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野生黑腹果蝇先天免疫季节性快速进化数据集
数据集概述 本数据集记录北美东部不同纬度地区野生黑腹果蝇在季节变化中的先天免疫进化特征，包含自然种群和重组种群对特定细菌感染的存活与细菌载量数据，以及相关基因变异信息，揭示免疫防御快速循环进化的遗传机制。 文件详解 文档文件： Metadata.pdf：PDF格式，可能包含数据集的背景、实验设计、样本信息等元数据说明。 重组种群数据文件：...
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热带山地物种快速适应性分化基因组特征数据集
数据集概述 本数据集围绕巴布亚园丁鸟（Amblyornis papuensis）的适应性分化展开，包含基因组、种群遗传对比及补充材料等11个文件，辅助研究其东西部种群约1.18万年前因气候变暖隔离后的进化过程，揭示环境差异驱动的适应性分化机制。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： - 说明文档类： -...
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北美西部本土丛生禾草_沙生针茅_精细尺度空间遗传结构数据集
数据集概述 本数据集聚焦北美西部本土丛生禾草沙生针茅（Achnatherum thurberianum），通过简化基因组测序获取17个种群246个个体的5677个SNP位点数据，分析其种群遗传结构、进化历史及环境适应性，为恢复规划提供参考。 文件详解...
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德克萨斯蓝花楹野生种群同质化研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦德克萨斯蓝花楹（Lupinus texensis）野生种群与人工播种种群的遗传同质化研究，通过基因分型测序获取11,741个全基因组单核苷酸多态性（SNPs）及叶绿体基因组SNPs，分析12对相邻野生与播种种群（共187个个体）的种群结构与遗传多样性，揭示人类活动对该物种遗传结构的影响。 文件详解 说明文档类（.txt格式）：...
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牛分枝杆菌感染牛外周血RNA测序数据变异分类数据集
数据集概述 本数据集包含牛分枝杆菌感染（bTB+）与未感染（bTB-）牛外周血样本的RNA测序变异数据，以VCF格式存储，用于差异表达分析，为牛结核病感染的精准分类研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: ML4TB_Zenodo_upload_RNA_calls.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 压缩包内包含用于bTB+与bTB-...
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普通王蛇物种复合体谱系结构数据集
数据集概述 本数据集围绕普通王蛇物种复合体（Lampropeltis getula）的谱系结构展开，包含基因组序列数据、环境变量数据及分析结果文件，用于研究北美地区气候、地理与历史对其遗传分化及谱系形成的影响。 文件详解 遗传数据文件：...
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南极磷虾种群基因组学研究数据集
数据集概述 本数据集为南极磷虾种群基因组学研究的成果数据，包含线粒体DNA（mtDNA）与RAD-seq（限制性位点相关DNA测序）分析结果，涉及五个采样点（含两个东极地点）的磷虾样本，验证了其种群遗传结构的泛交性特征，并探讨了大基因组生物RAD-seq分析的复杂性。 文件详解 项目说明文档（PDF格式）： README_for_1 RAD-seq...
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DGRP黑腹果蝇基因型向参考基因组v6_0转换及质控图表数据集
数据集概述 本数据集包含DGRP黑腹果蝇基因型从旧版本向参考基因组v6.0转换的结果，涵盖VCF和PLINK格式基因型文件、转换运行代码、日志文件、统计摘要及质控图表，用于展示SNP位置变化情况。 文件详解 基因型数据文件： dgrp2_dm6_dbSNP.vcf.gz：压缩VCF格式基因型文件...
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西班牙普通菜豆多样性面板基因分型数据集
数据集概述 本数据集包含西班牙普通菜豆多样性面板中308个普通菜豆品系的基因分型数据，采用ApeKI限制性内切酶测序，经参考基因组V2.1比对及缺失值、最小等位基因频率过滤后，最终保留11,763个SNP标记。 文件详解 数据文件： 文件名称：alldata_filtered.vcf.vcf 文件格式：VCF...
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北美鼠蛇复合体物种形成灰色地带杂交空间复杂性研究数据集
数据集概述 该数据集围绕北美鼠蛇复合体（Pantherophis obsoletus）的物种形成灰色地带展开，结合种群基因组数据、景观特征与气候因素，分析谱系分化时间、迁移率与杂交带动态的关联，揭示不完全生殖隔离的形成机制。 文件详解 文档类文件（PDF格式，共7个）： Supporting_Information_Final5.pdf：支持信息文档...
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美国怀俄明州骡鹿景观基因组学与功能连通性数据集
数据集概述 本数据集基于美国怀俄明州406头骡鹿的4051个单核苷酸多态性（SNP）标记，分析其遗传结构与环境变量的关联，识别影响基因流动的景观因素，揭示不同遗传群体功能连通性的区域差异，为迁徙物种保护提供依据。 文件详解 说明文档类： readme.txt：TXT格式，介绍数据集的文件清单及研究背景...
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鳟鱼取食形态快速适应高山湖泊环境数据集
数据集概述 本数据集包含美国怀俄明州风河山脉高山湖泊中鳟鱼取食形态（如鳃耙特征）、遗传数据、湖泊环境变量及相关分析脚本，用于验证鳟鱼因捕食驱动的浮游动物群落变化而快速适应的生态进化过程。 文件详解 该数据集包含数据文件、分析脚本、文档等多种类型文件，具体说明如下： - 数据文件： -...
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硬粒小麦_Kronos_染色体水平基因组组装数据集
数据集概述 本数据集包含硬粒小麦'Kronos'的染色体水平基因组组装及相关突变分析数据，含外显子捕获和启动子捕获测序的突变识别结果，采用MAPS流程分析并通过SnpEff预测变异效应，数据使用遵循多伦多协议的预发布共享原则。 文件详解 文件名称及格式： Kronos_v1.1_Exome-...
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多组学尿路上皮抗PDL1分析数据文件
数据集概述 本数据集是用于支持多组学尿路上皮抗PDL1分析项目的数据文件集合，包含TCRS、Kallisto和VCFs三种类型的压缩数据文件，为相关生物信息学分析提供原始数据支持。 文件详解 文件名称: tcrs.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 可能包含T细胞受体（TCR）相关的测序或分析数据 文件名称: kallisto.zip...
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白血病细胞系REH多组学表征数据集
数据集概述 本数据集是关于白血病细胞系REH的多组学表征研究成果，包含通过短读长和长读长测序技术获得的基因组、转录组等多组学数据及分析结果，为深入研究REH细胞系的分子特征提供支持。 文件详解 覆盖深度分析文件:...
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北美东部及西弗吉尼亚州入侵植物忍冬种群结构研究数据集
数据集概述 本数据集围绕入侵植物忍冬（Lonicera japonica）的种群结构展开，包含用于基因分析的SNP数据文件及相关研究图表，为探究北美东部及西弗吉尼亚州该入侵物种的种群特征提供数据支持。 文件详解 文件名称: Jh2_tassel_LD_thinned.vcf.recode.vcf 文件格式: VCF (.vcf) 内容说明:...
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斑马鱼实验室驯化遗传特征数据集
数据集概述 该数据集通过RAD-seq技术对印度、尼泊尔、孟加拉国的野生斑马鱼种群及四种常见实验室品系进行遗传特征分析，对比野生种群与实验室品系的遗传多样性、杂合度等指标，揭示实验室驯化对斑马鱼遗传背景的影响。 文件详解 wildlabdanio.vcf.gz：VCF压缩格式文件，包含野生斑马鱼种群及实验室品系的遗传变异数据...
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TAILVAR终止密码子分析与延长变体预测数据集
数据集概述 该数据集包含TAILVAR评分开发的相关文件，TAILVAR评分用于评估终止密码子（TAA、TGA、TAG）处终止缺失变体的功能影响。TAILVAR基于随机森林模型预测终止缺失变体的致病性，整合多种预测评分、转录本特征和蛋白质上下文信息，输出0-1的致病性概率评分。 文件详解...
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鸟类辐射进化基因组位点系统发育研究数据集
数据集概述 本数据集围绕雀形目柳莺属8种鸟类的基因组系统发育研究展开，包含基因流对系统发育重建影响的分析数据，涵盖模拟输入、重组率估计、系统发育网络等多类型文件，为探究基因组数据与物种真实进化关系的差异提供支持。 文件详解 群体遗传学模拟输入文件：...
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叉角羚种群基因组学核心分布区连通性研究数据集
数据集概述 该数据集包含美国怀俄明州398只叉角羚的基因组学研究数据，涵盖4949个全基因组单核苷酸多态性（SNP）和11个微卫星基因座的基因型信息，以及样本基础信息、生物信息学分析流程文件等，用于评估叉角羚核心分布区的遗传结构与基因流状况。 文件详解 该数据集包含17个文件，按类型分组说明如下： - 文档与协议文件 -...
