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卡彭氏索足蛤氧波动差异表达基因功能注释数据集
数据集概述 本数据集为卡彭氏索足蛤在氧波动条件下差异表达基因的功能注释数据，是研究论文的补充数据文件，包含基因组装信息、测序元数据、注释摘要、表达量数据及功能富集结果等，支持对该物种氧适应分子机制的分析。 文件详解 文件名称：Lucinoma.Suppl.readme.docx，格式：docx，内容：数据集说明文档，提供文件结构及使用指引...
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小单孢菌科生物合成基因簇多样性研究数据集
数据集概述 本数据集为研究小单孢菌科生物合成基因簇（BGC）多样性的配套数据，包含42株菌株（41株小单孢菌科、1株链霉菌科）的基因组分析结果，涉及基因簇预测、分类、可视化等多类数据文件及分析脚本，支持相关领域的深入研究。 文件详解 该数据集包含12个主要数据文件夹和补充信息，具体说明如下： - Data...
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入侵性非本地哺乳动物种群遗传多样性数据集
数据集概述 该数据集聚焦入侵性非本地哺乳动物种群的遗传多样性研究，通过对比新西兰入侵白鼬与英国本土白鼬的线粒体遗传多样性，揭示入侵种群保留了本土已消失的单倍型，为理解生物入侵与遗传多样性关系提供数据支持。 文件详解 代码文件（.r格式）： British_Stoat_Simulation.R：用于英国本土白鼬种群的模拟分析代码...
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百岁兰蝽宿主植物转换与肠道微生物群关联数据集
数据集概述 本数据集围绕百岁兰蝽从被子植物向裸子植物（百岁兰）宿主转换的适应性机制展开，包含其肠道微生物群落（细菌、真菌）的测序数据、实验室发育实验结果及微生物系统发育分析文件，为研究昆虫适应极端环境新宿主的微生物驱动机制提供数据支持。 文件详解...
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Bioconductor表达蛋白质组学数据处理评估解释工作流数据集
数据集概述 该数据集包含Bioconductor工作流所需的文件，用于处理、评估和解释表达蛋白质组学数据，包括Proteome Discoverer处理及共识工作流文件、鉴定搜索输出文件、参考序列文件和附录文档，支持TMT与LFQ两种表达蛋白质组学数据分析。 文件详解 工作流配置文件：...
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曲霉属曲霉组多相分类与室内及食品环境分布数据集
数据集概述 该数据集围绕曲霉属曲霉组（原散囊菌属）的多相分类研究展开，涵盖形态特征、次生代谢产物、生理特性及系统发育分析数据，涉及全球室内环境与食品基质中的菌株鉴定及分类结果。 文件详解 系统发育分析文件（.fas、.fasta格式）： benA.fas、caM.fas、ITS.fas、RPB2.fasta：分别包含β-...
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甘蔗蟾蜍转录组补充数据集
数据集概述 本数据集包含甘蔗蟾蜍脾脏组织经LPS和皮质酮急性处理后的RNA测序补充转录组数据，用于分析急性应激对免疫基因表达的影响，含实验相关的代码、序列及结果文件。 文件详解 文档文件： READ ME.docx：DOCX格式，可能包含数据集使用说明或实验背景介绍 代码文件： Supplemental File 1. canetoad...
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法劳按蚊复合体嗅觉基因比对与全基因组SNP数据集
数据集概述 本数据集包含法劳按蚊复合体中四类主要昆虫化学感应基因家族的编码序列核苷酸比对数据，以及全基因组SNP数据，关联于研究宿主偏好差异与嗅觉基因关系的手稿，还提供计算kA/kS的R代码。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下： - 核心数据文件： -...
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欧亚水獭线粒体基因组数据集
数据集概述 该数据集包含濒危物种欧亚水獭（Lutra lutra）的完整线粒体基因组序列，总长16,537 bp，涵盖13个蛋白编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA及1个控制区，为欧亚水獭的遗传学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: MW573979_Lutra luta.fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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昆虫抗病毒Mx样蛋白形成生物分子凝聚体促进病毒衣壳泛素化降解序列数据集
数据集概述 本数据集为发表于CELL REPORT期刊的相关研究论文的序列数据，核心内容是昆虫抗病毒Mx样蛋白形成生物分子凝聚体促进病毒衣壳泛素化降解相关的蛋白序列信息。 文件详解 文件名称：Insect antiviral Mx-like protein forms biomolecula/protein-seq.fasta 文件格式：FASTA...
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婴儿利什曼原虫基因组大环序列数据集2018
数据集概述 本数据集包含从Illumina测序读段组装的3条婴儿利什曼原虫基因组大环序列，编码区以大写字母标注，基于Bussotti等（2018）的测序数据及Camacho等（2019）的组装方法构建，为研究该寄生虫基因组结构提供数据支持。 文件详解 文件名称: Maxicircles_Linf-Bussotti_2018.fas 文件格式:...
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隼科鸟类线粒体序列数据集
数据集概述 本数据集包含用于研究鸟类系统发育中假基因化现象的隼科鸟类线粒体序列，重点关注隼科中核线粒体DNA片段（numts）的特征，为分析其在系统发育中的影响提供基础数据。 文件详解 文件名称:...
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TP53基因蛋白序列数据集
数据集概述 该数据集包含TP53基因对应的蛋白序列数据，源自NCBI数据库中与基因ID 7157关联的蛋白参考序列，为研究TP53基因编码的蛋白结构与功能提供基础序列信息。 文件详解 文件名称: sequence (1).fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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日本奈良县高见川河流宏基因组样本扩增子测序数据集2017
数据集概述 本数据集包含2017年日本奈良县高见川河流宏基因组样本的扩增子测序数据，涉及线粒体cox1、核组蛋白H3及18S rRNA基因的部分编码区序列，涵盖不同采样位点、环境类型的样本，以及分类单元（OTUs）和物种界定分析结果。 文件详解 实验信息文件： Table 1_Takamigawa amplicon...
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绿藻目叶绿体基因数据集
数据集概述 该数据集包含绿藻目（Cladophorales）多种绿藻的叶绿体基因序列数据，涉及Chaetomorpha aerea、Cladophora albida等9个物种，以.fas和.fasta格式存储，主要用于研究其叶绿体基因组特征。 文件详解 基因序列文件：...
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须腹菌属_黄杉属外生菌根共生基因组规模序列分型数据集
数据集概述 本数据集为研究须腹菌属（Rhizopogon）与黄杉属（Pseudotsuga）外生菌根共生关系的基因组规模序列分型（GSST）数据，包含核苷酸序列比对、系统发育树文件、基因座坐标文件及相关分析脚本，支持共生演化与共迁移研究。 文件详解 系统发育树文件: RAxML_bipartitions_ITS_alignment.tre:...
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绿藻目叶绿体基因比对数据集
数据集概述 该数据集包含绿藻目叶绿体基因的核苷酸与氨基酸序列比对数据，支持相关研究对叶绿体基因组结构的分析，共含40个文件，以序列比对格式为主。 文件详解 文件类型与分布： .fasta格式文件（21个，占52.5%）：如aa_01_atpA.fasta、aa_02_atpB.fasta等，存储氨基酸序列比对数据...
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节旋藻16S核糖体RNA基因序列数据集
数据集概述 本数据集包含92条节旋藻（Arthrospira platensis）及相关类群的16S核糖体RNA基因序列，序列长度为1294个字符。数据来源于NCBI数据库及相关研究文献，用于分析节旋藻IBSS-31菌株的亲缘关系。 文件详解 该数据集包含一个FASTA格式的序列文件，具体说明如下： - 文件名称:...
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宝石轴孔珊瑚转录组从头组装与注释数据集
数据集概述 本数据集包含宝石轴孔珊瑚（Acropora gemmifera）的转录组从头组装与注释结果，样本采集于中国台湾南部3-4米水深区域，为研究该珊瑚的基因表达与功能提供基础数据。 文件详解 文件名称：Agemmifera.V10.Trinity.annotated.gff3 文件格式：GFF3（通用特征格式3）...
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Aporocotylidae寄生虫MUSCLE比对数据集_含双壳类感染新数据
数据集概述 本数据集包含基于MUSCLE算法的Aporocotylidae寄生虫序列比对结果，其中整合了来自双壳类感染的新数据，为研究该类寄生虫的分子特征提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: Aporocotylidae aligment.fasta 文件格式: FASTA（.fasta） 文件内容:...
