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Annotated_cable_bacteria_基因组注释数据
2026年1月28日 30 154 123
数据集概述 本数据集包含使用Prokka 1.14.5版本注释的Candidatus Electrothrix和Candidatus Electronema电缆细菌基因组数据,以及这些基因组的平均氨基酸一致性(AAI)和平均核苷酸一致性(ANI)表格,共3个文件。 文件详解 AAI.xlsx 文件格式:XLSX...
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Drosophila_Based_果蝇生殖器官快速分化基因研究数据
2026年1月27日 30 182 149
数据集概述 本数据集围绕果蝇 simulans 与 mauritiana 雄性外生殖器快速分化的遗传基础展开,包含通过QTL定位、基因渗入映射及RNAi筛选获得的基因数据,涉及染色体3L/3R上的关键区域及Wnt信号通路组分、msl3等候选基因,为研究雄性生殖性状进化的遗传机制提供支撑。 文件详解 文件名称:gff.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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MALDI_TOF_Based_考古与现代鱼类骨胶原质谱及序列数据
2026年1月27日 30 205 203
数据集概述 本数据集包含考古(Oncorhynchus属)与现代(Salmo salar)鱼类骨胶原的MALDI-TOF质谱数据及相关序列信息,含样本信息CSV、质谱文本文件压缩包、胶原序列比对FASTA及注释GFF文件,共6个文件,用于生物考古领域的物种鉴定与胶原特征分析。 文件详解 样本信息文件 文件名称:file-information.csv...
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Mvit_genome_Based_无脊椎动物基因组序列与注释数据集
2026年1月25日 30 178 135
数据集概述 本数据集包含Mvit物种(推测为某种无脊椎动物)的基因组相关数据,共7个文件,涵盖基因组序列、注释信息、比较分析结果等内容,支持基因组结构分析、功能基因挖掘及进化研究。 文件详解 基因组序列文件...
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蓝灯鱼_Lamprologus_的完整线粒体基因组及河流慈鲷相关数据
2026年1月23日 30 124 62
数据集概述 本数据集包含河流生丽鱼属(Lamprologus)物种的完整线粒体基因组数据,重点关注盲丽鱼(L. lethops)。数据涵盖基因组特征文件、基因序列比对文件、分区文件及样本信息表,支持丽鱼科物种的分子生物学研究,共包含18个文件。 文件详解 线粒体基因组特征文件(*.gff)...
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FMR1_Iso_Seq_Based_脆性X相关疾病基因剪接异构体研究数据
2026年1月21日 30 8 2
数据集概述 本数据集为FMR1基因Iso-Seq测序的最终文件,包含49种FMR1基因剪接异构体的序列、表达量、开放阅读框比对等信息。数据来自对脆性X前突变携带者的研究,旨在分析FMR1基因剪接变异的表达模式及其与脆性X相关震颤/共济失调综合征(FXTAS)等疾病的关联。 文件详解 FMR1.49_isoforms.ORF_alignment.txt...
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Asian_arowana_Based_三种变种染色体水平基因组组装与基因注释数据
2026年1月18日 30 97 28
数据集概述 本数据集包含亚洲龙鱼(Scleropages formosus)三种常见变种(金色、红色、绿色)的基因组序列与注释数据。其中金色龙鱼为染色体水平组装,红、绿龙鱼为草图组装,分别注释了22016、21256、21524个蛋白编码基因,旨在解决其生物学研究与育种种质缺乏参考基因组的问题。 文件详解...
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Brassica_napus_Based_甘蓝型油菜两个近缘品种基因组组装与比较数据
2026年1月18日 30 209 128
数据集概述 本数据集包含甘蓝型油菜品种Tapidor的从头基因组组装,以及与改良组装的Darmor-bzh品种的比较数据。两者采用相同注释方法以实现基因内容对比,识别了各品种特有基因并区分组装注释差异导致的伪影,共含17个归档文件。 文件详解 基因组组装与注释文件...
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Tectona_grandis_Based_柚木染色体级基因组组装与萜类合成基因数据
2026年1月18日 0 113 23
数据集概述 本数据集提供柚木(Tectona grandis)染色体级高质量基因组组装及功能注释数据,包含基因序列、表达矩阵、基因组注释文件等,支持研究柚木串联基因复制机制及天然产物生物合成通路相关基因的发现,助力柚木品种改良与可持续生产研究。 文件详解 文档类文件 文件名称:2018.10.23-teak-data-readme.docx...
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Chenopodium_quinoa_Based_藜麦光周期与发育响应转录组数据
2026年1月15日 30 80 5
数据集概述 本数据集记录藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)叶与茎尖分生组织在光周期和发育过程中的转录组信息,包含光周期敏感与不敏感材料的基因表达差异,涉及222个光周期响应叶基因、1812个长日条件下材料差异叶基因、57个短日条件下发育响应叶基因及911个茎尖分生组织成花转变响应基因,可用于藜麦开花时间调控机制研究。 文件详解...
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Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据
2026年1月15日 30 45 30
数据集概述 本数据集包含喜树(Camptotheca acuminata)的高质量从头基因组组装及相关注释数据,喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等,共15个文件,为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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Beyond_Buro类发酵乳杆菌BIL20_BIL24株基因组分析数据集研究报告
2026年1月15日 30 11 3
数据集概述 本数据集对应论文《Beyond Buro》,包含从菲律宾传统发酵鱼制品burong isda中分离的Limosilactobacillus fermentum BIL20和BIL24菌株的基因组数据,涵盖基因组组装、RAST与Prokka注释及益生菌相关基因的定位映射,为研究其益生菌潜力提供基础,共8个文件。 文件详解...
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Supporting_Information_海岸海洋浮游菌海藻附生圈竞争力研究数据
2026年1月14日 30 120 81
数据集概述 本数据集是论文“Competitiveness of Planctomycetes inhabiting macroalgae phycosphere in coastal ocean: evidences from a representative isolate with strong ability to degrade...
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Siegel_Lab_Based_布氏锥虫Tb427菌株基因组组装流程数据0_0_3版
2026年1月13日 30 116 97
数据集概述 本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株(Tb427)的基因组组装数据,包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式(coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded),v11版本包含二倍体 scaffolded组装,所有组装文件均附带序列和注释信息。 文件详解...
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Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023
2026年1月13日 30 138 122
数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy(碳水化合物活性酶)预测结果,涉及相关菌株(如Pcopri、Btheta、Buniformis)的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码,共47个文件,用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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破伤风梭菌_Clostridium_perfringens_1_2_丙二醇细胞壁研究数据
2026年1月13日 30 78 36
数据集概述 本数据集围绕产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)对1,2-丙二醇的利用及其与细胞包膜的相互作用展开,包含微阵列杂交后的荧光强度数据,以及实验所用的组装注释基因组文件,为研究该菌的代谢机制与细胞包膜相互作用提供基础数据支持。 文件详解 Clostridium_MM2023_5.gff 文件格式:GFF...
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Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版
2026年1月12日 30 114 37
数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜(Melanaphis sacchari)的染色体级别基因组组装与注释数据,包含356.1 Mb基因组序列(其中85.5%位于3条常染色体和X染色体)、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因(BUSCO完整性达95.8%),以及系统发育分析相关信息,为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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Rubioideae_Phylogenomics_Based_茜草亚科质体系统发育与核质不一致性研究数据
2025年12月31日 30 6 3
数据集概述 本数据集基于核基因组目标捕获测序项目的脱靶 reads 构建质体基因组系统发育树,探究茜草科茜草亚科的进化关系及核质不一致性。包含一百二十个质体基因组序列,通过公共双端 Illumina 测序数据组装得到,支持亚族内及亚族间多数关系的解析,识别出核质不一致案例,为植物系统发育研究提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Dryad_Based_superasterid基因组深度学习NLR注释数据集v250214_91366
2025年12月31日 30 132 96
数据集概述 本数据集通过深度学习工具Helixer对230个高质量superasterid基因组进行标准化从头注释,结合NLRtracker识别出91,366个NLRs及相关序列。数据按APG IV系统发育目分类存储,包含基因组组装、注释文件、NLR序列及补充元数据,支持superasterid植物NLR免疫受体的比较基因组学与进化研究。 文件详解...



