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NTM_Persistence_Based肺泡巨噬细胞模型非结核分枝杆菌基因组数据集
数据集概述 本数据集包含5株非结核分枝杆菌(NTM)菌株的基因组组装与注释数据,涉及参考菌株及临床菌株,覆盖基因组拼接序列、转录本核苷酸序列、CDS氨基酸序列等多类文件,总计25个文件,用于研究NTM在肺泡巨噬细胞模拟细胞模型中的持留机制。 文件详解 基因组组装与注释文件(.gbk、.fasta)...
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Convergent_Adaptation_Based_鸟类线粒体基因组趋同进化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦鸟类线粒体基因组的趋同适应性进化研究,分析高海拔、迁徙、潜水等表型相关的线粒体基因平行或趋同变化信号,筛选ND基因中的候选适应位点,探讨随机巧合与适应性进化对趋同事件的解释力。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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Latent_infection_Based_单细胞绿藻巨型内源性病毒潜伏感染研究补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Latent infection of an active giant endogenous virus in a unicellular green alga》的补充数据,包含7个文件,涉及单细胞绿藻中巨型内源性病毒潜伏感染相关的基因组序列、蛋白质序列、模型文件及重复序列信息,支持病毒基因结构、蛋白质模型及序列特征的研究。...
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Abies_nephrolepis_Based_东北亚环状地形冷杉复合体遗传结构研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦东北亚冷杉复合体(ANSC)的遗传结构研究,包含728个个体的核基因组、线粒体及叶绿体基因组数据,以及种群结构、主成分分析、物种分布模型等结果文件,揭示其沿东北亚环状地形的遗传连接与网状进化模式。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.md 文件格式:MD 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据内容与文件结构描述...
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Becchimanzi_2025_榛子内生镰刀菌分离株基因组测序及系统发育代谢组学分析数据
数据集概述 本数据集包含Becchimanzi等人2025年手稿相关的原始数据和输出文件,核心内容为榛子内生镰刀菌分离株(Fusarium sp. Hzn5)的基因组测序数据,以及antiSMASH分析结果和系统发育重建文件,用于支持系统发育与代谢组学研究。 文件详解...
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OGRDB_Based_小鼠SJL_J品系IGKV基因胚系参考数据集_OpenAccess
数据集概述 本数据集为小鼠SJL/J品系的IGKV基因胚系参考序列集,由开放胚系受体数据库(OGRDB)发布,包含间隙型、无间隙型基因序列文件、许可证文件及元数据文件,支持免疫遗传学领域对小鼠免疫球蛋白受体基因的研究与分析。 文件详解 基因序列文件 文件名称:J IGKV_rev_1_gapped.fasta、J...
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Pichia_kudriavzevii_NCYC_4488预测蛋白与tRNA基因注释数据集
数据集概述 本数据集包含库德里亚夫采夫毕赤酵母(Pichia kudriavzevii)NCYC 4488菌株的预测蛋白编码基因、相关DNA编码序列及tRNA基因注释信息。蛋白编码基因通过Augustus v3.2.3结合酿酒酵母训练集预测,tRNA基因通过tRNAscan SE 2.0检测,共包含3个文件,为该菌株的基因功能研究提供基础数据。...
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More_intraguild_prey_Based_苹果园蛛形纲天敌食性与生物防治研究数据
数据集概述 本数据集通过肠道宏条形码技术,分析瑞典和西班牙苹果园常见蛛形纲天敌的完整食性组成,量化其捕食害虫与同类天敌( guild内捕食)的比例,评估同类相食对生物防治效果的影响,为果园天敌管理提供依据。 文件详解 文件名称:README_-_Description_of_files.docx 文件格式:DOCX...
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Panulirus_interruptus_Based_加州刺龙虾遗传分化与亲缘关系分析数据
数据集概述 本数据集围绕加州刺龙虾(Panulirus interruptus)的种群遗传分化展开研究,结合亲缘关系估计与传统F统计量,分析高基因流背景下种群遗传分化的驱动因素。数据包含采样位点GPS信息、微卫星基因型数据及CO1基因序列比对结果,用于揭示该物种在长浮游幼体期下的遗传结构特征,为理解海洋生物扩散与遗传斑块性提供支持。 文件详解...
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Centaurea_stoebe_Based欧洲多倍体矢车菊隐入侵ITS1基因分型研究数据集
数据集概述 本数据集包含178份矢车菊标本的ITS1基因分型数据,用于研究欧洲多倍体矢车菊的隐入侵现象。数据通过形态学和ITS1测序两种方式估算样本倍性,并验证两者的一致性,覆盖标本来源、采集信息及地理坐标等元数据,支持矢车菊多倍体分布与入侵机制的分析。 文件详解 Centaurea_stoebe_ITS1_script.sh 文件格式:SH...
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H5Nx_HPAI_Based_欧洲北美高致病性禽流感传播生态地理驱动因素研究数据_2022
数据集概述 本数据集为2016-2022年欧洲和北美H5Nx高致病性禽流感(HPAI)疫情空间传播的生态地理驱动因素研究数据,包含系统发育动力学模型输入文件、序列数据、树文件、统计分析文件等9个文件,支持分析病毒跨区域传播的预测因子及方向特征。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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Ara_chloropterus_Red_and_Green_Macaw_Diet_Data
数据集概述 本数据集记录阿根廷伊贝拉国家公园重引入红绿金刚鹦鹉的食性组成,通过行为观察与DNA宏条形码技术结合分析其对野生食物资源的利用情况,包含49种植物物种的食性数据,反映鹦鹉对野外环境的适应程度,为种群重建提供支撑。 文件详解 Reference_library.fasta 文件格式:FASTA...
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Hebeloma_dipterocarpohilum_Based_新种描述与系统发育分析数据
数据集概述 本数据集为描述和鉴定泰国北部新发现真菌物种Hebeloma dipterocarpohilum sp. nov.的支持数据,包含微观特征绘图、担孢子扫描电镜照片、子实体图片及基于ITS和MCM7基因的系统发育分析结果,用于区分其与相似可食用物种H. parvisporum,共含七个文件。 文件详解 微观特征数据文件(.xls格式)...
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Pescadero_Basin_Ostiactis_pearseae海葵兼性化能合成共生研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州湾佩斯adero盆地深海热泉中Ostiactis pearseae海葵与化能合成细菌的共生关系展开,包含海葵组织同位素分析、细菌群落分子数据、基因序列及采样记录,揭示刺胞动物首例兼性化能合成共生机制,涉及5个关联文件。 文件详解 文件名称:SUP05_16S_napA_aprA_copy.txt 文件格式:TXT...
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MHC_Salvelinus_fontinalis_养殖溪红点鲑种群基因多样性与免疫表达研究数据
数据集概述 本数据集围绕养殖溪红点鲑(Salvelinus fontinalis)种群的MHC基因多样性与表达展开,研究中性与选择过程对其的影响,以及人工养殖个体补充对宿主-寄生虫互作动态的干扰。包含基因序列、寄生虫感染数据、基因型数据及实验室实验数据,共6个文件,覆盖2008至2012年研究周期。 文件详解 MHC基因序列文件...
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Pocillopora_Based_Indo_Pacific珊瑚多标准物种界定研究数据_2023
数据集概述 本数据集为Indo-Pacific海域Pocillopora珊瑚的物种界定研究数据,基于基因组学、形态学、生物地理学及共生生态学多标准展开。包含356个珊瑚群体的全基因组SNP数据、微形态测量数据、共生藻关联数据等,用于解析该属珊瑚系统发育、提出物种假说并验证多证据一致性,支持珊瑚分类修订与保护。 文件详解 基因组与遗传数据...
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HCV_RecombinantGenomes_Based丙型肝炎病毒2k_1b谱系系统地理历史数据
数据集概述 本数据集包含丙型肝炎病毒(HCV)基因型1和2重组基因组相关数据,聚焦2k/1b循环重组形式(CRF)的遗传结构与系统地理历史。整合了19个国家109条序列的全编码区比对、重组断点分析结果及贝叶斯系统地理推断文件,揭示其单系起源、重组断点位置及以俄罗斯为祖先来源的传播路径,共含32个文件。 文件详解 序列比对文件(FASTA格式)...
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In_solution_Hybridization_Based_哺乳动物线粒体基因组富集探针测试数据
数据集概述 本数据集记录基于RNA探针的哺乳动物线粒体基因组溶液内富集实验结果,包含7个目哺乳动物探针集的设计与测试数据,涉及5个目22属共63个线粒体基因组的覆盖度、回收率等关键指标,以及探针捕获能力的聚类分析结果,为退化DNA的线粒体基因组富集研究提供支撑。 文件详解 序列文件...
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Linepithema_humile_Based_阿根廷蚁气味受体比较转录组与系统发育地层学研究数据
数据集概述 本数据集聚焦阿根廷蚁(Linepithema humile)气味受体(ORs)的比较转录组与系统发育地层学研究,通过分析触角、头、胸、腿等组织的转录组数据,筛选出触角富集的21个九外显子OR候选基因,结合系统发育地层学方法探究其进化特征,为揭示蚂蚁巢友识别机制提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Defensive_symbiont_Based_防御共生体基因型分布与寄生蜂攻击网络关联分析数据集
数据集概述 本数据集为R项目,包含支持论文《Defensive symbiont genotype distributions are linked to parasitoid attack...



