找到15个数据集

格式: ZIP 标签: Trinity组装

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  • Ant_Agriculture_Based_蚂蚁农业进化与真菌驯化研究数据

    2026年1月21日 30 140 8

    数据集概述 本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开，包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史，探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程，共包含八个文件，以压缩包为主。 文件详解 生物地理与性状多样化文件（biogeo-trait-diversification-files.zip） 文件格式：ZIP...
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  • Dryad_Based_Dendrogramma物种系统发育基因组研究数据

    2026年1月21日 30 158 0

    数据集概述 本数据集为Dendrogramma物种的系统发育基因组研究数据，包含新采集标本的相关数据文件。Dendrogramma曾被认为是全新门级生物，本研究通过数据表明其属于刺胞动物门管水母目Rhodaliidae科的底栖管水母。数据集含五个文件，用于支持该物种分类的研究分析。 文件详解...
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  • Arachnida_UCE_Based_蛛形纲超保守元件探针集系统发育分析数据

    2026年1月19日 30 210 125

    数据集概述 本数据集包含用于蛛形纲系统发育研究的超保守元件（UCEs）探针集相关数据，涵盖32种不同蛛形纲物种的目标测序结果，平均获取487个UCE位点，可支持系统发育分析、物种界定及多样性研究，共包含2个压缩文件。 文件详解 Trinity_assemblies.zip 文件格式：ZIP...
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  • Xcc_BrA1_Genome_Transcriptome_Based铜胁迫研究数据

    2026年1月18日 30 181 4

    数据集概述 本数据集包含实验室重测序的Xcc菌株BrA1基因组拼接contigs、基因组注释文件，以及铜胁迫转录组研究中通过Trinity从头组装的差异表达基因（DEG）转录本。数据来自Behlau et al 2017的菌株，采用混合RNA-seq分析流程生成，共包含5个文件，支持Xcc菌株基因功能与铜胁迫响应机制研究。 文件详解...
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  • Brachycephalus_Bd_GPL_Brazil_两栖动物宿主免疫反应研究数据

    2026年1月14日 30 177 158

    数据集概述 本数据集是论文“Host immune responses to enzootic and invasive pathogen lineages vary in magnitude, timing, and efficacy”的第二次发布版本，用于Zenodo存档。包含18个文件，涉及Brachycephalus pitanga暴露于Bd-...
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  • EisenbergSI_Based_鱿鱼神经系统转录本A_to_I_RNA编辑研究数据

    2026年1月13日 30 203 49

    数据集概述 本数据集来自鱿鱼神经系统转录本A-to-I RNA编辑研究，展示了鱿鱼（Doryteuthis pealeii）神经系统中多数转录本存在广泛的A-to-I...
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  • PmNIES217_转录组_从头组装_Penium_margaritaceum及其元数据

    2026年1月13日 30 52 24

    数据集概述 本数据集包含Penium margaritaceum（PmNIES217）的转录组从头组装结果及相关注释元数据，由4个文件组成。数据涵盖转录组序列、蛋白组序列、功能注释表格等内容，支持对该藻类基因功能、蛋白结构及代谢通路的研究。 文件详解 TrinityTranscriptome.okay.fasta 文件格式：FASTA...
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  • Parallel_molecular_routes_新西兰竹节虫冷适应平行分子进化研究数据

    2026年1月12日 30 61 57

    数据集概述 本数据集围绕新西兰特有竹节虫的冷适应平行进化展开研究，涵盖其系统发育构建、冷耐受生理指标测量及转录组分析结果，揭示不同竹节虫类群独立适应寒冷环境的分子机制与生理策略差异。 文件详解 文件名称：fasta_trinity_alignments.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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  • 迟滞钝泥龟_Hynobius_retardatus_捕食者_猎物诱导表型可塑性的转录组分析数据

    2026年1月12日 30 79 47

    数据集概述 本数据集包含北海道 Salamander（Hynobius retardatus）在捕食者和猎物诱导下表型可塑性的转录组分析数据，涵盖转录组注释、差异表达基因（DEG）分析结果、转录组序列、基因表达计数矩阵及形态测量数据，共6个文件，用于研究该物种表型可塑性的分子机制。 文件详解...
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  • Howea_palms_sympatric_speciation_gene_expression_data

    2025年12月30日 30 84 37

    数据集概述 本数据集围绕豪勋爵岛两种同域分化的Howea棕榈展开，包含转录组统计、样本统计及转录组序列文件，旨在探究基因表达与编码序列进化在生态物种形成中的作用，关联土壤适应性、开花时间等关键生态表型差异。 文件详解 Table_S5 - Transcriptome stats.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Global_transcriptome_Changes_Based_多年生黑麦草粉红雪霉早期感染转录组数据

    2025年12月29日 30 95 15

    数据集概述 本数据集记录多年生黑麦草受粉红雪霉（Microdochium nivale）早期感染时的转录组变化，包含抗病与感病基因型的转录组序列及差异表达基因、GO富集分析结果，用于研究非低温驯化条件下的抗病分子机制，共4个文件。 文件详解 差异基因与GO分析文件...
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  • Extension_Partial_Gene_Transcripts_Based_昆虫转录组组装与基因延伸数据

    2025年12月28日 30 181 152

    数据集概述 本数据集包含果蝇（Drosophila melanogaster）和红壁蜂（Osmia bicornis）的Trinity组装转录组数据，以及基因转录本延伸的相关文件。数据涉及转录组组装细节、部分基因转录本序列、延伸详情和软件评估结果，共6个文件，支持昆虫基因转录本延伸的研究分析。 文件详解 数据文件...
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  • 伪熊蜂基因树估计误差与超保守元件实证研究数据集

    2025年12月14日 30 48 12

    数据集概述 本数据集围绕伪熊蜂属（Pseudapis）的基因树估计误差展开实证研究，对比PhyloBayes、MrBayes、IQ-Tree和RAxML四种方法在超保守元件（>800个）分析中的表现，评估其对物种树构建的影响，为基因树估计提供实践指导。 文件详解 文件名称: readme.txt，格式: TXT，内容:...
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  • 蛰针类蜂类系统发育基因组学研究数据集

    2025年12月13日 30 158 125

    数据集概述 本数据集基于超保守元件（UCE）系统发育基因组学技术，针对蛰针类蜂类（Aculeata）家族间关系展开研究，涉及187个样本、超800个UCE位点序列数据，旨在明确蚂蚁和蜜蜂的系统发育亲缘关系，为理解社会演化模式及食性转变提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多个压缩包、表格和文档文件，具体说明如下： - 序列数据与比对文件: - uce-...
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  • Hypsibius_dujardini基因组水平基因转移研究数据集

    2025年12月6日 30 80 51

    数据集概述 本数据集为关于缓步动物Hypsibius dujardini基因组水平基因转移（HGT）研究的配套数据，包含基因组组装、注释、RNA测序、系统发育分析及补充文件等，用于验证该物种是否存在大量功能性水平基因转移，修正此前研究结论。 文件详解 核心数据文件：...
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