-
TDWG_2023_Species_Occurrence_Test_Set_生物多样性信息任务评估数据
数据集概述 本数据集是论文《Using ChatGPT with Confidence for Biodiversity-Related Information Tasks》（TDWG 2023...
-
Francisella_tularensis_Based_临床样本全基因组捕获测序数据_原始与组装数据
数据集概述 本数据集包含土拉弗朗西斯菌的RNA寡核苷酸诱饵设计文件及17个样本的基因组组装数据。诱饵设计针对该菌染色体和质粒，排除人类同源序列；组装数据含17个样本的基因组序列及组装统计元数据，支持从临床样本直接进行全基因组捕获测序的验证与应用研究。 文件详解 Francisella_tularensis_RNA_baits_INSA_PT.tsv...
-
HamiltonRuleMicrobiome_GitRepos_肠道微生物群合作进化研究数据集2020
数据集概述 本数据集为论文“Kin selection explains the evolution of cooperation in the gut microbiota”的配套数据，包含研究所需的原始及处理后材料、统计分析与图表生成代码，以及人类微生物组计划（HMP）粪便样本的测序数据清单，支持研究结果的复现与延伸分析。 文件详解 数据文件...
-
Cavia_aperea_Paternal_Heat_Exposure_野生豚鼠表观遗传跨代响应研究数据
数据集概述 本数据集围绕野生豚鼠（Cavia aperea）父代热暴露的表观遗传跨代响应展开，记录了5只成年雄性豚鼠（F0）经2个月热暴露后，F0代肝脏及F1代肝脏、睾丸组织的DNA甲基化差异，通过简化甲基化测序揭示了可跨代传递的差异甲基化区域及相关基因信息。 文件详解 F1L_coverage_MethLevels.zip 文件格式：ZIP...
-
MESINESP2_Shared_task_Based_生物医学语义索引标注记录与银标准数据集_2020
数据集概述 本数据集为MESINESP2研讨会后发布的补充数据，包含人工标注记录和银标准数据集两部分。人工标注记录涵盖竞赛评估数据集的验证与未验证标注信息；银标准数据集基于6支团队24次系统运行结果构建，含超580万数据点，可用于丰富生物医学语义索引任务的训练数据。 文件详解 all_annotations_withIDsv3.tsv 文件格式：TSV...
-
Paratransgenesis_iGEM_USP_Brazil_2017_候选共生转基因底盘生物数据集
数据集概述 本数据集为2017年iGEM USP-Brazil团队筛选的共生转基因候选底盘生物信息，包含候选生物的物种、参考文献DOI、与宿主的生态关系、宿主节肢动物种类、靶向疾病、基因工程适用性等核心属性，支持合成生物学中底盘生物的筛选与评估。 文件详解 原始数据文件（original.tsv） 文件名称：Paratransgenesis -...
-
Chaperone_Dependency_Based_大肠杆菌分子伴侣依赖性蛋白质折叠研究数据_2024
数据集概述 本数据集聚焦大肠杆菌蛋白质折叠过程中分子伴侣的作用，通过有限蛋白水解质谱（LiP-MS）分析，比较了体内初级生物发生与体外复性时蛋白质对分子伴侣的依赖性差异，探讨了触发因子和DnaKJ缺失对蛋白质结构的影响，揭示了部分蛋白质的共翻译折叠特性。 文件详解 蛋白结构变化分析文件（TSV格式）...
-
Dryad_Based_superasterid基因组深度学习NLR注释数据集v250214_91366
数据集概述 本数据集通过深度学习工具Helixer对230个高质量superasterid基因组进行标准化从头注释，结合NLRtracker识别出91,366个NLRs及相关序列。数据按APG IV系统发育目分类存储，包含基因组组装、注释文件、NLR序列及补充元数据，支持superasterid植物NLR免疫受体的比较基因组学与进化研究。 文件详解...
-
BTA_Chiroptera_Taxonomic_Alignment_蝙蝠分类学名称多权威比对数据_v5
数据集概述 本数据集为蝙蝠分类学对齐（BTA）工具的配套数据，整合10个权威分类机构的信息，涵盖1480余种蝙蝠的有效名称、异名、亚种及历史组合关系，共1680项分类处理记录。数据旨在解决蝙蝠分类修订导致的命名差异，支持分类名称追溯与比对，服务生物多样性研究与保护。 文件详解 数据文件（共3个） 文件名称：BTA_v5 (5).xlsx...
-
GloBI_Based_西西伯利亚泥炭地Andromeda_polifolia真菌寄生与腐生关系索引数据
数据集概述 本数据集收录西西伯利亚隆起泥炭地中，沼泽迷迭香（Andromeda polifolia）相关真菌寄生生物与腐生生物的互作数据，通过Global Biotic Interactions（GloBI）平台索引，包含真菌群落组成、互作关系及生境关联信息，共3个文件，可用于泥炭地生态系统真菌-植物互作及碳循环研究。 文件详解 README.md...
-
RootWayS_Based_德国三种土壤干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落qPCR定量数据_2023
数据集概述 本数据集为德国三种土壤中，干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落的qPCR定量数据。通过SYBR® Green法qPCR检测16S rRNA基因拷贝数，使用大肠杆菌V3区域扩增子作标准品，样本设三次重复，记录反应条件及效率，包含元数据、原始数据及分析文件共27份。 文件详解 元数据文件...
-
abxbug_GitLab_Based_抗生素对肠道细菌_collateral_damage_研究完整数据
数据集概述 本数据集包含论文“Unravelling the collateral damage of antibiotics on gut bacteria”所需的全部实验数据，支持复现论文中的分析结果。数据涉及抗生素对肠道细菌影响的实验结果、化合物信息、MIC值等，涵盖原始实验数据和处理后数据，共四十七个文件，覆盖多种格式。 文件详解...
-
GRAND_SLAM_Source_QuantSeq核苷酸转换模拟分析与grandRescue效果评估数据
数据集概述 本数据集为QuantSeq测序数据中核苷酸转换（T>C）模拟的处理结果，用于研究4sU诱导的映射损伤（受读长和文库制备方法影响）及grandRescue工具的缓解效果。包含处理前后的完整输出文件、GRAND-SLAM结果表等，共6个文件，支持基因测序映射损伤机制与修复工具的分析。 文件详解 核心数据文件（.tsv格式）...
-
Saccharomyces_cerevisiae_Based_酿酒酵母驯化轨迹与面包制作过程关联研究支持数据
数据集概述 本数据集为Bigey等2020年发表的酿酒酵母驯化轨迹与面包制作过程关联研究的支持数据，包含实验数据与分析代码共21个文件，涉及酿酒酵母菌株的表型、基因型、发酵实验等信息，用于验证酿酒酵母两种主要驯化轨迹的研究结论。 文件详解 数据文件 表格类文件（.xlsx/.xls/.csv/.tsv/.raw） 示例文件：2018-10-17...
-
terranigra_dataset_Based_Fictibacillus_terranigra分析数据集
数据集概述 本数据集包含Fictibacillus terranigra的分析数据，共13个文件，涵盖基因注释、功能预测、代谢分析等内容，涉及blastKOALA、Prokka注释、microtrait筛选、dbcan3分析、DRAM及METABOLIC结果等多种类型文件，可用于研究该菌株的基因功能与代谢特征。 文件详解 基因功能注释文件...
-
Rickettsia_heilongjiangensis_Based立克次体感染小鼠胃部靶向研究分析代码数据
数据集概述 本数据集包含论文《Stomach as the target organ of Rickettsia heilongjiangensis infected C57BL/6 mice identified by click...
-
Pseudomonas_syringae_Supplementary_Data_PSSC基因组与毒力研究数据
数据集概述 本数据集为Pseudomonas syringae竞争与毒力研究的补充数据，包含2161个PSSC基因组的元数据、PCR引物评估结果、系统发育树、毒力因子HMM模型、基因检测结果、分类器及尾纤维结构预测等35个文件，支持相关章节的基因组分析、引物验证及毒力机制研究。 文件详解 基因组与元数据文件 文件名称：supplementary...
-
Supplementary_material_5_Based_古东斯拉夫与现代斯拉夫语言距离测量实验结果数据
数据集概述 本数据集是基于语料库的语言距离测量实验结果，涵盖古东斯拉夫、现代东斯拉夫及现代标准斯拉夫语言变体。包含240个实验文件夹及1个汇总CSV文件，实验参数涉及主题反建模启发式、 Sørensen-Dice系数归一化、混合度量策略等，现代标准斯拉夫数据集还按不同规模占比（0.1、0.3、0.6、1）重复实验。 文件详解 汇总文件...
-
Data_for_Limited_adaptive_responses_植物水力性状适应性响应数据集_2024
数据集概述 本数据集整合了223项关于植物水力性状对环境因子（气温、CO₂浓度、光照、土壤养分及水分）的表型可塑性与进化调整研究。数据显示植物在干旱条件下会提高栓塞抗性、增加叶面积比边材面积，但栓塞抗性提升不足以补偿最低水势下降，导致干旱时水力失效风险增加，为全球变化下植物响应预测提供支撑。 文件详解...
-
cartloader_Starter_Tutorial_SeqScope_空间转录组_PMTiles转换结果数据
数据集概述 本数据集为cartloader公开教程的结果数据，基于SeqScope小鼠海马体数据集生成。包含通过cartloader工具包分析、转换得到的空间转录组PMTiles文件及相关辅助文件，可支持下游分析、交互式网络可视化与跨平台数据共享，总计69个文件。 文件详解 PMTiles文件（57个） 文件格式：PMTiles...
