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Danio_rerio_Based_大小选择性捕捞进化遗留效应研究数据
数据集概述 本数据集来自大小选择性捕捞进化遗留效应研究，记录了野生斑马鱼经五代大小选择性捕捞后的实验数据，包含表型变化（繁殖、生长、行为）及遗传变化（功能位点SNP），用于验证捕捞诱导的快速进化效应及其种群水平影响。 文件详解 SNP数据.xlsx 文件格式：XLSX...
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Dryad_Horornis_斐济灌木莺基因流与岛屿生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集为论文配套的数据，基于斐济灌木莺（Horornis ruficapilla）的基因组数据，研究岛屿大小和距离对基因流的影响，验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件，支持相关假设检验与后续研究。 文件详解 文档文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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F1000Research_Based_基于SNP的健康决策合成数据集
数据集概述 本数据集是用于研究“利用合成数据集弥合基于常见单核苷酸多态性（SNP）的健康相关决策在预期与现实间差距”的合成数据资源，包含一个Excel文件，为相关研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称：F1000R Data.xlsx 文件格式：XLSX...
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Quercus_Spp_Based_瑞士橡树种群气候适应性候选基因数据
数据集概述 本数据集基于瑞士三种常见橡树（Quercus petraea、Q. pubescens、Q....
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Pasteuria_Daphnia_Based宿主基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集用于研究寄生虫驱动宿主基因组进化的分子机制，聚焦浮游甲壳动物大型溞（Daphnia magna）与细菌病原体Pasteuria ramosa的互作系统。包含97个欧洲来源Daphnia magna基因型的全基因组多态性数据，通过关联分析识别抗P. ramosa的基因组区域，并检测正选择信号。数据集共3个文件，支持宿主-...
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Cyprinodon_Based_鳉鱼适应性辐射生态物种形成研究数据
数据集概述 本数据集聚焦巴哈马圣萨尔瓦多岛湖泊中鳉鱼适应性辐射过程中的生态物种形成，通过基因测序分析新生物种间的遗传分化模式。涵盖13,912个单核苷酸多态性位点数据，对比了刮鳞者、硬壳猎物 specialist（durophage）与广食性物种的遗传差异，探究不同营养生态位对物种形成进程的影响。 文件详解 压缩文件（Archive files）...
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HLA_Based_人类白细胞抗原区域单倍型多效性疾病关联研究补充数据
数据集概述 本数据集为HLA区域单倍型分析相关研究的补充表格，包含FinnGen数据库中2459种疾病的关联分析信息，涉及疾病分类、GWAS富集分析、SNP与单倍型关联结果、UK Biobank验证数据等核心内容，支持HLA区域多效性疾病关联的深入研究。 文件详解 补充表格文件（共8个核心表格） 文件名称：Supplementary Table...
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ME_Publication_SNP群体分化互信息预测数据110519
数据集概述 本数据集为ME出版物相关的单核苷酸多态性（SNP）群体分化预测数据，基于Wright-Fisher模型推导双群体单倍体双等位基因位点的互信息（I）理论预测，包含动态及稳态预测结果，可用于分析群体间遗传分化与扩散关系。 文件详解 文件名称：SNP data for ME publication 110519.xlsx 文件格式：XLSX...
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Undaria_pinnatifida_Based_群体基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为引入栽培太平洋海带Undaria pinnatifida的群体基因组学研究数据，包含码头、养殖场及自然岩礁三种栖息地种群的遗传信息。通过RAD-seq和微卫星两种方法分析，探究栖息地对种群遗传多样性、连通性及野外定殖的影响，共含2个文件。 文件详解 Guzinski-et-al-Undaria-RADseqVCF file.vcf...
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PDE12_Based_糖尿病患者与对照组PDE12表达及SNP分析数据
数据集概述 本数据集分析了非糖尿病供体、新诊断（中位病程35天）及近期诊断（5年）1型糖尿病（T1D）患者、2型糖尿病（T2D）患者胰岛中的PDE12表达水平，同时研究了PDE12单核苷酸多态性（SNPs）与T1D发病率的关系。数据包含2个文件，可用于探究PDE12表达与糖尿病的关联及COVID-19感染后T1D发病率升高的潜在机制。 文件详解...
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PBCV_1_变形小球藻_病毒协同进化实验后寄生虫多样性分析数据2024
数据集概述 本数据集为论文“High parasite diversity maintained after an alga-virus coevolutionary arms race”的配套数据与分析文件，包含小球藻（Chlorella...
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Hucho_taimen_Based_哲罗鲑转录组从头组装与特征分析数据
数据集概述 本数据集为哲罗鲑（Hucho taimen）的转录组从头组装与特征分析结果，包含转录组序列、功能注释、基因家族分析、正选择基因鉴定及微卫星标记等数据，共11个压缩文件，可用于研究该濒危物种的保护遗传学、系统发育及进化机制。 文件详解 文件名称：Index_and_primers_for_genotype.zip 文件格式：ZIP...
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Mimulus_guttatus_Based自然种群基因组结构变异研究数据
数据集概述 本数据集包含植物物种Mimulus guttatus（猴面花）单一自然种群的基因组结构变异数据，核心为1千碱基到200千碱基长度的插入缺失变异（indel）。经筛选得到4142个高置信度indel，验证率达73%，涉及近600个基因，其中NBS-LRR防御响应基因富集。数据可用于研究结构变异的等位基因频率谱、基因影响及选择作用。 文件详解...
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Shepherds_Tale_Based犬类果糖胺血清浓度基因关联研究数据
数据集概述 本数据集为犬类果糖胺血清浓度基因研究数据，包含9个犬种的基因型和表型信息，重点分析比利时牧羊犬中影响果糖胺血清浓度的遗传位点。数据源于全基因组关联研究，揭示了比利时牧羊犬CFA3染色体上的关联区域及特有低杂合度区域，涉及LETM1、GAPDH等葡萄糖代谢相关候选基因，可用于探究犬类糖尿病易感性的遗传机制。 文件详解 压缩包文件...
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Haplotype_Based_GWAS_小麦叶锈病抗性基因定位与预测数据
数据集概述 本数据集为小麦叶锈病抗性的单倍型全基因组关联分析（FH-GWAS）研究数据，包含133个亲本及1574个杂交后代的基因型与表型信息。通过对比SNP-GWAS与FH-GWAS方法，检测到25个和69个候选关联区域，FH-GWAS可提升抗性预测准确性至22.86%，数据集含3个文件，支持小麦叶锈病抗性育种的标记辅助选择研究。 文件详解...
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Dryad_Pedicularis_dudleyi种群遗传学与进化历史数据
数据集概述 本数据集包含加州红木林特有濒危植物Dudley's lousewort（Pedicularis dudleyi）的种群遗传学、种群动态及进化历史数据。通过ddRAD SNP和Sanger测序技术，分析其遗传多样性、种群结构、近期瓶颈效应及与近缘种P. rigginsiae的遗传分化，为濒危物种保护提供科学依据。数据集包含6个相关文件。...
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AtlanticSilversides_Based局部适应基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为大西洋银汉鱼基因组局部适应研究的配套数据，基于北美东海岸热梯度分布的样本低覆盖度全转录组测序结果，含近14,000个高分化单核苷酸多态性（SNPs）及样本位置信息，揭示局部适应相关的基因组变异模式，支持适应性进化机制分析。 文件详解...
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DRYAD_Based_Frangula_alnus环境选择基因组特征数据
数据集概述 本数据集围绕广泛分布的虫媒树种Frangula alnus subsp. alnus（鼠李科），筛选25个原生种群的183个注释单核苷酸多态性（SNPs），结合种群基因组离群分析、个体及多变量景观基因组方法，研究环境选择对基因组变异的影响及驱动选择的关键环境因子，为种群响应环境线索的能力提供基础见解。 文件详解...
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NGS_Based_目标多重测序技术数据_线粒体与核DNA群体基因组学分析
数据集概述 本数据集包含目标多重下一代测序技术的相关数据，用于非模式生物的群体基因组分析，支持同时对多重样本的线粒体和核基因座进行重测序。数据覆盖跨物种DNA捕获、线粒体基因组及核基因座的富集测序方法，涉及鲸类和绿海龟等物种的基因组数据，包含27个相关文件。 文件详解 文档文件（.txt）...
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SNP_Genotyping_基于双酶切RAD测序的基因分型错误率研究数据
数据集概述 本数据集围绕非模式生物SNP基因分型错误率展开，通过双酶切RAD测序技术，以霍夫曼二趾树懒母子对为研究对象，分析覆盖度与序列质量对参考比对及从头组装数据集基因分型错误率的影响，同时评估错误率对亲子关系鉴定的作用，为测序方案设计提供参考。 文件详解 README_for_SNP_datasets.txt 文件格式：TXT...
