-
Hyla_andersonii_Based基因组系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集为北美东部特有物种Pine Barrens Treefrog(Hyla andersonii)的基因组系统地理学研究数据,包含该物种三个地理种群(阿拉巴马/佛罗里达、卡罗莱纳、新泽西)的基因组分析相关文件,支持研究其历史分布碎片化的成因、种群分化时间及冰期避难所等进化历史问题。 文件详解 文档文件...
-
Partula_Society_Island树蜗牛基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集基于博物馆标本开展Society Island Partula树蜗牛的基因组研究,包含3个压缩文件,记录了使用ddRADseq技术对灭绝事件后存活的3个物种(P. taeniata、P. clara、P. hyalina)进行的系统发育分析结果,验证了博物馆标本在基因组研究中的可用性,澄清了物种进化关系。 文件详解...
-
Squamata_Based_有鳞目基因组规模数据系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集基于289个样本的高通量测序数据,覆盖75个有鳞目科,用于分析其系统发育关系、估算分化时间及评估拓扑不确定性。重点验证传统形态学分类群(如Scleroglossa和Macrostomata)的基因组支持度,探讨基因树与物种树不一致的原因,包含23个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:Fig_S1_Phylogenetic...
-
Arabian_Horse_Based群体基因组近交与种群结构研究数据
数据集概述 本数据集包含36匹埃及阿拉伯马(使用Equine SNP70平台基因分型)及其他血统阿拉伯马的基因型数据,用于对比系谱与基因组方法估算的近交系数、亲缘关系,验证基因组方法的优越性,同时探究近交估算所需的最小标记数量。数据支持畜牧遗传资源保护与种群多样性研究。 文件详解 说明文档 文件名称:README_for_Genotypic...
-
Dryad_Horornis_斐济灌木莺基因流与岛屿生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集为论文配套的数据,基于斐济灌木莺(Horornis ruficapilla)的基因组数据,研究岛屿大小和距离对基因流的影响,验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件,支持相关假设检验与后续研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
-
Pan_reactome_Analysis_链霉菌菌株代谢关联分析数据
数据集概述 本数据集包含242株链霉菌菌株的泛反应组分析相关补充表格及基因组尺度代谢模型(GEMs)文件,涵盖基因组数据、生物合成基因簇(BGC)统计、ANI结果、GEMs验证与结构信息、代谢通路关联及水平转移基因预测等内容,用于揭示链霉菌初级与次级代谢的关联及分离机制。 文件详解 Table S1.xlsx 文件格式:XLSX...
-
Shearwaters_Based_古海洋变化驱动鹱科海鸟多样化研究补充数据
数据集概述 本数据集为“上新世晚期古海洋变化促进远洋海鸟快速多样化”研究的补充信息,聚焦鹱科海鸟(Ardenna、Calonectris、Puffinus属)。包含基因组数据、系统发育树、分析配置文件等16个文件,覆盖物种演化时间校准、生物地理重建、体型演化分析及分类有效性评估等核心研究内容,支撑古海洋变化对高移动性远洋海鸟分化驱动机制的探究。...
-
Dryad_Data_for_Soay绵羊近交衰退与环境互作研究数据
数据集概述 本数据集来自对圣基尔达岛野生Soay绵羊种群的研究,包含基于37037个单核苷酸多态性位点的基因组近交系数数据,以及种群密度作为环境变量的相关监测信息,用于分析近交衰退与环境的互作效应。 文件详解 文件名称:README_for_Data for Dryad.txt 文件格式:TXT 字段映射介绍:包含数据使用说明、研究背景及联系信息...
-
Genomic_Data_Uploading_基因组数据上传压缩文件
数据集概述 本数据集为基因组数据上传相关的压缩文件,包含一个压缩包文件,无训练测试、数据标签或原始处理数据的划分,未检测到命名模式,无目录结构,未提供自述文件或内容预览。 文件详解 文件名称:Genomic Data Uploading.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:未提供具体字段信息,为单一压缩包文件,无内容预览。 适用场景...
-
Norway_spruce_Genomic_人口历史与基因流研究数据
数据集概述 本数据集包含支持论文“Genomic data provides new insights on the demographic history and the extent of recent material transfers in Norway...
-
RADseq_Based_夏威夷与日本黑脚信天翁遗传形态比较研究数据
数据集概述 本数据集通过双酶切RADseq技术,对近危留鸟黑脚信天翁的夏威夷与日本主要繁殖种群进行基因组分化与基因流分析,同时结合博物馆标本开展形态差异研究,旨在为该物种的分类地位及保护管理单元划分提供数据支持。 文件详解 文件名称:Datasets.zip 文件格式:ZIP...
-
Haemosporida_Phylogeny_多基因系统发育分析数据
数据集概述 本数据集基于多基因方法开展血孢子虫(Haemosporida)的系统发育研究,包含7种血孢子虫的21个核基因片段序列及25种顶复门物种的基因组数据,总比对长度达20,580碱基对。通过贝叶斯推断、最大似然法等分析揭示血孢子虫的深层系统发育关系,为理解其进化历史、宿主转换及生物学多样性提供数据支持。 文件详解 README.txt...
-
Myotis_Speciation_北美鼠耳蝠基因流物种形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美鼠耳蝠(Myotis evotis、M. thysanodes、M. keenii)的基因流物种形成研究展开,包含研究补充材料与相关文件压缩包,支持对物种分化过程中基因流模型的分析与验证,共含2个文件。 文件详解 文件名称:SuppMaterial.docx 文件格式:DOCX...
-
AculeateDryadData_膜翅目昆虫系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为膜翅目昆虫系统发育基因组学研究数据,包含用于解析蚂蚁、蜜蜂和胡蜂等针尾部膜翅目主要类群进化关系的基因组数据及分析文件,旨在为理解真社会性等特征的演化提供系统发育框架,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:README_for_AculeateDryadData.txt 文件格式:TXT...
-
Cerapachys_biroi_Based克隆掠夺者蚂蚁基因组研究数据
数据集概述 本数据集为无 queen 克隆掠夺者蚂蚁 Cerapachys biroi 的基因组相关数据,该蚂蚁是研究昆虫社会分工分子调控的重要模型。数据集包含基因序列、进化树及基因列表等文件,支持对其繁殖方式、社会行为相关基因的分析,共5个文件。 文件详解 进化树文件(.tre) 文件名称:CYPs_573.tre、UGTs_321.tre...
-
StarBeast3_Based_多物种溯祖模型贝叶斯推断基准测试数据集
数据集概述 本数据集包含StarBeast3软件的基准测试数据集,涵盖3个真实数据集和2个合成数据集,以BEAST 2 XML格式提供,用于验证该软件在多物种溯祖模型下的贝叶斯推断性能,支持系统发育分析相关研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
-
Phrynosoma_Based_角蜥属系统基因组学靶向序列捕获研究数据
数据集概述 本数据集为角蜥属(Phrynosoma)系统基因组学研究的靶向序列捕获数据,包含540个超保守元件和44个蛋白编码基因的序列信息,用于解析17种角蜥的系统发育关系,解决此前分子系统发育分析中的冲突,支持四大亚群的分类框架,为比较分析提供基础。 文件详解 文件名称:Loci.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
-
Phylogenomic_Based大象与人类祖先适应性进化模式分析数据
数据集概述 本数据集为大象与人类祖先适应性进化的系统发育基因组分析数据,聚焦脑表达基因(如有氧能量代谢基因)的适应性进化模式。通过对比大象、人类、马岛猬、小鼠的基因组数据,分析核苷酸替代率、dN/dS比值及功能基因类别,探究大象与人类在大脑部、长寿命特征下的适应性进化趋同性,共包含4个压缩文件。 文件详解 压缩文件包 文件名称:Human...
-
Heliopora_Dryad_Based蓝珊瑚属新物种整合证据研究数据
数据集概述 本数据集为支持蓝珊瑚属(Heliopora)新物种(Heliopora hiberniana sp. nov.)发现的整合证据数据,包含形态学、基因组及繁殖相关数据,涉及澳大利亚西北部海域样本,可用于珊瑚分类学、抗漂白特性及生态功能研究。 文件详解 说明文档类...
-
Scandentia_Based_树鼩基因组系统发育位置冲突因素研究数据集
数据集概述 本数据集围绕树鼩(Scandentia)的系统发育位置争议展开,通过分析50种哺乳动物(含3种树鼩)的基因组数据,评估其与灵长总目、啮齿总目等类群的亲缘关系。数据集包含序列比对、表格数据及说明文档,用于探究系统发育冲突的生物与方法学因素,支持两种主要亲缘关系假说的验证。 文件详解 README_file.txt 文件格式:TXT...



