mendelian randomization...
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Hippocampus_erectus_RADseq_Based_海马种群基因组分析数据
数据集概述 本数据集基于RADseq技术生成,包含11,708个单核苷酸多态性(SNP)位点,样本来自墨西哥湾东部至纽约长岛的海马个体。通过基因组分析揭示西大西洋中海岸海马(Hippocampus erectus)的种群结构,验证弗吉尼亚省种群为历史持久的本地种群而非热带流浪者,支持其冷季离岸迁移行为。 文件详解...
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Picea_mariana_Picea_rubens_Based_云杉种间渐渗基因组分析数据
数据集概述 本数据集聚焦黑云杉(Picea mariana)与红云杉(Picea rubens)的种间渐渗基因组研究,通过对33个种群的385株个体进行12个连锁群上300个SNPs的基因分型,分析种间渐渗的异质性模式,揭示物种形成进程中基因组的渗透差异及选择作用,为物种界定提供依据。 文件详解 文件名称:Complete genotype...
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Association_Mapping_Based_挪威云杉木材形成候选基因位点关联分析数据
数据集概述 本数据集为挪威云杉木材形成性状关联分析研究的配套数据,包含基因数据、关联分析代码、性状数据表格、个体编号列表、SNP位点信息等7个文件,支持木材形成相关候选基因位点的识别与分析,覆盖基因数据存储、关联分析、稳定性选择等研究环节。 文件详解 基因数据文件 文件名称:geno.RData 文件格式:RData...
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PGENETICS_ReCombine_Based_Tel1_ATM缺失减数分裂重组研究数据
数据集概述 本数据集包含酿酒酵母野生型(WT)及tel1、sgs1、zip3、msh4等基因突变体(含双突变体tel1 zip3、sgs1 zip3)的高通量测序和微阵列数据,用于分析Tel1/ATM缺失对减数分裂重组的影响,包括交叉干扰降低、ZMM非依赖重组增加及DSB分布变化等现象。 文件详解...
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Lissotriton_SNP_Based_Carpathian蝾螈遗传结构与基因流研究数据
数据集概述 本数据集基于139个转录组来源的核单核苷酸多态性(SNP)位点,分析喀尔巴阡蝾螈(Lissotriton montandoni)的遗传结构及与光滑蝾螈(L. vulgaris)的种间基因流。数据揭示喀尔巴阡蝾螈的两个分化种群可能源于东喀尔巴阡山脉的不同避难所,以及近期种间基因渗入现象,为种群遗传研究提供支持。 文件详解...
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Capsella_bursa_pastoris_Based_欧亚多倍体植物基因组殖民化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦荠菜(Capsella bursa-pastoris)这一异源多倍体植物,通过基因分型测序获取261份欧亚大陆样本的4274个SNP位点,分析其基因组多样性、种群结构及殖民化历史,揭示其从中东向欧洲、东亚扩张的多阶段过程,为多倍体植物进化研究提供数据支持。 文件详解 README文件...
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Dryad_Frontiers_Based_德国及全球水牛遗传多样性与群体结构研究数据2021
数据集概述 本数据集为德国水牛(Bubalus bubalis)遗传多样性与群体结构研究的支撑数据,包含德国4个群体及保加利亚、罗马尼亚等欧洲国家共285份样本的基因分型数据,同时整合了巴西、印度等全球多地220份公开基因型数据,用于分析德国水牛的遗传背景及与全球群体的关系,共包含3个文件。 文件详解...



