找到11个数据集

分类: 公开数据 标签: RAxML

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  • 蜘蛛系统发育研究补充材料3

    2025年12月7日 30 201 27

    数据集概述 本数据集为蜘蛛系统发育研究的补充材料,包含经RogueNaRok方法处理的最大似然树(RAxML)文件,标注有支持值,用于呈现排除干扰分类群后的简化分类群系统发育关系。 文件详解 文件名称: oo_234251.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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  • 系统发育组学超级矩阵推断的系统发育平台感知数据结构附录

    2025年12月7日 30 21 16

    数据集概述 本数据集是关于系统发育组学研究的附录文件,内容围绕“系统发育平台感知(PTA)数据结构”展开,该结构用于在分区模型下高效分析超级矩阵,可利用数据缺失情况下的(部分)平台和诱导分区树节省计算时间,提升系统发育推断效率。 文件详解 文件名称: Online-Appendix-Chernomor_et_al.pdf 文件格式: PDF...
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  • 托兰普侏儒壁虎分类修订的形态与分子数据集

    2025年12月6日 30 177 169

    数据集概述 本数据集为托兰普侏儒壁虎(Lygodactylus tolampyae)分类修订研究的原始数据,包含形态学原始数据、标本元数据及DNA数据的比对文件和树文件,支持对该物种复合体的分类学分析。 文件详解 该数据集包含11个文件,具体说明如下: - 核心数据文件: -...
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  • 苹果族Maleae系统发育与分类补充材料2

    2025年12月6日 30 63 56

    数据集概述 本数据集为苹果族Maleae系统发育与分类研究的补充材料,包含基于563个质体基因组通过最大似然法分析构建的系统发育树,用于支持相关分类学修订及旧世界石楠属植物的分类概要研究。 文件详解 文件名称: oo_1060372.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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  • 陆生植物起源研究数据集

    2025年12月6日 30 102 2

    数据集概述 本数据集围绕陆生植物起源研究展开,聚焦基因序列污染与缺失数据对系统发育推断的影响,通过验证数据质量揭示陆生植物与轮藻目、鞘毛藻目类群的亲缘关系,包含研究相关的文档、序列文件及进化树数据。 文件详解 文档文件(PDF格式): FigS3-54-Final.pdf、FigS55-109-Final.pdf:研究相关的补充图表文件...
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  • 硅藻进化的生态机遇与限制支持数据集2016

    2025年12月5日 30 70 19

    数据集概述 该数据集是硅藻进化研究的支持数据,包含542个分类单元(540种硅藻及2种波利多门藻)的序列比对、特征数据、系统发育树及相关分析脚本,为研究硅藻进化的生态机遇与限制提供基础数据支持。 文件详解 序列与拓扑文件 Nakov-etal-542-taxon-alignment-...
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  • 植物系统发育推断公共序列数据局限性分析数据集

    2025年12月5日 30 162 58

    数据集概述 本数据集围绕植物系统发育推断中公共序列数据的局限性展开,包含基于GenBank数据构建的陆生植物属级系统发育树及相关分析文件,通过系统发育数据决定性理论探讨数据稀疏性对推断的限制,为理解公共数据库在植物系统学研究中的应用价值提供支持。 文件详解 系统发育树文件:...
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  • 榕树与传粉榕小蜂协同多样化研究数据集

    2025年12月5日 30 187 87

    数据集概述 本数据集聚焦榕树(Ficus属)与传粉榕小蜂(Agaonidae科)的协同进化关系,包含近200对全球分布的互作物种对的基因序列数据,以及配套的系统发育分析工具与结果文件,为研究极端植物-昆虫协同多样化提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件: TreeRAxML_Ficus.txt: TXT格式,榕树物种的RAxML系统发育树数据...
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  • 山楂属基于质体基因组的亚属级系统发育框架补充材料

    2025年12月4日 30 208 24

    数据集概述 该数据集是关于山楂属(Crataegus)质体基因组系统发育研究的补充材料。核心内容为通过最大似然法(RAxML)分析构建的山楂属亚属级系统发育框架,支持对山东山楂母系地位及分类学概要的研究结论。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: oo_1248844.pdf - 文件格式: PDF (.pdf)...
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  • 蛔总科线虫分子系统发育与年代测定数据集

    2025年12月4日 30 27 26

    数据集概述 本数据集围绕蛔总科线虫的分子系统发育与年代测定展开,包含系统发育分析数据、分化时间估算结果及相关补充材料,为研究蛔总科线虫的演化历史、宿主转换及海陆生态适应提供数据支持。 文件详解 README_for_Data of Ascaridoidea.txt:文本格式,说明压缩包内包含的六个文件,如序列比对文件、系统发育树文件等...
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  • 澳洲类穴蛛跨印度洋扩散研究数据集

    2025年12月4日 30 25 16

    数据集概述 本数据集围绕澳洲类穴蛛(Migidae科)的跨印度洋扩散研究展开,包含分子系统发育分析结果。通过多基因测序与生物地理年代测定,探究Moggridgea属蜘蛛的跨洋扩散机制,为类穴蛛生物地理起源研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: RAxML_tree.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明:...
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