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Ficus_Agaonidae_榕树传粉者共享与宿主转移物种形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕榕树（Ficus）与传粉榕小蜂（Agaonidae）的专性传粉共生关系展开，通过分子标记分析中国南部及台湾-琉球群岛6种近缘雌雄异株榕树及其传粉者的系统发育关系与种群遗传结构，探究宿主转移导致的传粉者物种形成机制，揭示传粉者共享、协同传粉等现象，为专性传粉共生系统的物种形成与宿主特异性研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件...
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DRYAD_Based_澳大利亚海狮钩虫遗传多样性与宿主分布关系研究数据
数据集概述 本数据集聚焦澳大利亚海狮（Neophoca cinerea）寄生钩虫（Uncinaria sanguinis）的遗传多样性研究，通过分析线粒体DNA细胞色素c氧化酶I基因片段，探究宿主分布与生态对寄生虫进化历史的影响。数据包含45种独特钩虫单倍型，揭示其高基因流动特征，挑战宿主出生地忠诚度限制寄生虫扩散的假设。 文件详解 说明文档...
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MEC_Letsch_Based蜻蜓系统发育与栖息地分化研究数据2016
数据集概述 本数据集围绕蜻蜓（Anisoptera: Odonata: Insecta）的系统发育与栖息地分化展开，基于8个核基因和线粒体基因，通过模型进化框架分析栖息地使用对分化模式的影响。数据包含序列比对文件及分区方案，用于研究蜻蜓从流水（lotic）到静水（lentic）栖息地的独立殖民化过程，以及栖息地对物种形成速率的影响。 文件详解...
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Crotalus_mitchellii_complex_物种界定研究数据
数据集概述 本数据集围绕斑点响尾蛇（Crotalus mitchellii）复合体的物种界定展开，包含遗传（核DNA、线粒体DNA）、表型和气候相关数据，用于验证气候数据作为生理耐受性替代指标在物种界定中的有效性。通过对比不同数据类型的聚类结果，分析气候数据在物种分类中的局限性，最终为该复合体的分类修订提供依据。 文件详解...
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Tippy_Solanaceae_Based茄科红花朵宏观进化机制研究数据
数据集概述 本数据集围绕茄科红花朵的稀有性与“尖端分布”（tippiness）宏观进化机制展开，包含系统发育树构建、性状进化模型拟合、尖端性指标计算等相关文件，覆盖基因序列、控制文件、分析脚本等15个文件，用于探究红花朵性状的起源、丢失及多样化速率等核心问题。 文件详解 基因序列文件...
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Physalis_Solanaceae_植物生长繁殖性状与抗性关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕Physalis属（茄科）植物的防御进化展开，通过系统发育比较方法分析生长速率、生活史（一年生/多年生）、交配系统（自交亲和/不亲和）对组成型抗性和诱导型抗性的影响，验证防御策略的进化约束及权衡关系，包含22个相关文件。 文件详解...
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Pan_Serpentes_Serpentes_蛇类起源与早期演化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦蛇类起源研究，整合基因组学、表型组学及化石记录信息，通过多种祖先状态重建方法，分析冠群蛇类与总群蛇类祖先的生态、行为及演化历史，包含系统发育重建与时间校准等相关数据，为蛇类早期演化研究提供支持。 文件详解 数据文件组（.nxs格式）...
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Symbiodiniaceae_Based珊瑚共生藻系统修订与进化研究数据
数据集概述 本数据集为珊瑚共生藻科（Symbiodiniaceae）系统修订研究的配套数据，包含分子序列、系统发育分析输入文件、遗传与形态学分析代码及结果日志等，支撑对该科进化历史、多样性及与珊瑚共生关系的研究，涉及中生代约1.6亿年前的分化时间校准等关键结论。 文件详解 分子序列文件（.nexus格式）...
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Isthmus_Panama_Based_加勒比海清洁虾物种形成路径研究数据集
数据集概述 本数据集围绕巴拿马地峡形成后加勒比海Pederson清洁虾（Ancylomenes pedersoni）物种复合体的进化历史展开，包含基因序列、拓扑测试结果、种群统计模型模拟数据及模型选择结果，用于揭示物种形成路径，验证异域分化、二次接触及杂交物种形成等过程。 文件详解 基因序列文件...
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Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据
数据集概述 本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果，包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本，可支持物种系统发育与种群遗传学研究，共6个文件。 文件详解 序列比对文件 文件名称：Alignment_for_RAxML.phy 文件格式：PHY...
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Malagasy_dung_beetles_Based_竞争释放与物种形成研究数据集
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加蜣螂（Nanos和Apotolamprus属）的竞争释放、分布扩张与物种形成展开，整合了系统发育树、基因序列、地理分布、丰度及体型数据，用于验证竞争释放促进物种分化的假说，为理解岛屿生物多样性形成机制提供支持。 文件详解 系统发育树文件（.nex格式，共7个）...
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Pseudomyrmex_Vachellia_Based金合欢蚁趋同进化与生物地理背景研究数据
数据集概述 本数据集围绕金合欢蚁（Pseudomyrmex ferrugineus群）与Vachellia宿主植物的共生关系展开，通过系统基因组学方法（超保守元件序列捕获）研究其进化历史，包括趋同进化、生物地理背景及相互作用起源，共包含8个文件。 文件详解 beast-xml-files.zip（ZIP格式）：包含BEAST分析相关的XML文件...
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Jawed_vertebrate_phylogenomics_颌脊椎动物骨干系统发育基因选择研究数据
数据集概述 本数据集为颌脊椎动物骨干系统发育基因组学研究的配套数据，聚焦于通过选择特定问题相关基因减少系统发育分析中的不一致性。包含58个颌脊椎动物类群、4682个基因的系统发育数据集，以及相关分析文件，旨在支持对系统发育分析中基因选择策略有效性的研究。 文件详解 归档文件包 文件名称：tree_nex.zip 文件格式：ZIP...
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ICTV_VMR_Based双生病毒CP与Rep氨基酸比对及系统发育分析完整数据
数据集概述 本数据集包含ICTV批准的双生病毒RefSeq物种样本的外壳蛋白（CP）、修剪后的复制相关蛋白（Rep）氨基酸序列比对结果、系统发育分析文件及关联元数据，共涉及432个符合纳入标准的物种样本，为双生病毒的分类与进化研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称：Begomovirus-ICTV-approved-species-...
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Phasmid_Wings_Evolution_竹节虫翅膀进化可逆性宏进化分析数据集
数据集概述 本数据集为竹节虫翅膀进化可逆性的宏进化分析研究提供支持，包含超300种竹节虫的基因序列、系统发育树、性状数据及分析文件。数据用于探究复杂性状（翅膀）在进化中丢失后重新获得的可能性，揭示翅膀进化的动态可逆过程，支持物种分化速率与性状进化关系的研究。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式，共8个） 12s.fasta：12S基因序列比对文件...
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Evolution_Based_雀形目鸟类虹膜颜色进化与巢穴类型及亲代抚育关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕雀形目鸟类虹膜颜色进化展开，关联巢穴类型（洞巢/非洞巢）与亲代抚育行为两大特征，通过系统发育比较方法验证虹膜颜色演化的选择压力假设。数据包含系统发育树文件与性状矩阵，支持分析虹膜颜色与抚育行为、巢穴类型的进化依赖关系，共含5个文件。 文件详解 系统发育树文件（.nex格式，共4个）...
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Pelophylax_esculentus复合体_欧洲种群遗传多样性与分布模式研究数据
数据集概述 本数据集为欧洲水蛙（Pelophylax esculentus复合体）种群研究的配套数据，包含二倍体与多倍体杂交个体的遗传多样性、地理分布及系统发育相关信息。数据支持研究杂交种的起源、维持机制及杂交物种形成潜力，涵盖种群分布、遗传标记、系统发育树等多类型文件，共11个文件。 文件详解 数据表格文件（.xlsx）：共4个，包括Hoffmann...
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Adiantum_vittarioids_Pteridaceae_系统发育关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕铁线蕨属（Adiantum）与带状蕨类（vittarioids）的系统发育关系展开，包含支持铁线蕨属单系性及其与带状蕨类姐妹群关系的分子数据。数据涵盖质体基因序列比对、最大似然分析及贝叶斯分析相关文件，用于验证该类群的进化关系，共包含六个文件。 文件详解 说明文档类（.txt格式，共3个）...
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eutherian_mammal_phylogenomics_系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为真兽类哺乳动物系统发育基因组学研究数据，包含37个物种的447个核基因全基因组数据，用于解决真兽类哺乳动物系统发育中的冲突问题。通过串联法与多物种溯祖模型的对比分析，揭示基因树异质性对系统发育重建的影响，明确真兽类系统发育关系及根位置。 文件详解 文件名称：README_for_gene447_final.docx...
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Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据
数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
