数据集 - 海数据

Y型沸石吸附密度泛函理论手稿数据集

2025年11月27日

数据集概述本数据集包含离子交换Y型沸石吸附硫和芳香族物质的密度泛函理论（DFT）计算相关文件，涵盖NBO7输出文件、分子结构文件及焓值数据，为沸石吸附性能的理论研究提供支持。文件详解根目录文件： Enthalpies.xlsx：Excel格式文件，可能包含吸附过程的焓值数据 CeY目录（CeY/）：包含CeY-BT.pdb、CeY-...

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DNA侧翼增强CreA_ZFD结合数据集

2025年11月27日

数据集概述本数据集聚焦DNA 5'侧翼序列对CreA-ZFD结合能力的增强作用，核心发现为侧翼序列可使结合亲和力提升2.8倍。包含质粒构建、蛋白表达纯化、结合实验及结构模型等多类文件，为分子生物学相关研究提供支持。文件详解数据集包含16个文件，均位于“DNA flank enhances CreA-ZFD...

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af2rave_基于物理采样的蛋白质集合生成数据集

2025年11月27日

数据集概述本数据集是“af2rave: 基于物理采样的蛋白质集合生成”项目的代码与数据集合，包含针对ADK、DDR1、RBD三种蛋白质的AlphaFold预测结构、晶体结构、分析脚本及模型文件，以PDB格式为主，为蛋白质结构动态研究提供数据支持。文件详解该数据集按蛋白质类型分类存储，具体说明如下： -...

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挑战性靶点蛋白质结构预测工具比较研究_蛇毒毒素

2025年11月26日

数据集概述本数据集收录了针对蛇毒毒素这一挑战性靶点的蛋白质结构预测工具比较研究中使用的所有结构文件。研究评估了AlphaFold2、ColabFold等工具在无参考模板情况下的预测性能，发现AlphaFold2表现最优，ColabFold计算成本更低，所有工具在无序区域预测上存在局限，为相关蛋白质结构研究提供数据支持。文件详解...

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哺乳动物CatSpers超四级结构的膜内二硫键交联研究模型数据

2025年11月26日

数据集概述该数据集包含一个基于膜内二硫键交联研究构建的小鼠CatSper1-4蛋白模型文件，用于阐明哺乳动物CatSpers的超四级结构，模型呈现为两个反向平行且通过CatSper3交联的线性二聚体组成的四聚体，推测其沿精子鞭毛主段延伸形成双排聚合物。文件详解文件名称：mcatsper_16.pdb 文件格式：PDB（.pdb）...

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RNA三维结构预测方法比较分析数据集

2025年11月26日

数据集概述本数据集为RNA三维结构预测方法比较分析研究的配套数据，聚焦RNA-配体相互作用建模准确性评估。包含六种预测程序（DeepFoldRNA、RhoFold等）的建模结果，部分方法含有无二级结构输入的对比数据，还新增了用于基准测试的Blind Set 1和Blind Set 2数据集，以PDB格式为主存储结构预测结果。文件详解...

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麻疹风疹疫苗研究数据集

2025年11月26日

数据集概述本数据集是与麻疹风疹疫苗研究相关的实验数据集合，包含疫苗研究中的分子建模、对接结果、结构评估、材料信息及正常模式分析等多类数据文件，为麻疹风疹疫苗的研究提供了全面的数据支持。文件详解该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下： - 目录：Measles-Rubella Vaccine Research Data/ -...

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AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751

2025年5月31日

AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质结构预测,AlphaFold,JiNYUAN,PDB,生物信息学,科研,教育,数据科学数据概述：...

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蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip

2025年5月30日

蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质结构，生物信息学，数据集，结构分析，角度计算，分子动力学，化学信息学，生物医学数据概述：...

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蛋白质结构与功能数据集-ankerhuang

2025年5月30日

蛋白质结构与功能数据集-ankerhuang 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质，结构生物学，蛋白质组学，生物信息学，蛋白质结构预测，机器学习，生物学，数据集数据概述：该数据集包含了大量的蛋白质结构和功能相关数据，主要记录了蛋白质的序列、三维结构、功能注释以及相关实验数据。主要特征如下：时间跨度：...

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蛋白质结构预测数据集KG-TrainPDBs-ivanblch

2025年5月30日

蛋白质结构预测数据集KG-TrainPDBs-ivanblch 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质结构，蛋白质数据库，数据集，生物信息学，分子生物学，结构预测，机器学习，蛋白质折叠数据概述：该数据集包含来自蛋白质数据库（PDB）的蛋白质结构数据，主要用于蛋白质结构预测和相关研究。主要特征如下：...

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多胺氧化酶三层模型数据集MOA-3Layers-LB1839Dataset-yosukeyama

2025年5月28日

多胺氧化酶三层模型数据集MOA-3Layers-LB1839Dataset-yosukeyama 数据来源：互联网公开数据标签：生物化学，酶学，数据集，蛋白质建模，机器学习，生物信息学，药物研发，分子动力学数据概述：该数据集包含多胺氧化酶（MOA）的三层结构模型数据，记录了多胺氧化酶在不同条件下的活性、结构和动力学特征。主要特征如下：...

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生物分子结构与模拟数据集Leash-Bio-BlenderDataset-andrey67

2025年5月28日

生物分子结构与模拟数据集Leash-Bio-BlenderDataset-andrey67 数据来源：互联网公开数据标签：生物学，分子动力学，数据集，蛋白质，Blender，结构模拟，计算生物学，机器学习数据概述：该数据集包含使用Leash-Bio-...

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蛋白质结构接触频率分析数据集ProteinStructureContactFrequencyAnalysis-cdeotte

2025年5月28日

蛋白质结构接触频率分析数据集ProteinStructureContactFrequencyAnalysis-cdeotte 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质结构, 生物信息学, 接触频率, 结构生物学, 分子动力学, 蛋白质建模, 机器学习, 数据分析数据概述：该数据集包含蛋白质结构数据，记录了蛋白质残基之间的接触频率信息。主要特征如下：...

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生物信息学蛋白质结构预测数据集B0-NS-Fold012ProteinStructurePredictionDataset-dragonzhang

2025年5月28日

生物信息学蛋白质结构预测数据集B0-NS-Fold012ProteinStructurePredictionDataset-dragonzhang 数据来源：互联网公开数据标签：生物信息学，蛋白质结构，数据集，机器学习，预测模型，结构生物学，深度学习，生物医学数据概述：...

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RNA结合与非结合蛋白数据集-anishnaskar

2025年5月28日

RNA结合与非结合蛋白数据集-anishnaskar 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质组学，RNA结合蛋白，数据集，生物信息学，机器学习，结构生物学，基因表达，蛋白质分析数据概述：该数据集包含来自多个来源的RNA结合蛋白（RBP）和非RNA结合蛋白的详细信息，用于研究蛋白质与RNA相互作用的特性。主要特征如下：时间跨度：...

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蛋白质三维结构数据集Ribonanza3DDataProcessedDataset-davidbtcox

2025年5月19日

蛋白质三维结构数据集Ribonanza3DDataProcessedDataset-davidbtcox 数据来源：互联网公开数据标签：蛋白质结构，生物信息学，数据集，三维模型，分子生物学，机器学习，结构分析，生物医学数据概述：该数据集包含经过处理的蛋白质三维结构数据，记录了多种蛋白质的原子级三维坐标和结构信息。主要特征如下：...