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Myzostomid_Transcriptome_Based_基因家族系统发育分析数据
数据集概述 本数据集为Myzostomid转录组基因家族系统发育分析数据，基于Illumina转录组序列与29种参考后生动物蛋白序列聚类的基因家族构建，包含989个序列家族联配的超级联配数据集及1878个基因树，用于探究Myzostomida在动物生命树中的系统发育位置，支持最大似然法和基因树简约法分析。 文件详解 文件名称：geneTrees.zip...
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Neodiprion_lecontei_Based松食叶蜂环境响应基因家族进化研究数据集
数据集概述 本数据集为松食叶蜂（Neodiprion lecontei）环境响应基因家族进化研究的配套数据，包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格，覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族，支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。 文件详解 说明文档 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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Dryad_Based_鸟类MHC_IIB基因家族PCR分离方法与经验数据_Archive
数据集概述 本数据集来自关于鸟类主要组织相容性复合体（MHC）IIB类基因家族的PCR分离研究，包含研究中开发的新引物序列及跨鸟类系统发育的基因分离经验，旨在解决多基因家族PCR分离中成员覆盖不全的问题，为相关基因家族的分离提供方法参考。 文件详解 文件名称：dryad.zip 文件格式：ZIP...
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Orchidaceae_Phylogenetic_转录组挖掘315个单拷贝直系同源基因串联数据
数据集概述 本数据集为兰科植物系统发育分析提供转录组挖掘的315个单拷贝直系同源基因串联数据。选取覆盖兰科5个亚科的10个代表物种，提取其转录组中的单拷贝直系同源基因用于构建系统发育树，解决传统方法在退化质体基因组物种定位上的难题，为兰科植物系统发育研究提供高效可靠的基因资源。 文件详解 文档文件...
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Procambarus_clarkii_Based克氏原螯虾光感知相关核苷酸序列研究数据2021
数据集概述 本数据集包含克氏原螯虾（Procambarus clarkii）腹神经索的62条转录本核苷酸序列，通过生物信息学工具识别与视网膜外光感受器光相互作用相关的基因家族，涉及眼和眼外光感知的生物合成途径及光转导级联相关基因。数据已存入GenBank数据库，包含2个补充文件。 文件详解 文件名称：Calderón-...
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RSOS_Grayson_2015_Based_Izumo1和Juno蛋白进化起源与共进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物精子-卵子结合必需蛋白Izumo1及其受体Juno展开，包含二者进化起源、正选择驱动下的快速进化特征、哺乳动物内共进化关系，以及Izumo基因家族跨物种分布与Juno物种特异性等研究相关数据，支持生殖蛋白质进化机制分析。 文件详解 文件名称：RSOS_Grayson_2015.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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Resurrecting_Ancient_Antibiotics_现代脂肽类抗生素起源研究支持数据
数据集概述 本数据集为论文“Resurrecting Ancient Antibiotics: Unveiling the Origins of Modern Lipid II Targeting Glycopeptides”的支持数据，包含49个文件，涉及系统发育树、序列比对、进化重建概率等内容，用于揭示现代脂肽类抗生素的进化起源与机制。 文件详解...
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ABC_Transporter_Genome_wide_Analysis_七鳃鳗基因家族进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕七鳃鳗（海七鳃鳗和日本七鳃鳗）的ABC转运蛋白基因家族展开全基因组分析，识别出37个ABC转运蛋白基因并分为7个亚家族，探讨其在脊椎动物中的早期进化事件，包括基因的扩张、收缩及保守性特征，为理解脊椎动物基因家族进化提供关键信息。 文件详解 文件名称：Phytree-original-data.zip 文件格式：ZIP...
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Arabidopsis_Response_Non_Redundancy_拟南芥根系环境响应基因表达数据
数据集概述 本数据集聚焦拟南芥根系结构对环境的响应机制，通过追踪氮处理和生物互作两种环境下根系发育的转录组动态，揭示基因表达的时空特异性及“响应非冗余性”机制。数据包含23个文件，涵盖基因网络、转录模块及家族基因调控等相关信息，为解析根系可塑性的分子基础提供支持。 文件详解 .cys格式文件（共14个） 文件名称：如Supplemental File...
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Dryad数据库中Chang_Larracuente基因组研究的黑腹果蝇Y染色体异染色质富集组装数据集_2018
数据集概述 本数据集基于异染色质富集组装策略，揭示黑腹果蝇Y染色体的序列与组织架构。数据补充了果蝇参考基因组的11.9 Mb序列，填补约百分之四十三点八的缺口，包含Y染色体重复序列、基因组织及进化相关信息，涉及crystal-Stellate基因家族的演化史与基因转换分析，共含2个文件。 文件详解 文档文件...
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五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集
数据集概述 本数据集提供五桠果（Dillenia turbinata）的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目，是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对，BUSCO完整性达97%，包含36,967个蛋白编码基因模型，为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md，格式:...
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MRSA菌血症复发基因组研究数据集
数据集概述 本数据集是预印本《MRSA菌血症复发基因组研究揭示多样基因组特征与菌血症相关基因的趋同性》的关联数据，包含临床元数据、基因序列、变异位点、统计分析结果及Rmarkdown代码文件，支持复现研究结果，为MRSA菌血症复发的基因组机制研究提供完整数据支持。 文件详解 临床与实验数据文件：...
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蜜蜂肠道微生物组宏基因组分析结果数据集_PRJNA977416
数据集概述 本数据集包含对PRJNA977416项目原始数据进行宏基因组Galaxy工作流分析的输出结果，涵盖分类学注释、功能信息及相关元数据与分析工作流文件，为蜜蜂肠道微生物组研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含12个文件，具体说明如下： - 元数据文件： -...
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ABA_Subnetwork_Based_陆生植物胁迫响应子网络完整分析数据
数据集概述 该数据集是关于核心陆生植物胁迫响应子网络藻类起源研究的ABA子网络补充文件，包含.tsv格式的节点数据文件和.pdf格式的文档文件，为相关研究提供数据支持。 文件详解 数据文件（.tsv格式，共2个）：...
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oggmap_orthomap_Based_基因直系同源分析示例完整数据
数据集概述 本数据集是Python包oggmap/orthomap的示例数据，包含基于不同数据库版本（Ensembl、WormBase等）的OrthoFinder分析结果、物种列表、分类树及预计算的直系同源映射等文件，为基因直系同源分析提供示例数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件，具体说明如下： -...
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江户明樱蛤染色体水平基因组组装数据集
数据集概述 本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据，包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息，旨在揭示其血红素生物合成的分子基础，为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。 文件详解 该数据集包含多个文件，具体说明如下： - 文档与说明文件： - readme.txt：文本格式，提供数据集标题、作者信息等基础说明 -...
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旧世界与新世界竹节虫系统发育基因组学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕竹节虫目（Phasmatodea）的系统发育基因组学研究展开，通过分析61个物种（含38个竹节虫主要类群及23个外群类群）的转录组数据，识别出平均2274个直系同源基因，旨在解决竹节虫目高级别系统发育关系的核心问题，为理解其进化历史、生物地理分布提供数据支持。 文件详解 说明文档:...
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植物糖基转移酶快速筛选研究表格数据集
数据集概述 该数据集为植物糖基转移酶快速筛选研究的配套表格数据，核心内容是从白及（A. roxburghii）转录组测序结果中鉴定出的假定UDP糖基转移酶的基因ID与蛋白名称对应信息，为相关酶的功能研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: Gene ID: 基因编号（如Unigene...
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生物活性肽在白蛋白前体中的进化起源研究数据集
数据集概述 本数据集围绕普通向日葵（Helianthus annuus）PawS1基因的进化展开，探究其如何从简单白蛋白前体逐步获得编码SFTI-1（一种具有蛋白酶抑制功能的环肽）的能力，为理解蛋白质从头进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：tpc123620_README.pdf 文件格式：PDF...
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六个豆科植物基因组中碱性亮氨酸拉链转录因子基因家族全基因组分析数据集
数据集概述 该数据集围绕六个豆科植物（大豆、蒺藜苜蓿、菜豆、鹰嘴豆、木豆、百脉根）的碱性亮氨酸拉链（bZIP）转录因子基因家族展开全基因组分析，包含基因鉴定、系统发育分类、结构特征、表达模式及胁迫响应等核心数据，为研究豆科bZIP家族的分子功能与进化提供支持。 文件详解 文件名称: Phylogenetic tree of all bZIP...
