-
轴突膜粗粒化模型数据集
2025年12月15日 30 177 101
数据集概述 本数据集提供了轴突膜的粗粒化（CG）模型相关文件，支持分子动力学模拟研究。模型基于MARTINI 2.2力场构建，包含平衡态轴突膜结构、拓扑文件、参数示例及说明文档，为轴突膜力学特性与破裂机制分析提供数据基础。 文件详解 文件名称及格式： axolemma.gro：GROMACS坐标格式文件，存储平衡态轴突膜的结构数据...
-
振动激子模型与量子化学局域模计算基准测试数据集
2025年12月14日 30 4 1
数据集概述 本数据集是学术论文的配套数据，包含振动激子模型与量子化学局域模计算的基准测试数据，涉及六个多肽测试案例在真空或水环境下的频率计算结果，覆盖不同计算方法和参数设置，为相关计算复现与分析提供支持。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下： - 目录 '01_AIM'： -...
-
DPPC_Berger_OPLS06_Based_盐环境下DPPC双层膜分子动力学完整数据
2025年12月14日 30 179 22
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟时长120纳秒，分析了最后60纳秒的数据，为研究DPPC膜在盐环境中的结构与动力学提供支持。 文件详解 模拟配置与力场文件：...
-
胆固醇对膜影响的非普遍性研究数据集
2025年12月7日 30 79 12
数据集概述 本数据集包含原子分子动力学模拟的设置文件、参数文件及后处理分析用的修改轨迹，围绕胆固醇对膜的流动性、曲率感知和弹性的非普遍性影响展开，对应2023年发表于《Nature Comm.》的研究。 文件详解 压缩文件： Membrane-...
-
Peter_Tieleman_DPPC_Berger_NaCl_Based_1molNaCl下DPPC双层膜MD模拟完整数据
2025年12月6日 30 208 112
数据集概述 该数据集包含1摩尔氯化钠（NaCl）环境下完全水合DPPC双层膜的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件。采用Berger-DPPC-98力场和Gromos离子力场，模拟条件为323K、72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对Na/Cl离子，轨迹时长120纳秒，分析使用最后60纳秒数据。 文件详解 分子动力学参数与拓扑文件：...
-
DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集
2025年12月6日 30 36 20
数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
-
Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据
2025年12月6日 30 58 54
数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件，采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成，离子电荷缩放系数为0.7，提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件，存储120ns模拟的原子坐标信息...
-
PeterTielemanLab_DPPC_Berger_NaCl_1Mol_Based_盐环境下DPPC双层膜动力学完整数据
2025年12月6日 30 138 45
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，基于Berger-DPPC-98力场和Gromacs 5.0.4软件生成，离子电荷缩放系数为0.7，模拟时长120纳秒。 文件详解 分子动力学模拟文件： md.gro：GROMACS结构文件，存储模拟系统的原子坐标与拓扑信息...
-
小Boc保护赖氨酸环肽的阴离子复合物溶液数据集
2025年11月29日 30 191 113
数据集概述 本数据集记录了含Boc保护侧链的四、五、六元赖氨酸环肽与多种阴离子（氯、溴、碘、硝酸根等）在乙腈（MeCN）和二甲亚砜（DMSO）中的结合特性，包含ITC滴定、NMR测试及分子动力学模拟等实验数据，为研究环肽阴离子受体设计提供支持。 文件详解 该数据集按溶剂分类存储实验数据，具体说明如下： - DMSO溶剂实验数据（位于DMSO/目录下）：...
