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OGRDB_Based_小鼠LEWES_EiJ品系IGL受体种系参考数据集_v1
数据集概述 本数据集为小鼠LEWES/EiJ品系的IGL受体种系参考集，发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）。包含带间隙、无间隙的基因序列文件、结构化数据文件及许可文件，共4个文件，支持生物信息学领域对该品系免疫球蛋白受体基因的研究。 文件详解 基因序列文件 文件名称：EiJ...
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DNA_Barcoding_加利福尼亚湾东南部鱼类卵和幼体物种多样性与繁殖季节数据
数据集概述 本数据集基于2014年墨西哥加利福尼亚湾东南部卡波普尔莫国家公园的浮游生物样本，通过DNA条形码技术对4388个鱼类卵和幼体样本进行物种鉴定，获得158个操作分类单元（OTUs），记录了物种多样性、优势物种及繁殖活动的季节性变化，补充了该区域鱼类物种分布的已知信息。 文件详解...
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Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据
数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究，包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异，分析其是否受选择驱动，以及DNA甲基化在扩张中的变化规律，为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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COI_Proton_Channel_Based蜂鸟细胞色素c氧化酶氨基酸替代研究数据
数据集概述 本数据集围绕蜂鸟线粒体编码的细胞色素c氧化酶亚基I（COI）中独特的氨基酸替代展开，包含相关物种的基因序列、进化分析文件及结构模拟支持数据，共34个文件，主要用于探究该替代对质子通道功能及蜂鸟高代谢能力的影响。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式，29个）...
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OGRDB_Based_小鼠LEWES_EiJ品系IGKV免疫球蛋白受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠LEWES/EiJ品系免疫球蛋白κ链可变区（IGKV）受体种系参考集，包含4个文件，涵盖序列数据、元信息及许可文件，为免疫遗传学研究提供标准化的种系受体序列资源。 文件详解 EiJ IGKV_rev_1.json 文件格式：JSON...
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Taming_Wild_Based_Arabidopsis非模式谱系基因库解析研究数据
数据集概述 本数据集为Arabidopsis属非模式谱系基因库解析研究的配套数据，通过ITS、微卫星、叶绿体DNA及核DNA含量等分子标记与细胞学分析，识别出A.lyrata、A.halleri、A.arenosa三大进化群及多个独立谱系，解决了属内亚种与生态型分类混乱问题，为非模式Arabidopsis谱系的进化研究提供基础框架。 文件详解...
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Jauhal_et_al_Mol_Ecol_基于须鲸与外类群的嗅觉受体基因进化评估数据
数据集概述 本数据集围绕须鲸嗅觉受体基因进化评估展开，包含从须鲸及陆生外类群物种中挖掘的嗅觉受体基因序列、系统发育树文件、分析代码及结果可视化文件，共8个文件，支持基因进化相关研究的复现与分析。 文件详解 压缩包文件...
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Russula_kashmiriana_Based_ITS和LSU序列及系统发育树数据
数据集概述 本数据集包含从巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔喜马拉雅针叶林采集的新种真菌Russula kashmiriana的分子序列数据，涉及核糖体大亚基（LSU）和内转录间隔区（ITS）序列，用于支持该物种的分类学地位确认。 文件详解 文件名称：README.docx 文件格式：docx...
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SARS_CoV_2_Early_Pandemic_儿童早期感染病毒分子多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含169条SARS-CoV-2基因组序列及补充表格，用于研究早期疫情期间儿童感染该病毒的分子多样性特征。数据集共2个文件，涵盖病毒基因组序列与研究相关的补充信息，为儿童群体SARS-CoV-2分子演化研究提供基础数据。 文件详解...
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Nupela_Based_硅藻属系统发育分析遗传数据及分类单元与GenBank来源数据
数据集概述 本数据集是硅藻属Nupela分子系统发育研究的补充材料，包含用于系统发育分析的分类单元、DNA序列数据、基因序列比对结果及最大似然树。数据支持对Nupela属新物种的描述，以及Nupela与Brachysira属亲缘关系的分析，为硅藻分类学研究提供分子数据支撑。 文件详解 SUPPLEMENT S1.docx 文件格式：DOCX...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023
数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy（碳水化合物活性酶）预测结果，涉及相关菌株（如Pcopri、Btheta、Buniformis）的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码，共47个文件，用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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Canarina_canariensis_Based_金丝桃遗传多样性与地理隔离研究数据
数据集概述 本数据集包含加那利岛特有植物金丝桃（Canarina canariensis）的遗传多样性研究数据，涉及叶绿体（cpDNA）单倍型和核基因组（AFLPs）的遗传变异分析，旨在探究火山群岛内古岛作为遗传多样性避难所和来源地的作用，揭示地理隔离与火山事件对种群遗传结构的影响。 文件详解...
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descriptor_free_Based_细菌病原体抗原发现无描述符机器学习框架数据集
数据集概述 本数据集为论文“A descriptor-free machine learning framework to improve antigen discovery for bacterial...
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Poritiinae_Based_灰蝶科Poritiinae亚科分子系统发育研究数据与脚本
数据集概述 本数据集包含灰蝶科Poritiinae亚科的分子系统发育研究数据与分析脚本，涵盖14个基因区域的218个样本（来自177个分类单元），涉及该亚科86%的属。数据支持将Poritiinae分为亚洲Poritiini族与非洲Liptenini族，并将Liptenini族重新划分为6个亚族，同时提供了祖先分布区重建等相关分析结果，包含8个文件。...
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InR_Pyrrhocoris_apterus_昆虫胰岛素受体与诱饵受体进化及功能研究数据
数据集概述 本数据集支持昆虫胰岛素受体（InRs）及其同源诱饵受体的进化研究，包含118种昆虫的InR序列系统发育分析数据，以及菩提树蝽（Pyrrhocoris apterus）3种InRs在翅多态性调控中的功能验证结果。数据涵盖基因簇演化、酪氨酸激酶结构域缺失机制及诱饵受体分布特征，助力解析昆虫胰岛素信号通路的功能可塑性。 文件详解...
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OGRDB开放的全基因组受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGLV受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c/ByJ品系的IGLV免疫球蛋白轻链可变区受体种系参考数据，发布于开放种系受体数据库（OGRDB），包含4个相关文件，覆盖序列数据、元信息及许可说明，支持免疫受体相关研究与分析。 文件详解 数据文件 文件名称：ByJ IGLV_rev_2_ungapped.fasta、ByJ...
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Terniopsis_Podostemaceae_Based分子系统发育与形态变异研究数据
数据集概述 本数据集围绕Podostemaceae科Terniopsis属展开，包含两种物种（T. chanthaburiensis和T. heterostaminata）的分子系统发育分析与形态变异对比数据，涉及柬埔寨、老挝和泰国的样本，旨在揭示该属分子与形态变异的差异模式，为物种分类提供依据。 文件详解 文件名称：Fig. 1 data.xlsx...
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Gorilla_herpes_simplexvirus_大猩猩单纯疱疹病毒系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕大猩猩单纯疱疹病毒的系统发育分析展开，包含新型疱疹病毒的基因序列、系统发育树及相关元数据文件。数据源自野生大猩猩、倭黑猩猩和黑猩猩粪便样本的大规模筛查，旨在揭示人类单纯疱疹病毒的起源及跨物种传播机制，为理解人兽共患病起源提供支持。 文件详解 基因序列文件...
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Gochnatieae_Based_菊科Gochnatieae族系统发育基因组数据_2021
数据集概述 本数据集为菊科Gochnatieae族系统发育基因组研究数据，包含用于界定该族属级分类边界、提升Moquiniastrum属物种级分辨率的系统发育基因组位点数据，以及祖先性状状态重建、祖先区域重建相关参数文件，共47个文件，支持植物分类学与进化生物学分析。 文件详解 多序列比对文件（FASTA格式）...
