找到604个数据集

标签: FASTA

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  • 花象鼻虫系统基因组学与繁殖地传粉共生起源数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 该数据集基于系统基因组学研究,分析花象鼻虫(Curculioninae亚科)的系统发育关系,揭示了真象鼻虫中繁殖地传粉共生关系的十次独立起源,为理解象鼻虫与植物的协同进化提供核心数据支持。 文件详解 核心图表文件(PDF格式): Figure 1 - Part...
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  • BIOCOM_PIPE_ZymoBIOMICS人工微生物群落数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集为ZymoBIOMICS提供的人工微生物群落数据,包含8种细菌和2种真菌菌株,涵盖易裂解革兰氏阴性菌、难裂解革兰氏阳性菌及难裂解酵母,提供16S/18S rRNA序列和基因组信息,用于微生物多样性研究。 文件详解 该数据集包含8个文件,具体说明如下: - FASTA格式序列文件(共7个): -...
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  • IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本文件、NGS测序文库质控报告及参考基因组文件,为该实验的转录组数据分析提供了完整的计算流程支持。 文件详解 分析脚本文件(.sh格式,共3个): 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh:用于构建STAR比对索引的脚本...
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  • 复杂基因组重复序列组装补充信息数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集为复杂基因组重复序列组装研究的补充信息,包含不同版本更新的结果文件、线粒体序列原始数据、基因组组装尝试文件、组装图及相关图表,支持2017年伦敦Calling会议相关海报与报告。 文件详解 该数据集包含多个版本更新的文件,具体说明如下: - 2021年5月25日更新文件(v2.1.1-mtReads): -...
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  • 加勒比礁鲨线粒体基因组数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 该数据集提供加勒比礁鲨(Carcharhinus perezi)的完整线粒体基因组序列及相关分析文件,包含基因序列、注释信息、测序比对结果和可视化图表,为该物种的遗传监测与保护研究提供基础数据。 文件详解 序列与比对文件: cperezi.fasta:FASTA格式,加勒比礁鲨线粒体基因组原始序列...
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  • 南极毛皮海豹中性与免疫位点杂合性与微生物感染新生儿死亡率关联数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕南极毛皮海豹(Arctocephalus gazella)幼崽展开,分析中性与免疫基因位点杂合性对细菌性感染致死率的影响。包含234只个体的基因分型数据、死亡率分类及统计分析结果,为研究杂合性与适合度相关性(HFCs)提供实证支持。 文件详解 数据文件:...
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  • 番茄Sl3_MMP基因与病原菌抗性关联数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 该数据集围绕番茄基质金属蛋白酶家族成员Sl3-MMP展开,包含其在灰霉病菌(Botrytis cinerea)和番茄细菌性斑点病菌(Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000)抗性中的功能研究相关数据,为植物抗病机制研究提供支撑。 文件详解 Tree.jpg:JPG格式图片文件,可能为番茄Sl-...
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  • 葱潜叶蝇基因型A与B的PCR_RFLP快速鉴别数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕葱潜叶蝇(Liriomyza chinensis)基因型A与B的快速鉴别展开,包含研究中使用的PCR-RFLP方法相关文件、实验结果图表、基因序列及样本信息,为验证该鉴别方法及葱潜叶蝇基因型分布研究提供支持。 文件详解 文档类文件: Takagi et al. main text.docx:Word格式,研究的主要文本内容...
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  • 绿藻属Caulerpa的tufA参考序列库数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集包含绿藻属Caulerpa的tufA基因参考序列库,涵盖八十九种Caulerpa物种和九种Pseudochlorodesmis物种的基因序列比对、系统发育树及分类单元详情,支持藻类分类与系统发育研究。 文件详解 基因序列比对文件:...
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  • 桃蚜_Myzus_persicae_唾液蛋白质组数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集包含桃蚜(Myzus persicae)唾液蛋白质组的高质量数据,通过纳米液相色谱-串联质谱(nanoLC-MS/MS)分析结合更新的基因组注释生成。数据来自约一万头桃蚜的唾液样本,涵盖肽段鉴定、蛋白质分组及基因模型关联等信息,为研究植物-昆虫互作分子机制提供支持。 文件详解 核心数据文件:...
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  • 台湾猫蛛属物种界定与分类修订数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集围绕台湾猫蛛属(Oxyopes)的分类修订与物种界定展开,整合形态学与分子特征分析结果。共识别出七种猫蛛,包含两个新种,首次记录两种台湾分布种,提供了物种鉴定检索表、分布图及COI基因序列数据,为该属物种分类与系统发育研究提供支持。 文件详解 文件名称: oxyopesCOIalign.fasta 文件格式: FASTA...
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  • Portullugo分支_石竹目_光合作用基因系统发育与分子进化数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 该数据集围绕Portullugo分支(石竹目)的光合作用基因展开,包含系统发育重建与分子进化分析相关数据,涉及多基因家族的靶向富集方法应用,为研究C4和CAM光合作用起源的适应性氨基酸替换提供支持。 文件详解 文档类文件: suppl_methods_2018_08_19.pdf:PDF格式,补充方法说明文档...
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  • 果蝇必需孤儿基因同源物功能与亚细胞定位能力差异数据集2025

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集为Patel等人2025年关于果蝇必需孤儿基因同源物的研究补充数据,包含基因序列、比对结果及相关压缩文件,支持研究同源物在功能与亚细胞定位能力上的差异。 文件详解 压缩文件(archive_files): orthologs.zip:压缩格式,内容未预览,推测包含同源物相关数据...
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  • ATG16L1缺陷小鼠巨噬细胞磷酸化蛋白质组与总蛋白质组FragPipe_v22_0分析输出数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集包含ATG16L1缺陷及野生型小鼠巨噬细胞感染福氏志贺氏菌后的磷酸化蛋白质组与总蛋白质组FragPipe v22.0分析输出,支持下游差异表达及翻译后修饰分析。 文件详解 主文件: PTM_experiment_FP_22_Maculins_and_QC.zip,ZIP格式,包含以下目录内容:...
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  • 双侧对称动物sNPF型神经肽信号起源与进化数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集围绕双侧对称动物(Urbilateria)中sNPF型神经肽信号系统的起源与进化展开,包含用于系统发育分析的原始序列、修剪序列及系统发育树文件,支持研究神经肽信号系统的演化历史及跨物种比较。 文件详解...
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  • 共生绿藻属系统转录组关系研究的组装与比对数据集2024

    2025年12月10日   

    数据集概述 该数据集为研究共生绿藻属(Oophila)与两栖动物卵团相关的系统转录组关系提供数据支持,包含基因组组装、序列比对、进化树文件及补充图表,覆盖绿藻物种的转录组序列与系统发育分析材料。 文件详解 压缩文件: Oophila_treefiles_logfiles_August2024.zip:...
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  • 果蝇螺旋体共生体快速分子进化研究数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集包含支持“果蝇螺旋体共生体快速分子进化”研究的相关数据文件,包括序列、比对结果、分析方案及实验协议等,可用于复现论文中的研究发现。 文件详解 OTU_sequences.fasta:FASTA格式文件,包含所有经PfamScan预测含OTU结构域的螺旋体序列...
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  • PTP酶qFit多构象模型RINFAIRE网络分析补充材料

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集为论文《从晶体学多构象模型集合绘制相关蛋白质结构中的变构重连》的补充材料,包含PTP酶qFit多构象模型的RINFAIRE网络分析相关文件,支持复现研究中的数据分析过程。 文件详解 README.md:Markdown格式说明文档,介绍数据集背景、关联论文及使用指引...
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  • 俄罗斯欧洲部分东南部毛茛科翠雀属分类修订数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集围绕俄罗斯欧洲部分东南部10种翠雀属植物的分类修订展开,包含形态学(22个定量、32个定性参数)及系统发育(nrITS条形码)分析数据,支持物种分类地位澄清与鉴定关键开发。 文件详解 形态学数据文件:...
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  • 斑点鱥入侵种群遗传多样性与瓶颈效应研究数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集围绕斑点鱥入侵种群的遗传多样性与瓶颈效应展开,通过分析微卫星位点和线粒体DNA基因的变异,识别入侵种群的来源并评估瓶颈效应,为探究遗传多样性对入侵成功的限制作用提供数据支持。 文件详解 README_for_mtDNA.pdf:PDF格式,线粒体DNA数据说明文档...
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