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唇口目苔藓动物骨骼矿物学演化补充数据集
数据集概述 本数据集为唇口目苔藓动物骨骼矿物学演化研究的补充数据，包含可复现研究的全部文件与代码，涉及化石记录、矿物学测量、系统发育分析等核心内容，支持对方解石海到文石海环境下骨骼矿物组成变化的研究。 文件详解 数据文件 AGE-ONLY.xlsx：Lidgard et al. 2021化石数据集AGE-ONLY部分的分类单元名称，格式为Excel...
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植物系统发育推断公共序列数据局限性分析数据集
数据集概述 本数据集围绕植物系统发育推断中公共序列数据的局限性展开，包含基于GenBank数据构建的陆生植物属级系统发育树及相关分析文件，通过系统发育数据决定性理论探讨数据稀疏性对推断的限制，为理解公共数据库在植物系统学研究中的应用价值提供支持。 文件详解 系统发育树文件：...
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越南新发现蕨类物种Tectaria_danangensis研究数据集
数据集概述 本数据集记录越南新发现蕨类物种Tectaria danangensis的分类学研究，包括形态特征描述、与近似种的比较及基于叶绿体DNA序列的系统发育分析结果，揭示其分类地位及亲缘关系。 文件详解 文件名称: README.txt，格式为TXT，包含数据集版本、作者、DOI等元数据及说明 文件名称:...
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菲律宾鼩鼱快速近期辐射进化的实证与模拟系统基因组学数据集
数据集概述 本数据集围绕菲律宾鼩鼱属（Crocidura）8个物种的快速近期辐射进化问题，通过实证与模拟系统基因组学方法开展研究。包含超保守元件、线粒体基因组测序数据及不同方法的系统发育分析结果，揭示了快速辐射进化中构建分叉树的挑战。 文件详解 附录文件： Online Appendix 2 - Locus...
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贝叶斯拓扑假设检验与潜水甲虫案例数据集
数据集概述 本数据集围绕贝叶斯方法在拓扑假设检验中的应用展开，以潜水甲虫（Coleoptera: Dytiscidae）的Suphrodytes和Hydroporus属是否应合并为案例，通过改进的贝叶斯因子检验支持Suphrodytes嵌套于Hydroporus属的结论。包含补充文档、树文件和数据集文件三类资源。 文件详解 Supplementary...
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细趾蝾螈物种树推断影响因素实证研究数据集
数据集概述 本数据集围绕细趾蝾螈（Batrachoseps）的物种树推断展开，包含22个物种的5个核基因与1个线粒体基因数据，用于分析推断方法、种群取样及基因取样对物种树拓扑结构的影响，为研究不同方法在实证数据中的表现提供支持。 文件详解 分析脚本与说明文件：...
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被子植物陆生到水生过渡期间基因组渐进精简与趋同适应数据集
数据集概述 本数据集围绕被子植物从陆生到水生过渡过程中的基因组变化与适应机制展开，包含物种生活习性、系统发育树、基因家族数量、微生物多样性及统计分析结果等多维度数据，为研究植物水生适应性进化提供支撑。 文件详解 压缩文件: GCAA.zip（Gradient Convergence of Aquatic Angiosperms），包含以下文件及目录：...
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鸡形目分歧时间估算数据集_基于超保守元件最佳基因筛选方案
数据集概述 本数据集围绕鸡形目（Galliformes）的分歧时间估算展开，基于超保守元件（UCEs）的最佳基因筛选方案，包含130个现存鸡形目类群的序列比对文件和系统发育树文件，为研究鸡形目演化历史、物种分化时间提供数据支持。 文件详解 该数据集包含序列比对文件、系统发育树文件及辅助文本文件，具体说明如下： - 序列比对文件（位于不同分类目录下）：...
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胎盘类分子进化速率与白垩纪_古近纪灭绝后夜行瓶颈数据集2017
数据集概述 本数据集为论文《分子进化速率揭示胎盘类生活史特征的自然历史及白垩纪-古近纪灭绝后的夜行瓶颈》的源数据，包含基因序列比对、进化树、分支长度矩阵、祖先状态等多类型文件，支持胎盘类分子进化与物种历史的研究。 文件详解...
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新大陆锥头蝗科起源研究数据集
数据集概述 本数据集为研究新大陆锥头蝗科（直翅目昆虫）起源的相关分析数据，包含系统发育分析、生物地理建模等多种方法所需的输入文件、结果文件及辅助文档，支持该类群起源与演化的学术研究。 文件详解 该数据集包含三十七个文件，覆盖多种分析类型，具体如下： - 系统发育分析相关文件： -...
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DNA提取扩增测序数据集
数据集概述 本数据集为研究哈茨木霉DAA8和棘孢木霉LDA4协同增强皇竹草和东南景天在复合污染土壤中镉铬植物提取能力的相关实验数据，包含DNA提取、扩增及测序过程产生的微生物群落分析文件。 文件详解 该数据集包含8个文件，均位于“DNA extraction, amplification and sequencing/”目录下，具体说明如下： -...
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杜鹃花目被子植物系统发育历史生物地理学与多样化数据集
数据集概述 本数据集是Rose等（2018）发表于《Molecular Phylogenetics and Evolution》的相关研究数据，包含杜鹃花目被子植物系统发育分析、BioGeoBEARS生物地理学分析和BAMM多样化分析的输入文件，为研究杜鹃花目演化关系及地理分布提供支持。 文件详解 数据集包含4个目录共10个文件，具体说明如下： -...
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茄科植物Iochrominae亚族物种树构建的目标序列捕获个体筛选数据集
数据集概述 该数据集包含用于茄科Iochrominae亚族物种树分析的比对文件和基因树文件，核心支持通过目标序列捕获个体筛选优化物种树构建的研究，为植物系统发育分析提供基础数据。 文件详解 文件名称: Alignments.zip，文件格式: ZIP压缩包，内容: 物种树分析用的序列比对数据 文件名称: genetrees.tre，文件格式:...
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Lymexyloidea与Mordelloidea系统基因组学数据集
数据集概述 本数据集为Lymexyloidea与Mordelloidea（鞘翅目：多食亚目：扁甲总科）系统基因组学研究的支撑数据，包含甲虫转录组与基因组的蛋白质序列比对文件、序列裁剪结果及系统发育树分析结果，用于相关研究论文的结果计算。 文件详解 该数据集包含12个文件，分布在2个目录中，具体说明如下： - 主目录文件： -...
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玉米根际微生物组苯并恶嗪类代谢调控数据集
数据集概述 本数据集包含支撑玉米根际微生物组苯并恶嗪类代谢调控研究的原始数据与分析脚本，涉及细菌、真菌群落数据及代谢组学原始数据，为相关研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: Fung_rep_set.fna，文件格式: .fna，可能包含真菌代表性序列数据 文件名称: Fung_json.biom，文件格式: .biom，可能包含真菌群落数据...
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肠道微环境靶向分析数据集
数据集概述 本数据集围绕新型无创采样胶囊内镜获取的肠道内容物展开，包含拉布拉多犬正常与炎症段回肠样本的16S rRNA测序数据及代谢组学分析数据，为肠道菌群与代谢物研究提供支持。 文件详解 该数据集包含两个核心数据目录，具体说明如下： - 16S rRNA测序数据目录（Targeted profiling the intestinal...
