数据集 - 海数据

数据集概述本数据集是鲸偶蹄目哺乳动物水生过渡分子适应系统发育基因组学分析的相关数据，包含鲸类与河马等物种的转录组及基因组数据，构建了含23种哺乳动物的6845个编码DNA序列的系统发育基因组数据集，用于探究鲸类分子适应的发生时间与功能特征。文件详解文件名称：Tsagkogeorga_et_al_alignments.zip 文件格式：ZIP...

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Tringa_semipalmata_Genomic_鹬属半蹼鹬进化历史研究数据

数据集概述本数据集为鹬属半蹼鹬（Tringa semipalmata）的基因组研究数据，用于分析其两个亚种的进化历史与物种分类争议。包含线粒体DNA序列、核DNA超保守元件（UCEs）序列及相关遗传数据，支持亚种分化时间、基因流及选择压力的研究，共1个压缩文件。文件详解...

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East_Adriatic_Sheep_X染色体_选择信号识别_畜牧基因组研究数据

数据集概述本数据集记录东亚得里亚海绵羊X染色体的选择信号识别结果，包含8个克罗地亚本地绵羊品种（101只雌性、100只雄性）及10只摩弗伦羊的基因组数据，通过经典方法与新方法HRiD识别出14个选择信号及34个注释基因，为研究绵羊X染色体适应性基因提供支持。文件详解 README_Overall.txt 文件格式：TXT...

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Mimulus_Selfish_Based细胞质核杂种不亲和性进化研究数据2016

数据集概述本数据集为Mimulus属植物细胞质核杂种不亲和性自私进化研究的基因组数据，聚焦Iron Mountain（IM）种群Mimulus guttatus与Mimulus nasutus杂交后代的雄性不育现象，验证Rf1/Rf2等位基因对线粒体不育基因的抑制机制及选择压力，支持种间杂种不亲和性进化的自私元件模型。文件详解...

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Labrador_Retriever_Based基因组数据_遗传结构与选择分析数据

数据集概述本数据集为英国拉布拉多寻回犬基因组研究相关数据，包含群体结构、近交程度及选择信号分析结果，涉及犬只用途（工作、宠物、展示）、毛色与遗传分化的关联，以及颅面特征相关选择区域等内容，共包含2个文件。文件详解数据文件：文件名称：final_data.xlsx 文件格式：XLSX...

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Andean_cloud_forest_birds_speciation_data

数据集概述本数据集包含安第斯云雾林鸟类基因组研究相关数据，聚焦物种形成过程中的分化与基因渗入现象。通过对16个同域分布谱系的160余个个体进行短读长全基因组测序分析，探究遗传分化、基因流与羽色表型分化的关系，为理解地理隔离和基因交换在物种形成中的作用提供数据支持。文件详解文件名称：upload.zip 文件格式：ZIP...

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HIV_1_Patient_0_北美1970年代HIV_AIDS早期历史基因组数据

数据集概述本数据集包含1978-1979年美国血清样本中的8个完整编码HIV-1 M组基因组（目前已知最古老的9个HIV-1 M组基因组中的8个），以及"Patient 0"个体的HIV-1基因组。数据揭示了1970年代美国HIV-1疫情的遗传多样性，为HIV从加勒比地区传入美国的时间、早期传播中心及病毒进化特征提供了关键证据。文件详解...

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CFR植物生物多样性热点地区Restio_capensis种群分化基因组学研究数据

数据集概述本数据集聚焦南非开普植物区（CFR）特有植物Restio capensis，通过叶绿体DNA序列和RAD测序获得的14400余个核DNA多态性位点，结合空间、气候及植物地理数据，分析种群分化驱动因素。结果显示环境隔离（IBE）而非地理距离隔离（IBD）是主要驱动因素，为分子生态学研究提供支撑。文件详解...

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Oncorhynchus_mykiss_Based_虹鳟鱼谱系与栖息地自然选择标记数据

数据集概述本数据集包含虹鳟鱼（Oncorhynchus mykiss）的基因组SNP标记数据，基于美国西北部及不列颠哥伦比亚省11个溯河洄游与定居种群的805个个体，筛选276个单核苷酸多态性位点，用于分析谱系间及栖息地的自然选择信号，重点关注免疫相关基因（如MHC II类基因）的适应性分化，为鱼类进化与适应性研究提供资源。文件详解...

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Virentes_based_美洲冬青栎基因组与种群遗传学系统发育及生物地理学研究数据

数据集概述本数据集围绕美洲冬青栎（Quercus subsection Virentes）展开，包含基因组与种群遗传学分析相关数据，用于探究该类群的系统发育关系、分化时间、基因流模式及生态位分化机制，覆盖遗传多样性、形态功能性状及气候生态位等维度。文件详解 CSV格式文件（共5个）...

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SheepGenetics_Based_瑞士本地绵羊品种纯合子运行与选择信号分析数据集

数据集概述本数据集包含8个瑞士本地绵羊品种的基因组数据，涉及787只高密度SNP芯片（346,774个SNP）和939只中密度SNP芯片（33,828个SNP）基因型样本。通过分析群体结构、基于纯合子运行的基因组近交系数及选择信号，揭示品种间遗传多样性差异及候选基因功能，如体型、产羔数、毛色等性状相关基因。文件详解...

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Nasonia_Genetic_Genomic_寄生蜂物种特异性表皮碳氢化合物变异数据

数据集概述本数据集聚焦寄生蜂属（Nasonia）物种特异性表皮碳氢化合物（CHCs）变异的遗传与基因组机制，包含91个数量性状位点（QTL）数据、CHC原始峰面积数据及相关说明文档，共4个文件，用于解析CHC生物合成的遗传基础及甲基支链烷烃等关键化合物的遗传调控机制。文件详解 README.txt（TXT格式）：说明文档，涵盖GC-...

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Genome_data_for_avian_MHC_鸟类主要组织相容性复合体基因组数据

数据集概述本数据集基于长读长测序技术，分析鸟类主要组织相容性复合体（MHC）的基因座数量与位置，覆盖28种鸟类（含此前未研究MHC的物种），揭示雀形目鸟类MHC基因座的高重复特性与复制模式差异，为鸟类免疫基因组研究提供基础数据。文件详解文件名称：dyard.xlsx 文件格式：XLSX...

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Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据

数据集概述本数据集围绕彩虹镖鲈（Etheostoma caeruleum）的基因组多样性与栖息地适应性展开，包含8个采样点（含独特湖泊栖息地）的形态特征、热耐受性及基因组数据，用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系，共9个文件。文件详解基因组与种群结构相关文件文件名称：VCF_RDarters.vcf 文件格式：VCF...

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Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据

数据集概述本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。文件详解基因组相关文件...

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Supplementary_Spirochaetales_四环素耐药突变分析与可复现脚本

数据集概述本数据集包含螺旋体四环素耐药相关突变分析的补充材料，涉及16S rRNA、rpsC、rpsJ基因座的多序列比对文件、4张补充表格及分析脚本，用于确保研究可复现性，支持螺旋体目抗生素耐药性进一步研究，共9个文件。文件详解补充表格文件...

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Buckingham_2022_Plethodon_cinereus种群基因组分析数据集

数据集概述本数据集包含北美蝾螈（Plethodon cinereus）两种形态种群的基因组分析数据，支持长岛地区纯色种群从原同域分布形态分化为邻域分布的研究结论。数据基于双酶切RAD测序技术，涵盖SNP比对信息及分析脚本，用于验证种群单系性及分化模式，共包含4个文件。文件详解 README.md 文件格式：MD...

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ICI_Patients_Based免疫检查点抑制剂治疗患者NLR与突变负荷预后分析数据

数据集概述本数据集包含2037名接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的临床与基因组数据，涉及18种癌症类型。数据用于分析预处理中性粒细胞与淋巴细胞比值（NLR）、肿瘤突变负荷（TMB）与患者生存及治疗反应的关联，为免疫治疗预后研究提供支持。文件详解文件名称：NLR, TMB and outcomes in patients treated with...

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Dryad_Source_Sylvietta_brachyura新性染色体发现研究数据集