找到45个数据集

分类: 公开数据 标签: TRE格式

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  • 担子菌植物细胞壁分解基因家族数据集

    2026年2月15日 30 26 22

    数据集概述 本数据集包含44个担子菌门基因组中与植物细胞壁分解相关的42个基因家族的补充表格、蛋白质序列文件、系统发育分析文件及系统发育树文件。数据用于研究不同营养策略真菌的基因组成差异,揭示其分解机制,共101个文件。 文件详解 补充表格文件...
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  • 泥炭藓生态位偏好演化研究数据集

    2026年2月12日 30 29 7

    数据集概述 本数据集聚焦泥炭藓(Sphagnum)生态位偏好与系统发育的关联,包含39种泥炭藓的18个基因位点DNA序列、系统发育树及生态数据,用于测试生态位描述符的系统发育信号及演化速率变化,揭示泥炭藓微生境偏好的进化规律。 文件详解 Sphagnum_all_genes.nex 文件格式:NEX...
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  • 珊瑚三角区_珊瑚物种丰富度数据的起源与演变

    2026年2月9日 30 153 25

    数据集概述 本数据集围绕印度-太平洋珊瑚三角区这一海洋生物多样性热点,聚焦珊瑚物种丰富度的起源与进化问题。通过时间校准的珊瑚进化树、物种地理分布范围及模型估算的区域物种形成、灭绝和地理范围转移速率等数据,为研究该区域珊瑚多样性的形成机制提供支撑。 文件详解 进化树文件 文件名称:RSTBtree.tre、Acroporidae.tre 文件格式:TRE...
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  • PHYLOGENIES_水生群体无脊椎动物繁殖策略进化系统发育数据

    2026年1月27日 30 156 77

    数据集概述 本数据集围绕水生群体无脊椎动物繁殖策略的进化转变展开,包含基因序列比对文件、系统发育树拓扑结构文件、祖先特征估计脚本及繁殖策略编码数据。通过多模型分析不同基因分区的系统发育关系,为研究该类群繁殖策略的进化提供支撑,共含17份文件。 文件详解 基因比对文件 文件名称:All_genes_alignment.nex 文件格式:NEX...
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  • nrpb2_替代分子标记环境真菌群落分析数据

    2026年2月1日 30 100 30

    数据集概述 本数据集围绕rpb2基因作为环境真菌群落分析替代分子标记展开,对比其与ITS标记在云杉林表层土壤真菌群落分析中的适用性。包含模拟群落数据、OTU表及系统发育树数据,支持评估rpb2基因在分类覆盖、定量准确性和系统发育分析中的优势,共6个文件。 文件详解 模拟群落序列文件 文件名称:MOCK_ITS.fas、MOCK_rpb2.fas...
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  • Cichlid_丽鱼起源化石与分子证据研究数据

    2026年2月1日 30 124 103

    数据集概述 本数据集围绕丽鱼起源时间展开研究,提供了古生物学和分子钟分析的相关数据。通过整合化石证据与10个核基因的DNA序列数据集,对丽鱼冠群起源时间进行估算,结果支持其起源于古新世(约65-57百万年前),晚于冈瓦纳大陆分裂时间,为丽鱼生物地理学研究提供了修订的宏观进化时间尺度。 文件详解 数据文件 文件名称:cichlidCONCAT.nex...
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  • Lemmus_Based_挪威旅鼠古DNA进化历史研究数据

    2026年1月30日 30 140 59

    数据集概述 本数据集为研究挪威旅鼠(Lemmus lemmus)起源的古DNA分析数据,包含17个文件,涵盖BEAST输入文件、MrBayes输入文件、进化树注释结果、序列比对数据集等,用于探究该物种在晚更新世至全新世的进化历史及冰期避难所生存证据。 文件详解 BEAST分析文件...
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  • Dataset_manuscript_生物基因数据集手稿数据

    2026年1月29日 30 99 37

    数据集概述 本数据集包含生物基因相关的手稿数据,涵盖基因序列比对、系统发育树及原始数据等内容。共8个文件,涉及FASTA、TRE、XLSX、GENEIOUS四种格式,主要用于生物信息学领域的基因数据处理与分析。 文件详解...
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  • Helianthus_Based_二倍体向日葵属系统发育研究数据

    2026年1月28日 30 123 117

    数据集概述 本数据集包含二倍体向日葵属(Helianthus)物种树估计的相关数据,基于37个物种/亚种的103个样本,通过目标富集技术获取170个基因进行系统发育分析。数据涵盖合并与联合分析结果,支持向日葵属三大分支(一年生分支、两个多年生分支)的划分,为研究该属进化、生态过程及形态特征演变提供基础。 文件详解...
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  • Anthophila_Based_蜜蜂花部振动行为进化研究数据集

    2026年1月27日 0 133 12

    数据集概述 本数据集为蜜蜂花部振动行为进化研究相关数据,包含系统发育树、BAMM分析文件、BEAST配置文件及说明文档等5个文件。研究通过构建时间校准的系统发育树,重建花部振动行为的祖先状态,分析该行为对蜜蜂物种多样化的影响,为理解蜜蜂与被子植物协同进化提供框架。 文件详解 说明文档类(TXT格式)...
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  • 鳞目动物系统发育学研究_基于分子分支长度与分子近缘性状的数据分析

    2026年1月27日 30 125 63

    数据集概述 本数据集围绕有鳞目系统发育学研究展开,针对McMahan等人2015年提出的观点进行回应,探讨分子数据对有鳞目系统发育拓扑结构的支持情况,涉及分子分支长度、分子近裔性状等核心内容,包含4个相关文件。 文件详解 File_S2_PBW_trees_and_output.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:包含PBW相关的树文件及输出数据...
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  • Lissamphibia_Based化石终端分类群分歧时间估算数据

    2026年1月27日 30 146 34

    数据集概述 本数据集围绕Lissamphibia起源展开,采用化石作为终端分类群,结合分子与形态数据,通过贝叶斯方法估算分歧时间。包含系统发育分析所需的形态、分子数据文件及分析结果文件,共10个文件,用于探究Lissamphibia的单系性、演化位置及起源时间。 文件详解 .tre格式文件(共5个)...
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  • Sarracenia_Based_北美食肉植物属系统发育关系研究数据

    2026年1月23日 30 170 107

    数据集概述 本数据集为研究北美食肉植物Sarracenia属系统发育关系的目标捕获法分析结果,包含75个样本的199个核基因序列及叶绿体基因组序列,用于解析该年轻分支(<300万年)的进化关系、生物地理起源及基因树异质性,共8个文件。 文件详解 基因树文件...
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  • MacArthur_Based莺类生态位分化重新评估数据_进化框架分析

    2026年1月22日 30 75 37

    数据集概述 本数据集包含重新评估MacArthur莺类生态位分化的相关数据与代码,涉及莺类形态测量、觅食行为及粪便宏条形码饮食分析,结合系统发育框架研究物种竞争与生态位分化机制,共32个文件,涵盖原始数据、处理脚本及分析结果。 文件详解 数据文件...
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  • Cape_Flora_Based开普植物区系栖息地转变与辐射演化研究数据

    2026年1月21日 30 117 20

    数据集概述 本数据集围绕南非开普植物区系(CFR)的物种多样性展开,聚焦Restionaceae科植物的宏观演化动态。包含该科近完整物种水平的时间校准系统发育树及多样化模型拟合结果,用于分析栖息地转变与物种辐射的关系,揭示开普植物区系超多样性的潜在机制。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式)...
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  • turtle_phylogeny_全球龟类系统发育与气候关联多样化研究数据

    2026年1月21日 30 162 149

    数据集概述 本数据集支持全球龟类系统发育研究,包含80%龟类物种(591个体)的分子数据及分析结果,聚焦始新世-渐新世过渡期大陆边缘气候关联的多样化爆发。数据集含系统发育树、分歧时间分析文件、生物地理学模型代码等12个文件,用于验证气候与生物地理对龟类多样性的影响。 文件详解 系统发育树文件(.tre/.tree)...
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  • Gliridae_Based_南欧早渐新世睡鼠系统发育与多样性研究补充数据

    2026年1月21日 30 72 2

    数据集概述 本数据集是论文《南欧早渐新世睡鼠(啮齿目,睡鼠科)新数据:科的系统发育与多样性》的补充材料,包含5份附录文件,涵盖形态特征、牙齿测量数据、系统发育矩阵、系统发育结果及原始多样性数据,为研究睡鼠科的演化关系与多样性提供支持。 文件详解 Appendix 1.docx:DOCX格式,含系统发育分析选用的形态特征及特征状态 Appendix...
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  • Drosophila_Subgenus_Based_地理生态多样化系统发育模式数据

    2026年1月18日 30 69 31

    数据集概述 本数据集为果蝇亚属地理与生态多样化系统发育模式研究的相关数据,包含218个果蝇亚属主要物种群的系统发育树、校准文件、分析结果及图表文件,用于验证分类辐射是否对应进化辐射,探究地理扩散与生态资源转移对物种多样化速率的影响。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Myristicaceae_Based_印度西高止山脉肉豆蔻科水淹生境适应与演化数据

    2026年1月18日 30 77 55

    数据集概述 本数据集为研究印度西高止山脉生物多样性热点区域肉豆蔻科树木水淹生境适应、生态位分化及演化提供支持,包含系统发育分析、DNA序列、演化模型等相关数据,可复现论文中所有分析、图表及表格结果,共23个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Hebeloma_dipterocarpohilum_Based_新种描述与系统发育分析数据

    2026年1月17日 30 71 45

    数据集概述 本数据集为描述和鉴定泰国北部新发现真菌物种Hebeloma dipterocarpohilum sp. nov.的支持数据,包含微观特征绘图、担孢子扫描电镜照片、子实体图片及基于ITS和MCM7基因的系统发育分析结果,用于区分其与相似可食用物种H. parvisporum,共含七个文件。 文件详解 微观特征数据文件(.xls格式)...
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