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Gila_Colorado_River_Basin_北美西部沙漠鱼类杂交基因侵蚀研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美西部科罗拉多河流域两种特有同域鱼类（Gila cypha和G. robusta）的杂交基因侵蚀展开研究，包含368个个体的ddRAD测序相关数据，用于分析人为栖息地改变对物种繁殖隔离、基因渐渗及生物多样性的影响。 文件详解 样本元数据文件 文件名称：gila_ub_sra_metadata.xlsx 文件格式：XLSX...
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Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据
数据集概述 本数据集为水生蝾螈（Necturus maculosus）种群结构与基因流的基因组评估数据，包含美国肯塔基州三个流域（肯塔基河、利金河、金尼科尼克河）的基因组分析相关文件，用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称：bpp.zip 文件格式：ZIP...
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Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集
数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据，包含10个不同类型的基因组相关文件，覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容，用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称：genome.fa 文件格式：FA...
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Genomic_signatures_Based_巴西东南海岸淡水鱼古水系遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集为巴西东南海岸淡水鱼（Hollandichthys multifasciatus）古水系基因组特征研究的相关文件，包含遗传数据文件、结构数据文件及分析代码文件，共4个文件。数据用于验证更新世海平面变化导致的古水系对鱼类种群遗传结构的影响，探索古水系面积和河流数量与遗传多样性的关联，揭示淡水鱼类遗传结构与古水系属性的关系。 文件详解...
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Molecular_Inversion_Probes_Based_非模式生物靶向重测序实验数据
数据集概述 本数据集包含非模式生物靶向重测序分子反转探针（MIPs）的设计与实验数据，涉及248个MIP标记在85个样本中的应用。数据覆盖探针设计、两轮实验的VCF结果、设计脚本及参考序列，可支持非模式生物基因组区域重测序的方法评估与多态性分析。 文件详解 文件名称：mips_design.xlsx 文件格式：XLSX...
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Salix_Populus_Based_Salicaceae系统发育组学研究补充数据_2023
数据集概述 本数据集为Salicaceae科中Salix（柳属）和Populus（杨属）及其近缘类群的系统发育组学研究补充材料，包含基于787个基因区域构建的系统发育树、基因序列捕获数据、杂交事件分析结果及多样化速率变化证据，用于揭示导致系统发育冲突的古老杂交模式与差异化多样化机制，共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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Capsella_bursa_pastoris_Based_欧亚多倍体植物基因组殖民化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦荠菜（Capsella bursa-pastoris）这一异源多倍体植物，通过基因分型测序获取261份欧亚大陆样本的4274个SNP位点，分析其基因组多样性、种群结构及殖民化历史，揭示其从中东向欧洲、东亚扩张的多阶段过程，为多倍体植物进化研究提供数据支持。 文件详解 README文件...
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Neutral_adaptive_Based_Coenagrion_scitulum极向扩张基因组特征研究数据
数据集概述 本数据集围绕豆娘Coenagrion scitulum快速极向扩张过程中的中性与适应性基因组特征展开，包含基因组SNP、表型、气候数据及单基因座和多基因座异常检测结果，旨在解析物种扩张中的遗传漂变与适应性进化机制，支持基因组学与进化生物学研究。 文件详解 基因组数据文件...
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Anthropocene_Population_Genomics_纽约都市圈白足鼠基因组变异数据集
数据集概述 本数据集记录纽约市都市圈23个白足鼠种群的基因组变异情况，通过ddRAD-Seq技术生成超10000个SNP标记，分析城市化梯度（不透水面覆盖率、人口密度）对种群基因组多样性、分化模式的影响，含基因组数据压缩包及样本文件共4个。 文件详解 文件名称：wfm191vcf.zip 文件格式：ZIP...
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Gasterosteus_aculeatus_Based_丹麦三刺鱼基因组分化选择基因流种群历史数据
数据集概述 本数据集为丹麦海洋与淡水环境下三刺鱼基因组分化研究数据，包含28,888个SNP位点分析结果，涉及2个海洋种群与7个淡水种群（河流、隔离湖泊等不同环境）。数据用于探究选择、基因流及种群历史（如瓶颈效应）对基因组分化的影响，揭示淡水种群形态与基因组分化模式，共含10个文件。 文件详解 基因型与种群结构文件...
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Eragrostis_tef_Based_埃塞俄比亚画眉草水分胁迫下生产力与形态生理性状基因组解析数据
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚画眉草（Eragrostis tef）在不同水分条件下的基因组与表型研究数据，包含297个基因型的28,837个SNP标记数据，以及2020-2021年两个生长季、两种水分处理（充足/有限）下的生产力、抗倒伏性及形态生理性状表型数据，用于解析目标性状的遗传基础。 文件详解 ReadMe for Zenodo.txt...
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Carpathian_Smooth_Newts_Divergence_History_Genetic_Data
数据集概述 本数据集围绕Carpathian蝾螈（Lissotriton montandoni）和smooth蝾螈（L. vulgaris）的分化历史展开，包含基因序列、种群遗传学数据等，用于研究物种间基因交换、种群动态及生殖隔离机制，支持进化生物学领域的分化模型验证与分析。 文件详解 压缩文件（.zip格式）...
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塞内加尔高粱地方品种适应萨赫勒与苏丹气候的基因组特征数据集
数据集概述 该数据集包含塞内加尔及邻近地区421份地理参考高粱地方品种的基因组数据，涉及213,916个单核苷酸多态性位点，用于研究其对萨赫勒半干旱气候与苏丹亚湿润气候的适应性基因组基础，识别了气候关联的选择信号及候选基因。 文件详解 文档文件: Faye-Supporting_Information_File_S1.pdf:...
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塞内加尔高粱地方品种适应萨赫勒与苏丹气候的基因组特征数据集
数据集概述 该数据集包含塞内加尔及邻近地区421份地理参考高粱地方品种的基因组数据，涉及213,916个单核苷酸多态性位点，用于研究其对萨赫勒半干旱气候与苏丹亚湿润气候的适应性基因组基础，识别了气候关联的选择信号及候选基因。 文件详解 文档文件: Faye-Supporting_Information_File_S1.pdf:...
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胡萝卜沿海亚种变异基因型测序数据集
数据集概述 本数据集聚焦胡萝卜属（Daucus）中沿海"gummifer"形态型亚种的遗传变异，通过基因型测序（GBS）分析288份样本，涵盖地中海、大西洋沿岸及巴利阿里群岛等区域，识别出29041个过滤后的单核苷酸多态性（SNPs），为该类群的分类与系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含4个文件，具体说明如下： - 图表文件: -...
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野生黑腹果蝇先天免疫季节性快速进化数据集
数据集概述 本数据集记录北美东部不同纬度地区野生黑腹果蝇在季节变化中的先天免疫进化特征，包含自然种群和重组种群对特定细菌感染的存活与细菌载量数据，以及相关基因变异信息，揭示免疫防御快速循环进化的遗传机制。 文件详解 文档文件： Metadata.pdf：PDF格式，可能包含数据集的背景、实验设计、样本信息等元数据说明。 重组种群数据文件：...
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热带山地物种快速适应性分化基因组特征数据集
数据集概述 本数据集围绕巴布亚园丁鸟（Amblyornis papuensis）的适应性分化展开，包含基因组、种群遗传对比及补充材料等11个文件，辅助研究其东西部种群约1.18万年前因气候变暖隔离后的进化过程，揭示环境差异驱动的适应性分化机制。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： - 说明文档类： -...
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德克萨斯蓝花楹野生种群同质化研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦德克萨斯蓝花楹（Lupinus texensis）野生种群与人工播种种群的遗传同质化研究，通过基因分型测序获取11,741个全基因组单核苷酸多态性（SNPs）及叶绿体基因组SNPs，分析12对相邻野生与播种种群（共187个个体）的种群结构与遗传多样性，揭示人类活动对该物种遗传结构的影响。 文件详解 说明文档类（.txt格式）：...
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牛分枝杆菌感染牛外周血RNA测序数据变异分类数据集
数据集概述 本数据集包含牛分枝杆菌感染（bTB+）与未感染（bTB-）牛外周血样本的RNA测序变异数据，以VCF格式存储，用于差异表达分析，为牛结核病感染的精准分类研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: ML4TB_Zenodo_upload_RNA_calls.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 压缩包内包含用于bTB+与bTB-...
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西班牙普通菜豆多样性面板基因分型数据集
数据集概述 本数据集包含西班牙普通菜豆多样性面板中308个普通菜豆品系的基因分型数据，采用ApeKI限制性内切酶测序，经参考基因组V2.1比对及缺失值、最小等位基因频率过滤后，最终保留11,763个SNP标记。 文件详解 数据文件： 文件名称：alldata_filtered.vcf.vcf 文件格式：VCF...
